SNCG (synuclein gamma)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SNCG
locus group:
protein-coding gene
location:
10q23.2
gene_family:
alias symbol:
BCSG1|SR|persyn
alias name:
synoretin|breast cancer-specific g…
entrez id:
6623
ensembl gene id:
ENSG00000173267
ucsc gene id:
uc001keb.3
refseq accession:
NM_001330120
hgnc_id:
HGNC:11141
approved reserved:
1998-04-07

基因染色体位置

基因染色体位置

10q23.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

This gene encodes a member of the synuclein family of proteins which are believed to be involved in the pathogenesis of neurodegenerative diseases. Mutations in this gene have also been associated with breast tumor development. [provided by RefSeq, Jan 2010]

此基因编码核蛋白家族，其被认为参与了神经变性疾病的发病机制的蛋白质的成员。在这个基因的突变也与乳腺肿瘤的发展有关。 [由RefSeq的，2010年1月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SNCG基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs9864       rs10232       rs760112       rs760113       rs1800373       rs1802015       rs2131395       rs3750823       rs3793899       rs3793900       rs4244973       rs4520507       rs7074229       rs7074886       rs7090120       rs7091084       rs7096355      

基因表达

基因表达

SNCG基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CCAAAGAGAAAGAGGAAGTGG
59
CCTGTAGCCCTCTAGTCTC
58
TGTATGTGGGAGCCAAGAC
59
CCTGCTCCTTGGTCTTCTC
60
ATGTATGTGGGAGCCAAGAC
60
CAGATGGCCTCAAGTCCTC
60
TCCAAAGAGAAAGAGGAAGTG
58
CTGTAGCCCTCTAGTCTCC
58
TGTATGTGGGAGCCAAGAC
59
CAGATGGCCTCAAGTCCTC
60
ATCCAAAGAGAAAGAGGAAGTG
58
TGTAGCCCTCTAGTCTCCC
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SNCG基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SNCG基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005515
O76070 (UniProtKB)
IPI
GO:0005737
O76070 (UniProtKB)
IDA
GO:0005815
O76070 (UniProtKB)
IEA
GO:0005819
O76070 (UniProtKB)
IEA
GO:0007268
O76070 (UniProtKB)
IEA
GO:0008344
O76070 (UniProtKB)
IEA
GO:0009306
O76070 (UniProtKB)
IEA
GO:0014059
O76070 (UniProtKB)
IEA
GO:0030424
O76070 (UniProtKB)
IEA
GO:0043025
O76070 (UniProtKB)
IEA
GO:0046928
O76070 (UniProtKB)
IEA
GO:0048471
O76070 (UniProtKB)
IEA
GO:0050808
O76070 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
O76070 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SNCG基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Mammary Neoplasms 0.13225461 9 0 BeFree_CTD_human_LHGDN
Hyperactive behavior 0.12 1 0 CTD_human
Mammary Neoplasms, Experimental 0.12 1 0 CTD_human
Animal Mammary Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human
Glaucoma 0.080271442 2 0 BeFree_RGD
Depressive disorder 0.08 1 0 RGD
Cocaine-Related Disorders 0.08 1 0 RGD
AMYOTROPHIC LATERAL SCLEROSIS 1 0.08 0 0 MGD
Neoplasm Metastasis 0.008434561 13 0 BeFree_LHGDN
Breast Carcinoma 0.005700279 21 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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