SNORA73A (small nucleolar RNA, H/ACA box 73A)

symbol:
SNORA73A
locus group:
non-coding RNA
location:
1p36.1
gene_family:
Small nucleolar RNAs, H/ACA box
alias symbol:
U17A|E1-7|E1b|E1
alias name:
None
entrez id:
6080
ensembl gene id:
ENSG00000274266
ucsc gene id:
uc057dyl.1
refseq accession:
NR_002907
hgnc_id:
HGNC:10115
approved reserved:
1993-08-24
1p36.1
基因染色体位置图

SNORA73A属于小核仁RNA(snoRNA)家族中的C/D box snoRNA亚类,这类RNA主要指导核糖体RNA(rRNA)的2'-O-甲基化修饰,从而影响rRNA的折叠、稳定性和蛋白质翻译效率。SNORA73A位于人类第5号染色体,其宿主基因为RPL13A(编码核糖体大亚基蛋白L13a),通过内含子剪切加工后形成成熟snoRNA。该基因的典型功能是通过碱基互补配对定位到rRNA特定位点(如28S rRNA的U4547),引导甲基转移酶复合物完成修饰。若SNORA73A发生突变(如box C/D保守序列破坏),会导致靶位点甲基化缺失,可能引起核糖体组装异常或翻译保真度下降。研究发现SNORA73A在结直肠癌中表达上调,其过表达可能通过增强核糖体生物合成促进肿瘤增殖;而敲低实验显示会抑制癌细胞生长,暗示其作为潜在治疗靶点。该基因属于SNORA73家族(含SNORA73A/B等成员),家族共性为均含有C/D box核心结构域(box C:RUGAUGA,box D:CUGA)和8-21nt的靶向互补序列。需要注意的是,snoRNA通常不编码蛋白质,其功能依赖于RNA分子本身与蛋白质的相互作用。目前关于SNORA73A的研究相对有限,其调控机制可能涉及宿主基因RPL13A的协同表达,异常表达还可能通过影响其他snoRNA(如SNORD78)的竞争性结合产生级联效应。在疾病关联方面,除癌症外,snoRNA整体功能紊乱还与普拉德-威利综合征(Prader-Willi syndrome)等神经发育疾病相关。专业术语解释:甲基化(methylation)指在分子特定位置添加甲基基团的化学修饰;核糖体生物合成(ribosome biogenesis)是细胞制造核糖体的复杂过程;保真度(fidelity)描述翻译过程中氨基酸正确掺入的比例。需注意"snoRNA"中文译名"小核仁RNA"存在争议,部分文献直接使用英文缩写。

None

SNORA73A基因的碱基序列:[NCBI]
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SNORA73A基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs2840757       rs2840758       rs2840759       rs6656720       rs6696931       rs6699748       rs11810945       rs12239015       rs16837603       rs16837604       rs34988350       rs41270835       rs41270837       rs57664461       rs58663247       rs74465940       rs74729937      

SNORA73A基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATATTCCTACAGCTTCCCAGAG
59
TTCCTGCATGGTTTGTCTC
58
TTCCTACAGCTTCCCAGAG
58
TGTTTCCTGCATGGTTTGTC
59
ATTCCTACAGCTTCCCAGAG
59
GTTTCCTGCATGGTTTGTC
58
      尚未收录相关数据

SNORA73A基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SNORA73A基因的本体(GO)信息:

可能调控 SNORA73A基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Breast Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Papilloma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of pancreas 0.000271442 1 0 BeFree
Hepatitis B 0.000271442 1 0 BeFree
Lupus Erythematosus, Systemic 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000271442 1 0 BeFree
Pancreatic carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

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