SP140 (SP140 nuclear body protein)

symbol:
SP140
locus group:
protein-coding gene
location:
2q37.1
gene_family:
PHD finger proteins
alias symbol:
LYSP100-B|LYSP100-A
alias name:
None
entrez id:
11262
ensembl gene id:
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uc002vql.4
refseq accession:
NM_007237
hgnc_id:
HGNC:17133
approved reserved:
2001-11-07
2q37.1
基因染色体位置图

SP140(Speckled Protein 140)是一种主要在免疫细胞(如B细胞、巨噬细胞和树突状细胞)中表达的核蛋白,属于SP100/SP140基因家族。该家族成员通常含有多个功能域,如SAND结构域(参与DNA结合)、PHD锌指结构域(与染色质修饰相关)和溴结构域(识别乙酰化组蛋白),共同参与表观遗传调控和先天免疫反应。SP140通过调控染色质结构和基因转录,在免疫系统功能中起关键作用,例如促进干扰素信号通路和炎症因子的表达。其突变或功能异常与多种自身免疫性疾病相关,如原发性胆汁性胆管炎(PBC)、克罗恩病和多发性硬化症。研究发现,SP140缺失会导致免疫细胞功能紊乱,如B细胞过度活化或巨噬细胞杀菌能力下降,从而加剧炎症反应。相反,SP140过表达可能抑制促炎基因,减轻自身免疫症状,但也可能干扰正常的免疫监视功能。该基因的某些突变(如错义突变)可能破坏其与染色质的结合能力,导致靶基因(如干扰素刺激基因ISGs)表达失调。SP100/SP140家族成员的共性是参与抗病毒防御和维持基因组稳定性,部分成员还能形成核斑点(nuclear speckles)结构。目前针对SP140的研究集中在开发调节其表达的小分子药物,以治疗自身免疫病或慢性感染。需要注意的是,"核斑点"(nuclear speckles)在早期文献中可能被不统一地译为"核散斑"或"核点状结构"。

None

SP140基因的碱基序列:[NCBI]
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SP140基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs9061       rs1047254       rs1063154       rs1129411       rs1129425       rs1346311       rs1365776       rs1427293       rs1427294       rs1427295       rs1896260       rs1966555       rs2114592       rs2303540       rs3769837       rs3769838       rs3769839      

SP140基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAGAGTGTGAAGTAAATGGTCTC
59
TTCCGGGATCTTCAACCTG
59
AATCCCTGAAGGATGGTCG
59
ATTGCACTTGCAATCTCCAC
60
TCTCAACTTCAGGATGGTCG
60
ATTGCACTTGCAATCTCCAC
60
CAGGATGAAGGAGTCTCCG
59
ACTCACATTTCAACTGTTCCTC
59
CGAGATTTACAGAAGCTTCCA
58
CAAGTTGACACAGGACTGC
59
TTCCTTTCCTTATGGGCCT
58
AAATGTTCATACATCTGCTCGG
59
GTTAGCTCTCCCAAAGGCT
59
CGTTGCTTTCTAGAACTCCC
59
TCTCAACTTCAGGATGGTCG
60
ATTGCACTTGCAATCTCCAC
60
TCTCAACTTCAGGATGGTCG
60
ATTGCACTTGCAATCTCCAC
60
TCTCAACTTCAGGATGGTCG
59
ATTGCACTTGCAATCTCCAC
59
      尚未收录相关数据

SP140基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SP140基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003677
Q13342 (UniProtKB)
IEA
GO:0003700
Q13342 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
Q13342 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q13342 (UniProtKB)
TAS
GO:0005635
Q13342 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q13342 (UniProtKB)
TAS
GO:0005730
Q13342 (UniProtKB)
IDA
GO:0005739
Q13342 (UniProtKB)
IDA
GO:0006355
Q13342 (UniProtKB)
IEA
GO:0006952
Q13342 (UniProtKB)
TAS
GO:0008270
Q13342 (UniProtKB)
IEA
GO:0016605
Q13342 (UniProtKB)
IEA

可能调控 SP140基因的相关microRNA:     

MINT

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Chronic Lymphocytic Leukemia 0.248186863 8 6 BeFree_CTD_human_GAD_GWASCAT
Multiple Sclerosis 0.122367032 1 1 GAD_GWASCAT
Crohn Disease 0.122367032 2 2 GAD_GWASCAT
Infection 0.00272435 1 0 LHGDN
Virus Diseases 0.000271442 1 0 BeFree
Acute Promyelocytic Leukemia 0.000271442 1 0 BeFree
Mucocutaneous Lymph Node Syndrome 0.000271442 1 0 BeFree
Primary biliary cirrhosis 0.000271442 1 0 BeFree

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