SNORD4A (small nucleolar RNA, C/D box 4A)

symbol:
SNORD4A
locus group:
non-coding RNA
location:
17q11
gene_family:
Small nucleolar RNAs, C/D box
alias symbol:
Z17A|mgh18S-121
alias name:
None
entrez id:
26773
ensembl gene id:
ENSG00000238578
ucsc gene id:
uc002hcl.2
refseq accession:
NR_000010
hgnc_id:
HGNC:10097
approved reserved:
1999-12-14
17q11
基因染色体位置图

SNORD4A(Small Nucleolar RNA, C/D Box 4A)属于小核仁RNA(snoRNA)家族中的C/D box snoRNA亚类,这类RNA主要参与核糖体RNA(rRNA)的甲基化修饰,从而影响核糖体的生物合成和功能。SNORD4A通过碱基配对识别特定的rRNA序列,并引导甲基转移酶在目标位点(如28S rRNA的特定核苷酸)上添加甲基基团,这种修饰对维持rRNA的稳定性和蛋白质翻译的准确性至关重要。C/D box snoRNA家族的共性包括保守的C(RUGAUGA)和D(CUGA)序列 motif(模体),以及形成茎环结构以结合核心蛋白(如fibrillarin),共同组成snoRNP复合物发挥作用。SNORD4A的突变或缺失可能导致rRNA甲基化异常,进而影响核糖体组装或翻译效率,但具体病理机制尚不明确,目前未直接关联特定疾病。研究表明,某些snoRNA的异常表达可能与癌症(如乳腺癌或肝癌)相关,但SNORD4A在此方面的作用仍需进一步验证。若SNORD4A过表达,可能干扰其他snoRNA的平衡,导致rRNA过度甲基化或非特异性修饰;而低表达则可能降低目标rRNA的甲基化水平,均可能影响细胞增殖或应激响应。需要注意的是,snoRNA通常以宿主基因的内含子形式存在(如SNORD4A位于RPL7A基因的内含子中),其表达可能受宿主基因调控。由于snoRNA功能高度依赖序列特异性,其突变可能仅影响特定rRNA位点的修饰,而非全局性效应。目前对SNORD4A的研究相对有限,其更广泛的生物学意义和疾病关联仍需探索。

None

SNORD4A基因的碱基序列:[NCBI]
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SNORD4A基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs7216105       rs34088896       rs35294267       rs61732773       rs61738395       rs74993157       rs75185732       rs75525376       rs77615564       rs77906155       rs78771668       rs112332513       rs114554279       rs114790825       rs116545026       rs116695640       rs117326562      

SNORD4A基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATGATGACACTGTAAAGCGAC
59
CATCAGACAACGAGGTACCA
60
GATGATGACACTGTAAAGCGAC
60
ATCAGACAACGAGGTACCA
58
GATGATGACACTGTAAAGCGA
59
ATCAGACAACGAGGTACCA
58
      尚未收录相关数据

SNORD4A基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SNORD4A基因的本体(GO)信息:

可能调控 SNORD4A基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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