SNX7 (sorting nexin 7)

symbol:
SNX7
locus group:
protein-coding gene
location:
1p21.3
gene_family:
Sorting nexins
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
51375
ensembl gene id:
ENSG00000162627
ucsc gene id:
uc010ouc.3
refseq accession:
NM_001364903
hgnc_id:
HGNC:14971
approved reserved:
2001-04-10
1p21.3
基因染色体位置图

SNX7(Sorting Nexin 7)属于分选连接蛋白家族(Sorting Nexin family,SNXs家族),该家族成员均含有PX(Phox homology)结构域,负责结合磷脂酰肌醇(一种细胞膜脂质),参与细胞内囊泡运输和蛋白质分选过程。SNX7的生物学功能主要与内体(endosome)膜动力学相关,它通过调控内体到高尔基体或溶酶体的物质转运,影响细胞信号传导、受体降解及营养摄取等。其表达产物(蛋白质)通常与其他SNX成员(如SNX1/2)形成复合物,共同参与膜变形和 cargo(运输货物)分选。该基因的作用位点集中在早期内体(early endosome)和晚期内体(late endosome),通过PX结构域锚定膜磷脂PtdIns3P(磷脂酰肌醇-3-磷酸),而C端的BAR(Bin/Amphiphysin/Rvs)结构域则介导膜曲率感知和重塑。SNX7突变可能导致内体运输障碍,例如影响EGFR(表皮生长因子受体)等受体的循环或降解,进而干扰细胞增殖或代谢。研究发现,SNX7缺失可能加剧神经退行性疾病(如阿尔茨海默病)中β-淀粉样蛋白的积累,因其参与APP(淀粉样前体蛋白)的转运调控。若SNX7过表达,可能扰乱内体稳态,导致溶酶体功能异常或自噬缺陷;而低表达则可能削弱受体回收效率,影响胰岛素信号通路等代谢过程。SNX基因家族的共性包括:依赖PX结构域靶向特定膜区室,多数成员具有BAR或其它蛋白相互作用域(如SH3),共同协调膜运输、细胞迁移和免疫应答。目前SNX7在癌症中的角色尚不明确,但部分SNXs成员(如SNX10)与肿瘤转移相关,提示其潜在调控价值。术语注释:内体(endosome)是细胞内负责分选物质的膜结构;BAR结构域可感知膜弯曲;PtdIns3P是一种调控膜身份的磷脂信号分子。

This gene encodes a member of the sorting nexin family. Members of this family contain a phox (PX) domain, which is a phosphoinositide binding domain, and are involved in intracellular trafficking. This protein does not contain a coiled coil region like some family members, and its exact function is unknown. Alternative splicing results in multiple transcript variants. A related pseudogene has been identified on chromosome 11. [provided by RefSeq, Jun 2010]

该基因编码分拣连接蛋白家族的一个成员。这个家族的成员包含PHOX(PX)域,这是一个磷酸肌醇结合域,并参与胞内运输。该蛋白质不包含像一些家族成员一个卷曲螺旋区域,和它的确切功能尚不清楚。选择性剪接结果在多个抄本变形。一个相关的假基因已被确定在[由RefSeq的,2010年6月提供] 11号染色体

SNX7基因的碱基序列:[NCBI]
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SNX7基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs4545356       rs9725740       rs9725808       rs9727115       rs9728993       rs10783100       rs12036227       rs12078775       rs12083471       rs35313563       rs56790901       rs57449152       rs60707709       rs74755619       rs76331583       rs77121905       rs80273083      

SNX7基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GGGAGGTTGAATGTCACTC
57
TGATCTGAACTCAGGTCTTCTC
59
CTTCATCACAGTTGATGAACCT
58
CCACGAGATGTCTTAGTAATAATCC
59
AGGGAGGTTGAATGTCACTC
59
GATCTGAACTCAGGTCTTCTC
57
TTCATCACAGTTGATGAACCTG
59
CCACGAGATGTCTTAGTAATAATCC
59
GGGAGGTTGAATGTCACTC
57
GATCTGAACTCAGGTCTTCTC
57
TCATCACAGTTGATGAACCTG
58
CCACGAGATGTCTTAGTAATAATCC
59
      尚未收录相关数据

SNX7基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SNX7基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0035091
B7ZC83 (UniProtKB)
IEA
GO:0035091
E9PNL2 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q9UNH6 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UNH6 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UNH6 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UNH6 (UniProtKB)
IPI
GO:0005768
Q9UNH6 (UniProtKB)
IBA
GO:0006897
Q9UNH6 (UniProtKB)
IBA
GO:0015031
Q9UNH6 (UniProtKB)
IEA
GO:0016050
Q9UNH6 (UniProtKB)
IBA
GO:0019898
Q9UNH6 (UniProtKB)
IBA
GO:0030659
Q9UNH6 (UniProtKB)
IEA
GO:0035091
Q9UNH6 (UniProtKB)
IBA

可能调控 SNX7基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Diabetes Mellitus, Non-Insulin-Dependent 0.002367032 1 1 GAD
Inflammatory Bowel Diseases 0.002367032 1 1 GAD

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