SPATA2 (spermatogenesis associated 2)

symbol:
SPATA2
locus group:
protein-coding gene
location:
20q13.13
gene_family:
Protein phosphatase 1 regulatory subunits
alias symbol:
KIAA0757|PD1|tamo|PPP1R145
alias name:
protein phosphatase 1, regulatory …
entrez id:
9825
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ENSG00000158480
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uc002xuw.5
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NM_006038
hgnc_id:
HGNC:14681
approved reserved:
2001-03-15
20q13.13
基因染色体位置图

SPATA2(Spermatogenesis Associated 2)是一种与精子发生相关的基因,属于SPATA基因家族。该家族成员通常参与生殖系统发育和功能调控,尤其在睾丸组织中高表达。SPATA2编码的蛋白质主要定位于细胞质和细胞核,其生物学功能涉及细胞凋亡调控、炎症信号通路(如NF-κB通路)的调节以及泛素-蛋白酶体系统(一种负责降解受损或多余蛋白质的细胞机制)的相互作用。SPATA2通过与CYLD(一种去泛素化酶)和HOIP(线性泛素链组装复合物组分)结合,参与调控免疫和炎症反应。该基因的突变可能导致其功能异常,与男性不育、炎症性疾病(如银屑病)和某些癌症(如前列腺癌)的发生发展相关。SPATA2过表达可能增强NF-κB信号通路的抑制,从而减轻炎症反应,但可能干扰正常的细胞凋亡过程;而表达降低可能导致炎症反应失控或精子发生障碍。SPATA基因家族的共性在于多数成员含有保守的功能域(如coiled-coil结构域),并在生殖系统中发挥重要作用,部分成员还参与细胞周期调控和DNA损伤修复。目前研究显示SPATA2在免疫微环境调控中具有双重作用,其表达水平的变化可能通过影响泛素化修饰(一种调控蛋白质稳定性和功能的化学修饰)来改变多种信号通路的活性。

None

SPATA2基因的碱基序列:[NCBI]
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SPATA2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1008687       rs3761175       rs3787330       rs3787331       rs3819809       rs4809762       rs6067269       rs6122841       rs8115603       rs11904962       rs13433092       rs56327845       rs58050249       rs58342189       rs59922432       rs60871620       rs71190505      

SPATA2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AAGCATCAAGACCTACACG
58
TCTGAGCTTGTATGCAGTG
58
AAGCATCAAGACCTACACG
58
TCTGAGCTTGTATGCAGTG
58
AGCATCAAGACCTACACGG
60
CTCTGAGCTTGTATGCAGTG
59
AGCATCAAGACCTACACGG
60
CTCTGAGCTTGTATGCAGTG
59
AGCATCAAGACCTACACGG
60
CTGAGCTTGTATGCAGTGC
59
AGCATCAAGACCTACACGG
60
CTGAGCTTGTATGCAGTGC
59
      尚未收录相关数据

SPATA2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SPATA2基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003674
Q9UM82 (UniProtKB)
ND
GO:0005515
Q9UM82 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UM82 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UM82 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UM82 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q9UM82 (UniProtKB)
IDA
GO:0005730
Q9UM82 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q9UM82 (UniProtKB)
IDA
GO:0007275
Q9UM82 (UniProtKB)
IEA
GO:0007283
Q9UM82 (UniProtKB)
NAS
GO:0030154
Q9UM82 (UniProtKB)
IEA

可能调控 SPATA2基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Psoriasis 0.125005506 4 1 BeFree_GAD_GWASCAT
Lupus Erythematosus, Systemic 0.001085767 4 0 BeFree
Diabetes Mellitus, Insulin-Dependent 0.000814326 3 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000542884 2 0 BeFree
Subacute Sclerosing Panencephalitis 0.000542884 2 0 BeFree
melanoma 0.000542884 2 0 BeFree
Carcinoma, Small Cell 0.000271442 1 0 BeFree
Virus Diseases 0.000271442 1 0 BeFree
Leukemia, T-Cell 0.000271442 1 0 BeFree

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