SNORD13P1 (small nucleolar RNA, C/D box 13 pseudogene 1)

symbol:
SNORD13P1
locus group:
pseudogene
location:
22q13.2
gene_family:
alias symbol:
U13|U13.32A
alias name:
None
entrez id:
6076
ensembl gene id:
ENSG00000238498
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uc062etu.1
refseq accession:
NG_008259
hgnc_id:
HGNC:10110
approved reserved:
1992-02-12
22q13.2
基因染色体位置图

SNORD13P1(Small Nucleolar RNA, C/D Box 13 Pseudogene 1)是一种假基因,属于小核仁RNA(snoRNA)的C/D盒家族。假基因是指与功能基因序列相似但通常因突变失去功能的DNA片段。SNORD13P1最初可能来源于有功能的SNORD13基因,但在进化过程中积累了突变,导致其无法正常转录或产生功能性RNA产物。小核仁RNA家族(snoRNA)的共性是通过指导核糖体RNA(rRNA)或其他RNA的化学修饰(如甲基化或假尿苷酸化)来调控基因表达和蛋白质合成。C/D盒snoRNA通常负责rRNA的2'-O-甲基化修饰,这对核糖体的结构和功能至关重要。由于SNORD13P1是假基因,目前尚未发现其具有明确的生物学功能或表达产物,因此其过表达或低表达对机体或其他基因的影响尚不明确。假基因有时可能通过竞争性结合调控元件或转录因子来间接影响功能基因的表达,但SNORD13P1的具体作用机制仍需进一步研究。该基因的突变可能不会对机体产生显著影响,因为假基因通常不参与关键的生物学过程。目前没有证据表明SNORD13P1与特定疾病直接相关,但某些假基因在特定条件下可能通过调控邻近基因或参与表观遗传调控而影响疾病发展。如果SNORD13P1意外恢复功能或异常表达,理论上可能干扰正常snoRNA的调控网络,但这种情况极为罕见。总体而言,SNORD13P1作为假基因,其研究价值主要在于理解基因组进化和假基因的潜在调控作用,而非直接的生理或病理功能。

None

SNORD13P1基因的碱基序列:[NCBI]
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SNORD13P1基因的碱基突变:           仅显示部分snp

SNORD13P1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGATTGGGTGTTCACATGC
59
CCTACATGGTAACAAGGTTCG
59
ATGATTGGGTGTTCACATGC
59
CTACATGGTAACAAGGTTCGAG
59
ATGATTGGGTGTTCACATGC
59
CTACATGGTAACAAGGTTCGA
58
      尚未收录相关数据

SNORD13P1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SNORD13P1基因的本体(GO)信息:

可能调控 SNORD13P1基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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