SPANXN4 (SPANX family member N4)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SPANXN4
locus group:
protein-coding gene
location:
Xq27.3
gene_family:
alias symbol:
SPANX-N4|CT11.9
alias name:
cancer/testis antigen family 11, m…
entrez id:
441525
ensembl gene id:
ENSG00000189326
ucsc gene id:
uc004fbv.4
refseq accession:
NM_001009613
hgnc_id:
HGNC:33177
approved reserved:
2006-11-13

基因染色体位置

基因染色体位置

Xq27.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

This gene represents one of several duplicated family members that are located on the X chromosome. This gene family encodes proteins that play a role in spermiogenesis. These proteins represent a specific subgroup of cancer/testis-associated antigens, and they may be candidates for tumor vaccines. This family member belongs to a subgroup of related genes that are present in all primates and rats and mice, and thus, it represents one of the ancestral family members. [provided by RefSeq, Sep 2009]

这个基因代表，它们位于X染色体上的几个重复家族成员之一。该基因家族编码，在精子形成中发挥作用的蛋白质。这些蛋白质代表癌症/睾丸相关抗原的特定子群，并且它们可以是对于肿瘤疫苗的候选者。氏家族成员所属的存在于所有灵长类和大鼠和小鼠相关基因的亚组，并且因此，它代表祖家族成员之一。 [由RefSeq的，2009年09月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SPANXN4基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs781715498       rs781659042       rs781621907       rs781499272       rs781410886       rs781212260       rs781029116       rs780976328       rs780599201       rs780580943       rs780491515       rs780264921       rs780369330       rs780260740       rs779534101       rs779522534       rs779453405      

基因表达

基因表达

SPANXN4基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGGAAGAGCCAACTTCCAG
60
TCTCTTTCAAACTCTGTTCAGG
58
TGGAGAATAACCAGCCTACAG
59
CTTCCTCTCCATCCTGTGG
59
TGGAAGAGCCAACTTCCAG
60
CTCTTTCAAACTCTGTTCAGGG
59
GGAGAATAACCAGCCTACAG
58
TCTTCCTCTCCATCCTGTG
58
TGGAAGAGCCAACTTCCAG
60
TCTTTCAAACTCTGTTCAGGG
58
GAGAATAACCAGCCTACAGAG
58
TCTTCCTCTCCATCCTGTG
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SPANXN4基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SPANXN4基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SPANXN4基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Systemic arterial pressure 0.002367032 1 1 GAD
Blood pressure finding 0.002367032 1 1 GAD

基因相关服务

基因相关服务

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