SNORA62 (small nucleolar RNA, H/ACA box 62)

symbol:
SNORA62
locus group:
non-coding RNA
location:
3p22.1
gene_family:
Small nucleolar RNAs, H/ACA box
alias symbol:
E2|E2-1
alias name:
None
entrez id:
6044
ensembl gene id:
ENSG00000202363
ucsc gene id:
uc064krt.1
refseq accession:
NR_002324
hgnc_id:
HGNC:10107
approved reserved:
1993-06-18
3p22.1
基因染色体位置图

SNORA62(Small Nucleolar RNA, H/ACA Box 62)属于小核仁RNA(snoRNA)家族中的H/ACA box亚类,这类RNA主要参与核糖体RNA(rRNA)的转录后修饰,特别是指导假尿苷化(pseudouridylation)——一种将尿苷(U)转化为假尿苷(Ψ)的化学修饰过程,从而增强rRNA的稳定性和功能。SNORA62通过碱基互补配对定位到目标rRNA的特定位点,招募修饰酶复合物完成修饰。其作用位点通常在28S或18S rRNA的保守区域。若SNORA62发生突变,可能导致rRNA修饰异常,影响核糖体组装或翻译效率,进而干扰蛋白质合成,与某些发育障碍或癌症(如结直肠癌)相关。该基因属于H/ACA box snoRNA家族,家族成员均含H(hinge)和ACA(三核苷酸序列)结构域,并依赖支架蛋白(如dyskerin)形成功能复合物。过表达SNORA62可能破坏rRNA修饰平衡,引发核糖体功能失调或促癌效应;而低表达可能导致核糖体缺陷,影响细胞增殖。部分研究表明,SNORA62在肿瘤中异常表达可能通过调控核糖体生物合成(ribosome biogenesis)参与肿瘤进展,但其具体机制仍需进一步研究。专业术语解释:假尿苷化(pseudouridylation)是RNA中常见的修饰类型,能提升RNA分子结构稳定性;核糖体生物生成(ribosome biogenesis)指核糖体从rRNA加工到组装的整个过程。

None

SNORA62基因的碱基序列:[NCBI]
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SNORA62基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1318417       rs1392192       rs2077797       rs2077798       rs2077799       rs2269349       rs2269350       rs7619128       rs7619131       rs7621701       rs11431351       rs11921564       rs34087363       rs35233395       rs41285142       rs55919861       rs55920963      

SNORA62基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATTCTTCTTGTTAGAGCTCGG
57
CTACACTTGTGAGTTCATTGG
57
GTAGTGTGCTACATGAGGG
57
CTCACTGGATCAGAGACCC
59
TGTAGAGCAAGTTTGCTGC
58
CAGATTCTACTCATTTGGCCAG
59
TGTTAGAGCTTGGAGTTGAG
57
CACACTACCTACACTTGCG
58
CATAATGATGTCACTGACTGGC
60
CCCTCATGTAGCATACTACCT
59
TAGGTAGTATGCTATGTGAGGG
58
CTAGGCCAAAGACCTTTGTC
59
GTAGGTAGTATGCTATGTGAGG
57
TAGGCCAAAGACCTTTGTC
57
GGCATAATGATGTCACTGACTG
60
CTCATGTAGCATACTACCTACG
58
GGTAGTGTGCTACATGAGG
57
TCACTGGATCAGAGACCCT
59
GAAAGACAGCTAATCTAGTGTGC
59
CTCCTTGAGGTGTTTGCAG
58
      尚未收录相关数据

SNORA62基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SNORA62基因的本体(GO)信息:

可能调控 SNORA62基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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