SNTG2 (syntrophin gamma 2)

symbol:
SNTG2
locus group:
protein-coding gene
location:
2p25.3
gene_family:
alias symbol:
SYN5|G2SYN
alias name:
None
entrez id:
54221
ensembl gene id:
ENSG00000172554
ucsc gene id:
uc002qwq.4
refseq accession:
NM_018968
hgnc_id:
HGNC:13741
approved reserved:
2000-10-20
2p25.3
基因染色体位置图

SNTG2(Syntrophin Gamma 2)属于syntrophin基因家族,该家族成员(如SNTG1、SNTG2、SNTB1等)均编码含有PDZ结构域(一种介导蛋白质相互作用的模块)的支架蛋白,主要功能是将膜蛋白(如离子通道、受体)与细胞骨架或信号分子锚定在一起,维持细胞结构和信号传导。SNTG2在神经组织中高表达,尤其富集于突触后膜,通过与神经元一氧化氮合酶(nNOS)、电压门控钠通道(Nav1.5)等相互作用,参与神经兴奋性调节和突触可塑性。其突变可能导致PDZ结构域功能受损,影响蛋白复合物组装,例如与Nav1.5结合异常会扰乱心脏电信号传导(与心律失常相关),或干扰nNOS定位导致神经功能障碍。过表达SNTG2可能破坏蛋白相互作用的平衡,引发异常信号激活(如过度一氧化氮产生导致神经毒性),而表达降低则可能减弱突触稳定性,影响学习记忆。该基因与Brugada综合征(一种遗传性心脏病)和精神分裂症存在关联,前者源于其与钠通道的相互作用缺陷,后者可能与突触信号紊乱有关。syntrophin家族的共性是通过PDZ结构域介导多种蛋白的时空组织,从而调控细胞膜局部的信号微环境。

This gene encodes a protein belonging to the syntrophin family. Syntrophins are cytoplasmic peripheral membrane proteins that bind to components of mechanosenstive sodium channels and the extreme carboxy-terminal domain of dystrophin and dystrophin-related proteins. The PDZ domain of this protein product interacts with a protein component of a mechanosensitive sodium channel that affects channel gating. Absence or reduction of this protein product has been associated with Duchenne muscular dystrophy. There is evidence of alternative splicing yet the full-length nature of these variants has not been described. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码属于syntrophin家庭的蛋白质。 Syntrophins是结合mechanosenstive钠通道和抗肌萎缩和肌营养不良相关蛋白的极端羧基端结构域的组分的胞质外周膜蛋白。这种蛋白质产物的PDZ结构域与该影响通道门控一个机械敏感钠通道的蛋白质组分相互作用。缺乏或减少该蛋白质产物已用杜氏肌营养不良症相关联。有但这些变体的全长性质尚未描述选择性剪接的证据。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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SNTG2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs4296458       rs4315564       rs4484061       rs4971332       rs6704869       rs6708384       rs6708651       rs6711878       rs6720676       rs6720697       rs6757423       rs6759670       rs7559853       rs7570571       rs7575866       rs7576093       rs10171795      

SNTG2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTCAGAACATGAAGATGGCG
59
TGGAGTTTCTCATTTACCCAC
58
ACTGTTACACTCCGCAGAC
60
AGACTCCATCTGCTTGGTC
59
AAAGAGGTGCTGACAATTCAG
58
GTGTAACAGTTCTGCGATTCC
59
CCTTCACATTCACTCACTCCT
60
AGGTGAGTGCCATGAATAGAG
60
GCTGTTCTCCAGGTTAATGG
58
CATCGCCAGCATTTCTCAG
59
ACTGTTACACTCCGCAGAC
60
AGACTCCATCTGCTTGGTC
59
CAGTTTGTGCACTGAGACG
60
AACTCGAGTTCCAAATGTCCT
60
GAGGACGATATCAGGATGGA
58
CCTACGAACAACATCCCTG
58
TTTCTGAAGCTCCCGTTAGG
59
AATAAGGTGAGTGCTGTGGT
59
AATATTCGAAGACCAAGCAGC
59
ACATGTATGCCATTAACCTGG
59
      尚未收录相关数据

SNTG2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SNTG2基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005198
A0A0G2JR78 (UniProtKB)
IEA
GO:0005198
A0A0G2JS85 (UniProtKB)
IEA
GO:0005198
F2Z2D2 (UniProtKB)
IEA
GO:0003779
Q9NY99 (UniProtKB)
IEA
GO:0005198
Q9NY99 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
Q9NY99 (UniProtKB)
IEA
GO:0005856
Q9NY99 (UniProtKB)
IEA
GO:0007417
Q9NY99 (UniProtKB)
TAS
GO:0016013
Q9NY99 (UniProtKB)
TAS
GO:0030165
Q9NY99 (UniProtKB)
IPI
GO:0030165
Q9NY99 (UniProtKB)
IPI
GO:0030165
Q9NY99 (UniProtKB)
IPI
GO:0042383
Q9NY99 (UniProtKB)
IEA
GO:0097109
Q9NY99 (UniProtKB)
IPI
GO:0097109
Q9NY99 (UniProtKB)
IPI
GO:0097109
Q9NY99 (UniProtKB)
IPI

可能调控 SNTG2基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Autistic Disorder 0.120271442 1 0 BeFree_CTD_human
Child Development Disorders, Pervasive 0.12 1 0 CTD_human

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

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