SPAG9 (sperm associated antigen 9)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SPAG9
locus group:
protein-coding gene
location:
17q21.33
gene_family:
alias symbol:
HSS|SYD1|KIAA0516|MGC14967|MGC74461|MGC117291|JLP|PHET|HLC4|FLJ13450|FLJ14006|FLJ26141|FLJ34602|CT89|JIP4|JIP-4|PIG6
alias name:
sperm surface protein|JNK/SAPK-ass…
entrez id:
9043
ensembl gene id:
ENSG00000008294
ucsc gene id:
uc002itb.4
refseq accession:
NM_003971
hgnc_id:
HGNC:14524
approved reserved:
2001-02-09

基因染色体位置

基因染色体位置

17q21.33
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

This gene encodes a member of the cancer testis antigen gene family. The encoded protein functions as a scaffold protein that structurally organizes mitogen-activated protein kinases and mediates c-Jun-terminal kinase signaling. This protein also binds to kinesin-1 and may be involved in microtubule-based membrane transport. This protein may play a role in tumor growth and development. Alternate splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Oct 2011]

该基因编码的癌睾丸抗原基因家族的一个成员。所编码的蛋白质的功能作为结构组织促分裂原活化蛋白激酶和介导的c-Jun氨基末端激酶信号传导的支架蛋白。该蛋白质也结合到驱动蛋白1和可能参与基于微管膜运输。这种蛋白可能参与肿瘤的生长和发展中的作用。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的，2011年10月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SPAG9基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs2041319       rs2058254       rs7213491       rs7215739       rs7222001       rs7223642       rs7224682       rs7226095       rs8069169       rs8070998       rs8072170       rs8075136       rs8080302       rs8081821       rs9303570       rs9303571       rs9675200      

基因表达

基因表达

SPAG9基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TATAAAGGTTCAAGCACTCCC
57
CTGAAGACAGTTCTTCAAAGAG
57
TGGATAAACCACCAGAAATGG
58
TAGCTTCAGTTGCTTCTTCTG
58
GGATACAGAAGGCAGTAAACAG
58
TTCTGCTGTTCCTTAAGTTCCT
59
CAAAGGCATAGAGAACAAAGC
57
CGACCCATTCCTAGTAAATCTG
58
GATGACGATGATAGTGATATTCCC
58
TTTCGCTCCATGAGAACAC
58
GAGCATGTCTTTACAGATCCT
57
ATCTGAGTCATTGCTCGAC
57
CACTCAGATGCCTCATTATGG
58
CGAGTAGCTGGGACTACAG
59
GACATTGAGCCTTATGTAAGCA
58
CACCATAAGAGCTGTAATTCTCAC
59
TAGGCTGGTCTCAAACTCC
58
TAATTCAAGCACTTCGGGAG
58
TGCTCAGAAAGGAGGAGAG
58
CTATTGCTGACCTTCAGGC
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SPAG9基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SPAG9基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
D6RHI8 (UniProtKB)
IEA
GO:0001669
O60271 (UniProtKB)
IEA
GO:0005078
O60271 (UniProtKB)
IBA
GO:0005515
O60271 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O60271 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O60271 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O60271 (UniProtKB)
IPI
GO:0005737
O60271 (UniProtKB)
IBA
GO:0005737
O60271 (UniProtKB)
IDA
GO:0005815
O60271 (UniProtKB)
IDA
GO:0005829
O60271 (UniProtKB)
TAS
GO:0007257
O60271 (UniProtKB)
IBA
GO:0007283
O60271 (UniProtKB)
TAS
GO:0008432
O60271 (UniProtKB)
IBA
GO:0016021
O60271 (UniProtKB)
TAS
GO:0019894
O60271 (UniProtKB)
IBA
GO:0030159
O60271 (UniProtKB)
IBA
GO:0030335
O60271 (UniProtKB)
IMP
GO:0042147
O60271 (UniProtKB)
IDA
GO:0045666
O60271 (UniProtKB)
IEA
GO:0048273
O60271 (UniProtKB)
IEA
GO:0048471
O60271 (UniProtKB)
IEA
GO:0051146
O60271 (UniProtKB)
IEA
GO:0051149
O60271 (UniProtKB)
TAS
GO:0051260
O60271 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
O60271 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
O60271 (UniProtKB)
IDA
GO:0090074
O60271 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SPAG9基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Renal Cell Carcinoma 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Systemic Scleroderma 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Carcinogenesis 0.001357209 5 0 BeFree
Prostate carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of testis 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of prostate 0.000542884 2 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000542884 2 0 BeFree
Astrocytoma 0.000542884 2 0 BeFree
leukemia 0.000271442 1 0 BeFree
Colorectal Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话： 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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