SNORA73B (small nucleolar RNA, H/ACA box 73B)

symbol:
SNORA73B
locus group:
non-coding RNA
location:
1p35.3
gene_family:
Small nucleolar RNAs, H/ACA box
alias symbol:
U17B|E1c
alias name:
None
entrez id:
26768
ensembl gene id:
ENSG00000200087
ucsc gene id:
uc031tvk.2
refseq accession:
NR_004406
hgnc_id:
HGNC:10116
approved reserved:
1993-08-24
1p35.3
基因染色体位置图

SNORA73B属于小核仁RNA(snoRNA)家族中的C/D box snoRNA亚类,这类RNA主要指导核糖体RNA(rRNA)的2'-O-甲基化修饰,这是rRNA成熟和核糖体组装的关键步骤。SNORA73B位于人类第5号染色体,其宿主基因为RPL13A(编码核糖体大亚基蛋白L13a),通过内含子剪切加工后形成独立的功能分子。该基因的典型作用位点是28S rRNA的第4364位核苷酸,通过互补配对引导甲基转移酶复合物完成特定位点的甲基化修饰,从而维持核糖体结构和翻译功能的稳定性。若SNORA73B发生突变(如靶向序列缺失或C/D box结构域破坏),会导致rRNA甲基化异常,可能引发核糖体功能障碍、蛋白质合成效率下降,甚至触发核糖体应激反应。研究发现SNORA73B在结直肠癌和肝细胞癌中表达上调,可能与肿瘤细胞异常增殖所需的翻译活性增强有关;而在神经退行性疾病中其表达降低可能影响神经元蛋白质稳态。该基因过表达可能通过增强核糖体功能促进细胞增殖,但也可能因过度甲基化引发rRNA构象异常;低表达则会导致翻译保真度下降和应激颗粒形成。SNORA73B所属的C/D box snoRNA家族具有保守特征:5'端携带C box(RUGAUGA)和3'端D box(CUGA)序列,中间含10-21nt与rRNA互补的引导区,这类snoRNA通常由RNA聚合酶II转录,依赖snoRNP蛋白复合体(包括fibrillarin甲基转移酶)发挥作用。目前"SNORA73B"的中文译名"小核仁RNA 73B"存在争议,部分学者建议采用功能描述性命名如"rRNA甲基化指导RNA73B"。

None

SNORA73B基因的碱基序列:[NCBI]
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SNORA73B基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1051376       rs2840758       rs2840759       rs4491036       rs6699748       rs12239015       rs41270835       rs41270837       rs41270839       rs56186001       rs58859638       rs74465940       rs74729937       rs74789998       rs74804093       rs75047327       rs75328335      

SNORA73B基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTCCTACAGCTTCCCAGAG
58
TGTTTCCTGCATGGTTTGTC
59
ATTCCTACAGCTTCCCAGAG
58
GTTTCCTGCATGGTTTGTC
57
CGTTGAAGATGAAGCTGGG
58
GACTCTGGGAAGCTGTAGG
59
      尚未收录相关数据

SNORA73B基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SNORA73B基因的本体(GO)信息:

可能调控 SNORA73B基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Asthma 0.000814326 3 0 BeFree
Stomach Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of stomach 0.000271442 1 0 BeFree
Medulloblastoma, Childhood 0.000271442 1 1 BeFree
Ischemic Cerebrovascular Accident 0.000271442 1 0 BeFree
Leishmaniasis, Visceral 0.000271442 1 3 BeFree
Ischemic stroke 0.000271442 1 0 BeFree
Cerebrovascular accident 0.000271442 1 0 BeFree

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