SPHK2 (sphingosine kinase 2)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SPHK2
locus group:
protein-coding gene
location:
19q13.33
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
56848
ensembl gene id:
ENSG00000063176
ucsc gene id:
uc002pjr.4
refseq accession:
NM_001204158
hgnc_id:
HGNC:18859
approved reserved:
2002-07-05

基因染色体位置

基因染色体位置

19q13.33
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

This gene encodes one of two sphingosine kinase isozymes that catalyze the phosphorylation of sphingosine into sphingosine 1-phosphate. Sphingosine 1-phosphate mediates many cellular processes including migration, proliferation and apoptosis, and also plays a role in several types of cancer by promoting angiogenesis and tumorigenesis. The encoded protein may play a role in breast cancer proliferation and chemoresistance. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2011]

这个基因编码催化的鞘氨醇磷酸化成鞘氨醇1-磷酸鞘氨醇2激酶同工酶之一。鞘氨醇-1-磷酸介导许多细胞过程，包括迁移，增殖和凋亡，也起着几种类型的癌症通过促进血管发生和肿瘤发生的作用。所编码的蛋白质可能在乳腺癌细胞增殖和化疗的作用。编码多种亚型选择性剪接的转录物变体已经观察到这种基因。 [由RefSeq的，2011年8月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SPHK2基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs2301139       rs6413475       rs6413476       rs80273410       rs113160409       rs113533854       rs117309075       rs143249693       rs144333545       rs148306408       rs148363247       rs187175211       rs369164659       rs371192457       rs528577366       rs532719113       rs536595061      

基因表达

基因表达

SPHK2基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GCAGTGGTGTAAGAACCAC
59
TTCTGTCGTTCTGTCTGGA
58
GCAGTGGTGTAAGAACCAC
59
TTCTGTCGTTCTGTCTGGA
58
GCAGTGGTGTAAGAACCAC
59
TTCTGTCGTTCTGTCTGGA
58
GCAGTGGTGTAAGAACCAC
59
TTCTGTCGTTCTGTCTGGA
58
ATCTACACCTACCCTCGGG
60
ACGGTTCTCTTCGTAGGTG
59
ACCTCATCCAGACAGAACG
59
GATCTAGGAGCCCGTTCAG
59
CAGCAGGACCAGAGATCAC
60
GACCAATAGAAGCAACCGG
59
GCAGTGGTGTAAGAACCAC
59
TTCTGTCGTTCTGTCTGGA
58
AGAATTTCCTCCATAGGCAG
57
AGAGATACATCACCCAGACAC
59
GCAGTGGTGTAAGAACCAC
59
TTCTGTCGTTCTGTCTGGA
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SPHK2基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SPHK2基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016301
A0A075B7A1 (UniProtKB)
IEA
GO:0016310
A0A075B7A1 (UniProtKB)
IEA
GO:0016301
E9PCV4 (UniProtKB)
IEA
GO:0016310
E9PCV4 (UniProtKB)
IEA
GO:0016301
M0R0E9 (UniProtKB)
IEA
GO:0016310
M0R0E9 (UniProtKB)
IEA
GO:0016301
M0R344 (UniProtKB)
IEA
GO:0016310
M0R344 (UniProtKB)
IEA
GO:0001568
Q9NRA0 (UniProtKB)
IEA
GO:0003376
Q9NRA0 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q9NRA0 (UniProtKB)
IPI
GO:0005524
Q9NRA0 (UniProtKB)
IEA
GO:0005765
Q9NRA0 (UniProtKB)
IDA
GO:0005829
Q9NRA0 (UniProtKB)
IDA
GO:0005829
Q9NRA0 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q9NRA0 (UniProtKB)
TAS
GO:0006669
Q9NRA0 (UniProtKB)
NAS
GO:0007420
Q9NRA0 (UniProtKB)
IEA
GO:0007565
Q9NRA0 (UniProtKB)
IEA
GO:0008283
Q9NRA0 (UniProtKB)
NAS
GO:0008284
Q9NRA0 (UniProtKB)
IEA
GO:0008481
Q9NRA0 (UniProtKB)
NAS
GO:0008481
Q9NRA0 (UniProtKB)
TAS
GO:0016020
Q9NRA0 (UniProtKB)
IDA
GO:0017016
Q9NRA0 (UniProtKB)
NAS
GO:0017050
Q9NRA0 (UniProtKB)
TAS
GO:0030148
Q9NRA0 (UniProtKB)
TAS
GO:0038036
Q9NRA0 (UniProtKB)
IMP
GO:0043066
Q9NRA0 (UniProtKB)
NAS
GO:0046512
Q9NRA0 (UniProtKB)
IGI
GO:0046512
Q9NRA0 (UniProtKB)
IMP
GO:0046834
Q9NRA0 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SPHK2基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Infarction, Middle Cerebral Artery 0.12 1 0 CTD_human
Breast Carcinoma 0.001085767 4 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.001085767 4 0 BeFree
Glioblastoma 0.000814326 3 0 BeFree
Glioma 0.000542884 2 0 BeFree
Acute lymphocytic leukemia 0.000271442 1 0 BeFree
Astrocytoma 0.000271442 1 0 BeFree
Pulmonary Fibrosis 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of stomach 0.000271442 1 0 BeFree
Multiple Myeloma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话： 0531-88819269

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