SPDYC (speedy/RINGO cell cycle regulator family member C)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SPDYC
locus group:
protein-coding gene
location:
11q13.1
gene_family:
Speedy/RINGO cell cycle regulator family
alias symbol:
Ringo2
alias name:
None
entrez id:
387778
ensembl gene id:
ENSG00000204710
ucsc gene id:
uc010rnz.3
refseq accession:
NM_001008778
hgnc_id:
HGNC:32681
approved reserved:
2006-03-31

基因染色体位置

基因染色体位置

11q13.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

SPDYC（Spermatogenesis Defective Protein Y-Linked C）是一种位于Y染色体上的基因，主要与精子发生（spermatogenesis）相关。其表达产物在睾丸中高度富集，参与调控精原细胞的分化和减数分裂过程，对男性生殖功能至关重要。SPDYC蛋白可能通过与其他蛋白质相互作用，影响细胞周期调控或染色质重塑，从而确保精子形成的正常进行。该基因的突变可能导致精子发生障碍，表现为少精症或无精症，甚至引发男性不育。此外，SPDYC的异常表达可能与某些睾丸肿瘤的发生相关，但其具体机制仍需进一步研究。若SPDYC过表达，可能干扰精原细胞的正常分化，导致生精上皮紊乱；而表达降低则可能直接阻碍减数分裂，使精子数量或质量下降。SPDYC属于Y染色体上的睾丸特异性基因家族，这类基因通常仅在男性生殖系统中表达，且多与精子发生、性腺发育或雄性性别决定相关。该家族的共性包括在进化中相对快速的分化、功能的高度特异性以及与男性生育力的紧密关联。目前对SPDYC的研究仍有限，但其作为Y染色体特有基因，可能成为男性不育诊断或治疗的潜在靶点。

None

无

OMIM数据库中对SPDYC基因的介绍     Wikipedia数据库中对SPDYC基因的介绍

基因序列

基因序列

SPDYC基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SPDYC基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1195958       rs1195959       rs1195960       rs6591177       rs7124215       rs7128165       rs7926131       rs12271615       rs12292693       rs17743381       rs71468694       rs72932893       rs73480914       rs73480916       rs75945954       rs76518575       rs78821014      

基因表达

基因表达

SPDYC基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CCAGATTTCAGATAAGTATCTCCTG
58
TGTGGGTATACTCGCTGAG
58
CAGATTTCAGATAAGTATCTCCTGG
58
TGTGGGTATACTCGCTGAG
58
GATTTCAGATAAGTATCTCCTGGC
59
CTGTGGGTATACTCGCTGAG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SPDYC基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SPDYC基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005634
Q5MJ68 (UniProtKB)
ISS
GO:0005737
Q5MJ68 (UniProtKB)
IEA
GO:0007049
Q5MJ68 (UniProtKB)
IEA
GO:0019901
Q5MJ68 (UniProtKB)
IPI
GO:0019901
Q5MJ68 (UniProtKB)
IPI
GO:0019901
Q5MJ68 (UniProtKB)
IPI

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SPDYC基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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