SPDYE7P (speedy/RINGO cell cycle regulator family member E7, pseudogene)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SPDYE7P
locus group:
pseudogene
location:
7q11.23
gene_family:
Speedy/RINGO cell cycle regulator family
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
441251
ensembl gene id:
ENSG00000179994
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_003666
hgnc_id:
HGNC:35466
approved reserved:
2009-02-17

基因染色体位置

基因染色体位置

7q11.23
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

SPDYE7P（也称为SPDYE7）是一个假基因，属于SPDYE（Spermatogenesis Defective Protein Y-Encoded）基因家族。这个家族包含多个成员，主要与精子发生和男性生殖功能相关，但SPDYE7P由于缺乏功能性开放阅读框（ORF），通常不编码蛋白质，而是作为非编码RNA或基因组中的进化遗迹存在。SPDYE基因家族的共性包括在Y染色体上的富集、与精子发生过程的潜在关联以及在进化过程中可能经历复制和假基因化。SPDYE7P的具体生物学功能尚不明确，但假基因通常可能通过调控邻近基因的表达或作为竞争性内源RNA（ceRNA）影响其他基因的功能。由于它是假基因，突变通常不会直接影响机体功能，但可能通过影响基因组稳定性或邻近基因的调控区域间接发挥作用。目前尚未发现SPDYE7P与特定疾病的直接关联，但假基因的异常表达或突变有时可能与癌症或其他遗传疾病相关。如果SPDYE7P过表达或降低表达，可能通过竞争性结合miRNA或其他调控分子影响相关通路，例如干扰精子发生或细胞周期调控基因的表达。由于假基因的功能研究较少，其具体影响仍需进一步探索。SPDYE7P的存在可能反映了基因家族的进化历史，为研究Y染色体基因的复制和功能退化提供了线索。

None

无

OMIM数据库中对SPDYE7P基因的介绍     Wikipedia数据库中对SPDYE7P基因的介绍

基因序列

基因序列

SPDYE7P基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SPDYE7P基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs390732       rs1061087       rs3873461       rs3873463       rs3960655       rs3960656       rs3973837       rs4098889       rs4717700       rs28493684       rs28535322       rs34052301       rs58909282       rs73358376       rs73358381       rs77790539       rs79877685      

基因表达

基因表达

SPDYE7P基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTGTCGGACAAGTATCTCCT
59
AATGCATTGGTATTGCCAGG
59
CTTCGGTTCCAGTTCTTCTG
59
GTCATAAGCCTGGATCTCCT
59
GTGTCGGACAAGTATCTCCT
59
AATGCATTGGTATTGCCAGG
59
GAGTTGGAGGAGATCCAGG
59
CCTGGAGCTCTAGGAAAGG
59
TGTCGGACAAGTATCTCCT
57
GAATGCATTGGTATTGCCAG
58
TGTCGGACAAGTATCTCCT
57
GAATGCATTGGTATTGCCAG
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SPDYE7P基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SPDYE7P基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0019901
Q495Y7 (UniProtKB)
IBA
GO:0045859
Q495Y7 (UniProtKB)
IBA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SPDYE7P基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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