SMARCA4 (SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 4)
- symbol:
- SMARCA4
- locus group:
- protein-coding gene
- location:
- 19p13.2
- gene_family:
- alias symbol:
- hSNF2b|BRG1|BAF190|SNF2|SWI2|SNF2-BETA|SNF2LB|FLJ39786
- alias name:
- SNF2-like 4|global transcription...
- entrez id:
- 6597
- ensembl gene id:
- ENSG00000127616
- ucsc gene id:
- uc060tnr.1
- refseq accession:
- NM_003072
- hgnc_id:
- HGNC:11100
- approved reserved:
- 1995-07-17
SMARCA4（SWI/SNF相关基质相关肌动蛋白依赖染色质调节因子亚家族A成员4）属于SWI/SNF染色质重塑复合物基因家族，该家族通过调控染色质结构（DNA和蛋白质的紧密缠绕形式）影响基因表达。SMARCA4编码的蛋白质是BRG1（Brahma相关基因1），作为ATP依赖的染色质重塑酶，它利用能量改变DNA与组蛋白的结合状态，从而激活或抑制靶基因转录。其主要作用位点是染色质的核心区域，参与胚胎发育、细胞分化、DNA修复和细胞周期调控等关键生物学过程。若SMARCA4发生功能丧失性突变（如错义突变或截短突变），会导致染色质重塑异常，与多种癌症相关，包括恶性横纹肌样瘤（约98%病例存在突变）、非小细胞肺癌和卵巢癌等。这些突变通常造成复合物组装缺陷，使抑癌基因沉默或原癌基因激活。SMARCA4过表达可能破坏正常的基因调控网络，促进细胞增殖；而低表达则可能导致分化障碍或基因组不稳定。在SWI/SNF家族中，所有成员均含有保守的ATP酶结构域，但SMARCA4与SMARCA2（BRM）是唯一具有催化活性的亚基，二者功能部分冗余——当SMARCA4缺失时，SMARCA2可有限补偿。值得注意的是，约20%的人类肿瘤存在SWI/SNF复合物组分突变，凸显该家族在肿瘤抑制中的核心地位。目前针对SMARCA4缺失型肿瘤的治疗策略（如EZH2抑制剂）正进行临床试验，利用合成致死（synthetic lethality，即两个基因同时失活才导致细胞死亡）原理攻击癌细胞。
The protein encoded by this gene is a member of the SWI/SNF family of proteins and is similar to the brahma protein of Drosophila. Members of this family have helicase and ATPase activities and are thought to regulate transcription of certain genes by altering the chromatin structure around those genes. The encoded protein is part of the large ATP-dependent chromatin remodeling complex SNF/SWI, which is required for transcriptional activation of genes normally repressed by chromatin. In addition, this protein can bind BRCA1, as well as regulate the expression of the tumorigenic protein CD44. Mutations in this gene cause rhabdoid tumor predisposition syndrome type 2. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, May 2012]
由该基因编码的蛋白质是SWI / SNF家族的蛋白质的成员，并且是类似于果??蝇的梵蛋白质。这个家庭的成员具有解旋酶和ATP酶活性，被认为通过改变周围这些基因的染色质结构调节某些基因的转录。所编码的蛋白质是大ATP依赖的染色质重塑复合SNF / SW I，这是需要的基因的转录活化通常通过染色质压抑的一部分。另外，这种蛋白质可以结合的BRCA1，以及调节致瘤蛋白的CD44的表达。这个基因导致横纹肌样瘤倾向的辨证分型2.多个转录变异体编码不同亚型的突变也发现了这种基因。 [由RefSeq的，2012年5月提供]
基因本体信息
SMARCA4基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：
- 质膜
- 细胞质
- 细胞外
- 高尔基体
- 囊泡
- 细胞骨架
- 内质网
- 细胞核
- 内体
- 溶酶体
- 线粒体
SMARCA4基因的本体（GO）信息：
| 名称 |
|---|
| Chromatin modifying enzymes |
| Chromatin organization |
| formation of the beta-catenin:TCF transactivating complex |
| RMTs methylate histone arginines |
| Signaling by Wnt |
| TCF dependent signaling in response to WNT |
| 疾病名称 | 关系值 | NofPmids | NofSnps | 来源 |
| Coffin-Siris syndrome | 0.240542884 | 3 | 0 | BeFree_CTD_human_ORPHANET |
| MENTAL RETARDATION, AUTOSOMAL DOMINANT 16 | 0.24 | 1 | 6 | CLINVAR_UNIPROT |
| Rhabdoid Tumor Predisposition Syndrome 2 | 0.24 | 0 | 9 | CLINVAR_CTD_human |
| Coronary Artery Disease | 0.12554839 | 5 | 3 | BeFree_GAD_GWASCAT |
| Myocardial Infarction | 0.124734064 | 1 | 2 | GAD_GWASCAT |
| Coronary heart disease | 0.122638474 | 3 | 4 | BeFree_GAD_GWASCAT |
| Small cell carcinoma of lung | 0.121357209 | 5 | 0 | BeFree_CTD_human |
| Carcinoma, Small Cell | 0.121085767 | 5 | 0 | BeFree_CTD_human |
| Burkitt Lymphoma | 0.120542884 | 3 | 0 | BeFree_CTD_human |
| ovarian neoplasm | 0.120271442 | 4 | 0 | BeFree_CTD_human |
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