SPEF2 (sperm flagellar 2)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SPEF2
locus group:
protein-coding gene
location:
5p13.2
gene_family:
alias symbol:
KPL2|FLJ23577|CT122
alias name:
cancer/testis antigen 122
entrez id:
79925
ensembl gene id:
ENSG00000152582
ucsc gene id:
uc003jjo.4
refseq accession:
NM_144722
hgnc_id:
HGNC:26293
approved reserved:
2007-08-20

基因染色体位置

基因染色体位置

5p13.2
基因染色体位置图

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SPEF2基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1013154       rs1013155       rs1013156       rs1389846       rs1389847       rs2172756       rs6861220       rs6872795       rs6894157       rs6895275       rs7705331       rs10805607       rs10805608       rs11740118       rs11749862       rs11953910       rs11960779      

基因表达

基因表达

SPEF2基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAGACAAGAACATGGTTGGA
58
CCAGTATGCAATTGTTGGAG
57
CAAGAGGAGATTAAAGAAAGCCAG
60
CATTAGCACCTTCTGTTTCTGG
60
GACAGCAGGGTTTCAAGTG
59
CTGATCAAACTGCACACCC
59
CAGTGAGGTTCTACCAATTCAG
58
AATACATGTTGTGGATCCTGG
58
CCTGAAGAACATCTTCACAGAG
59
ATTCTTCAGCTCAGCCCAG
60
CAAGAGGAGATTAAAGAAAGCCAG
60
CATTAGCACCTTCTGTTTCTGG
60
GCAAGAGGAGATTAAAGAAAGC
58
ATCAGCATTAGCACTAAGCA
57
GACAGCAGGGTTTCAAGTG
59
CTGATCAAACTGCACACCC
59
TCGCTGTTCTCTTGAAGCA
60
CACTACATAGATGATGTGTACAGG
59
GACAGCAGGGTTTCAAGTG
59
CTGATCAAACTGCACACCC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SPEF2基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SPEF2基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0002177
Q9C093 (UniProtKB)
IEA
GO:0002520
Q9C093 (UniProtKB)
IEA
GO:0005794
Q9C093 (UniProtKB)
IEA
GO:0007283
Q9C093 (UniProtKB)
IEA
GO:0009566
Q9C093 (UniProtKB)
IEA
GO:0010259
Q9C093 (UniProtKB)
IEA
GO:0035082
Q9C093 (UniProtKB)
IEA
GO:0048702
Q9C093 (UniProtKB)
IEA
GO:0048854
Q9C093 (UniProtKB)
IEA
GO:0060541
Q9C093 (UniProtKB)
IEA
GO:0097225
Q9C093 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SPEF2基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Multiple Sclerosis 0.122367032 1 1 GAD_GWASCAT
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD

基因相关服务

基因相关服务

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