SPACA3 (sperm acrosome associated 3)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SPACA3
locus group:
protein-coding gene
location:
17q11.2
gene_family:
alias symbol:
ALLP17|SLLP1|LYC3|LYZL3|CT54
alias name:
cancer/testis antigen 54|sperm lyz…
entrez id:
124912
ensembl gene id:
ENSG00000141316
ucsc gene id:
uc002hhs.2
refseq accession:
NM_173847
hgnc_id:
HGNC:16260
approved reserved:
2001-07-20

基因染色体位置

基因染色体位置

17q11.2
基因染色体位置图

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SPACA3基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs28904       rs28905       rs28906       rs28907       rs28908       rs28955       rs28956       rs28957       rs28958       rs28959       rs28960       rs28961       rs28962       rs28963       rs28964       rs28965       rs28966      

基因表达

基因表达

SPACA3基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CATTGTCACCATGGTCTCAG
58
CTGAGCTTTGGGATGACAG
58
ATCTTCCAGATCAACAGCC
57
GGATTCAACAAATCTGAGCAG
57
ATTGTCACCATGGTCTCAG
57
CTGAGCTTTGGGATGACAG
58
ACTGCTCAGATTTGTTGAATCC
59
CAGTAACCCAGACCCTGAG
59
CTGCTCAGATTTGTTGAATCCT
59
CAGTAACCCAGACCCTGAG
59
CATTGTCACCATGGTCTCAG
58
TGAGCTTTGGGATGACAGG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SPACA3基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SPACA3基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003796
E9PF91 (UniProtKB)
IEA
GO:0009566
E9PF91 (UniProtKB)
IEA
GO:0002080
Q8IXA5 (UniProtKB)
IEA
GO:0003796
Q8IXA5 (UniProtKB)
IDA
GO:0005515
Q8IXA5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005576
Q8IXA5 (UniProtKB)
TAS
GO:0005764
Q8IXA5 (UniProtKB)
IDA
GO:0009253
Q8IXA5 (UniProtKB)
TAS
GO:0009615
Q8IXA5 (UniProtKB)
TAS
GO:0016021
Q8IXA5 (UniProtKB)
IEA
GO:0016998
Q8IXA5 (UniProtKB)
TAS
GO:0030141
Q8IXA5 (UniProtKB)
IDA
GO:0035036
Q8IXA5 (UniProtKB)
IEA
GO:0042117
Q8IXA5 (UniProtKB)
TAS
GO:0043032
Q8IXA5 (UniProtKB)
TAS
GO:0050766
Q8IXA5 (UniProtKB)
TAS
GO:0050830
Q8IXA5 (UniProtKB)
TAS

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SPACA3基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant neoplasm of testis 0.000271442 1 0 BeFree
Hematologic Neoplasms 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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