SNORD13P3 (small nucleolar RNA, C/D box 13 pseudogene 3)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SNORD13P3
locus group:
pseudogene
location:
3p21.31
gene_family:
alias symbol:
U13|U13.4B
alias name:
None
entrez id:
6078
ensembl gene id:
ENSG00000239128
ucsc gene id:
uc062jck.1
refseq accession:
NG_008261
hgnc_id:
HGNC:10112
approved reserved:
1992-02-12

基因染色体位置

基因染色体位置

3p21.31
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

SNORD13P3（Small Nucleolar RNA, C/D Box 13 Pseudogene 3）是一种假基因，属于小核仁RNA（snoRNA）家族中的C/D box snoRNA假基因。假基因是指与功能基因序列相似但通常因突变失去功能的DNA片段。SNORD13P3来源于功能性的C/D box snoRNA基因（如SNORD13），这类snoRNA的主要功能是指导核糖体RNA（rRNA）的甲基化修饰，从而影响rRNA的成熟和蛋白质合成的效率。C/D box snoRNA家族的共性是通过与特定蛋白质结合形成复合物，识别rRNA上的靶位点并催化其2'-O-甲基化（一种化学修饰，可增强rRNA的稳定性）。由于SNORD13P3是假基因，它可能不再具备指导甲基化的功能，但其序列仍可能通过调控其他基因的表达或作为竞争性RNA分子影响细胞过程。目前关于SNORD13P3的具体生物学功能研究较少，假基因通常被认为是基因组进化中的“遗迹”，但近年研究发现某些假基因可能参与基因表达调控或疾病发生。例如，某些snoRNA假基因在癌症中异常表达，可能与肿瘤进展相关。若SNORD13P3过表达，可能干扰正常snoRNA的功能或竞争性结合蛋白质，从而影响rRNA修饰；若其表达降低，则可能无明显表型效应，因其本身可能无功能。突变对SNORD13P3的影响较小，除非突变使其获得异常功能（如调控其他基因）。与疾病的关系尚不明确，但同家族的功能性snoRNA（如SNORD44）在神经退行性疾病和癌症中有报道。需注意，假基因的研究仍处于早期阶段，许多机制有待揭示。

None

无

OMIM数据库中对SNORD13P3基因的介绍     Wikipedia数据库中对SNORD13P3基因的介绍

基因序列

基因序列

SNORD13P3基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SNORD13P3基因的碱基突变：           仅显示部分snp

基因表达

基因表达

SNORD13P3基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTTCATGAGTGTGATGATTGTG
58
CGTAACAAGGTTCAAGGGTG
59
GTTCATGAGTGTGATGATTGTG
58
GTAACAAGGTTCAAGGGTGG
59
GTTCATGAGTGTGATGATTGTG
58
TAACAAGGTTCAAGGGTGG
57

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SNORD13P3基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SNORD13P3基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SNORD13P3基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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