SNORA63 (small nucleolar RNA, H/ACA box 63)

symbol:
SNORA63
locus group:
non-coding RNA
location:
3q27.3
gene_family:
Small nucleolar RNAs, H/ACA box
alias symbol:
E3|E3-2|SNORA63A
alias name:
None
entrez id:
6043
ensembl gene id:
ENSG00000200320
ucsc gene id:
uc062qoq.1
refseq accession:
NR_002586
hgnc_id:
HGNC:10106
approved reserved:
1999-12-14
3q27.3
基因染色体位置图

SNORA63(Small Nucleolar RNA, H/ACA Box 63)是一种小核仁RNA,属于H/ACA box snoRNA家族。这类RNA分子主要参与核糖体RNA(rRNA)的转录后修饰,特别是假尿苷酸化(pseudouridylation),即通过酶促反应将rRNA中的尿苷(U)转化为假尿苷(Ψ),从而稳定rRNA结构并优化核糖体功能。SNORA63的典型作用位点是28S rRNA的第3817位尿苷,修饰后可能影响核糖体的翻译效率或准确性。H/ACA snoRNA家族的共性包括:由保守的H(发夹)和ACA(三核苷酸序列)结构域组成,与特定蛋白质(如dyskerin、NOP10、NHP2、GAR1)结合形成复合物,指导修饰酶到目标RNA位点。若SNORA63发生突变或缺失,可能导致rRNA修饰异常,进而影响核糖体组装或功能,与某些遗传病(如先天性角化不良症,dyskeratosis congenita)或癌症相关,但SNORA63的具体病理机制尚不明确。过表达SNORA63可能通过增强rRNA修饰促进蛋白质合成,潜在加速细胞增殖(如肿瘤发生);而低表达可能导致核糖体功能缺陷,引发翻译失调或细胞应激。目前尚未发现SNORA63与其他基因的直接调控关系,但H/ACA snoRNA家族成员常与端粒酶RNA(TERC)共享加工机制,暗示其在端粒维持中的间接作用。需要注意的是,"SNORA63"的命名可能因数据库更新而变化(如HGNC建议改用"SNAR-"前缀),且其功能研究仍处于早期阶段。

None

SNORA63基因的碱基序列:[NCBI]
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SNORA63基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs266718       rs1426810       rs1501301       rs1980299       rs11538612       rs12630327       rs57904146       rs62294447       rs73063489       rs73886079       rs75837460       rs75854161       rs76647428       rs77264282       rs77637805       rs79277600       rs79540453      

SNORA63基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGCTTAAAGCACTTGATGCA
59
AAGCGTCTCTGTCTTACTACG
60
CTGCTTAAAGCAGTATAGATGC
57
GTGTCTCTGTCTCACTATGGA
59
GCAGGTACTGTTACAATATGAC
57
TATCAAGGGCTTTAAGCAGG
57
CTAAGTGCTGTGTTGTCGT
58
CAGGAGAATAGCAGACAGGT
59
GGCAGGTACTGTTAGAATATAACTG
59
TCTCTGTCTTAGTATGGAATGGAG
59
CCTGCTTAAAGCACTTGGT
58
CGTCTCTGTCTTATTATGGAATCG
59
GTGTTGTCATTCTCCCTGC
59
CAGCAGATAGCAGACAGGT
59
CTGCTCAAAGCAATTGTTTCC
59
TCCATGTCTTACTATAGAACCGAG
59
AGTGCTGTATTGTCATTCCC
58
TGCTACAGAATAGCAGATGG
57
TTACCTTTCAAGCCCTGTC
57
ATGTATGAGACCAAACATCCC
58
      尚未收录相关数据

SNORA63基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SNORA63基因的本体(GO)信息:

可能调控 SNORA63基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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