SMAD4 (SMAD family member 4)

基因基本信息

基因基本信息

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SMAD4
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protein-coding gene
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18q21.2
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SMAD family
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DPC4
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1996-11-15

基因染色体位置

基因染色体位置

18q21.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

SMAD4是一种关键的肿瘤抑制基因，属于SMAD基因家族，该家族共有9个成员（SMAD1-9），主要参与转化生长因子-β（TGF-β）信号通路的传导。SMAD家族蛋白的共同特点是能够介导细胞外信号（如TGF-β、骨形态发生蛋白BMP等）向细胞核内传递，调控基因表达，影响细胞增殖、分化、凋亡和迁移等过程。SMAD4作为该通路的核心介质，负责与其他SMAD蛋白（如SMAD2/3）形成复合物并转运至细胞核，激活或抑制靶基因的转录。SMAD4的生物学功能广泛，尤其在维持组织稳态和抑制肿瘤发生中起关键作用。它通过调控细胞周期阻滞蛋白（如p21）的表达来抑制细胞过度增殖，并促进细胞凋亡。SMAD4的突变或缺失会导致TGF-β信号通路功能丧失，与多种疾病密切相关，最典型的是胰腺癌（约50%病例存在SMAD4缺失），还涉及结直肠癌、青少年息肉病综合征（JP综合征）等。SMAD4突变可能引发肿瘤转移增强、预后不良，在JP综合征中则导致胃肠道多发息肉和癌症风险上升。当SMAD4过表达时，可能过度抑制细胞增殖，导致组织发育异常或纤维化疾病；而表达降低则削弱TGF-β的抑癌作用，促进肿瘤进展。此外，SMAD4表达异常还会影响其他基因（如MYC、CDKN1A）的功能，破坏细胞周期调控网络。该基因的突变形式包括点突变、缺失或启动子甲基化，其中截短突变常见于癌症患者，导致蛋白功能完全丧失。研究还发现SMAD4与血管生成、免疫调节相关，其表达水平变化可能影响肿瘤微环境。由于SMAD4在多条信号通路中的枢纽地位，它已成为癌症治疗（如靶向TGF-β通路）和基因检测的重要研究对象。

None

无

OMIM数据库中对SMAD4基因的介绍     Wikipedia数据库中对SMAD4基因的介绍

基因序列

基因序列

SMAD4基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SMAD4基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1787110       rs3752063       rs3829616       rs9951928       rs9961921       rs35014537       rs36222037       rs72913244       rs75658003       rs77212176       rs78685185       rs78950659       rs78985558       rs79642020       rs112190235       rs112512652       rs139455628      

基因表达

基因表达

SMAD4基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTGTCATCGACAGATGCAG
59
GAGTTTAACTTGATAGCTGGAGC
60
TGATCTATGCCCGTCTCTG
59
GATCAATTCCAGGTGATACAACTC
60
CCAGCTACTTACCATCATAACAG
59
GGTGGTGAGGCAAATTAGG
59
CCAGCTACTTACCATCATAACAG
59
GGTGGTGAGGCAAATTAGG
59
AAGGTCTTTGATTTGCGTCAG
60
AGTTTAACTTGATAGCTGGAGC
59
ACTCAGAGAATCTGTTATCCTG
57
AGGCATCATTACTTGTTGGT
58
ACCTAATTTGCCTCACCAC
58
ATCAAAGACCAGGATGATTGG
58
CCAGCTACTTACCATCATAACAG
59
GGTGGTGAGGCAAATTAGG
59
ACAGAGACATACAGCACCC
59
ATACTCAGGAGTTGTGGAAGC
60
CATACAGAGAACATTGGATGGG
59
CACATGAGGAAATCCTTTCCG
59

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
FOS
SMAD4
Unknown
11854297
GLI1
SMAD4
Unknown
24739390
HDAC4
SMAD4
Unknown
23817620
JUNB
SMAD4
Unknown
11854297
KAT2B
SMAD4
Activation
19525977
SMAD4
AHR
Unknown
11259615
SMAD4
APOC3
Activation
10995777
SMAD4
BAMBI
Activation
15240101
SMAD4
BCL2
Unknown
24739390
SMAD4
BGLAP
Unknown
11278818

基因本体信息

SMAD4基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SMAD4基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
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Q13485 (UniProtKB)
IDA
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Q13485 (UniProtKB)
IDA
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Q13485 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SMAD4基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Juvenile polyposis syndrome 0.587926175 71 58 BeFree_CLINVAR_CTD_human_GAD_MGD_ORPHANET_UNIPROT
Growth mental deficiency syndrome of Myhre 0.481900093 7 4 BeFree_CLINVAR_CTD_human_ORPHANET_UNIPROT
JUVENILE POLYPOSIS/HEREDITARY HEMORRHAGIC TELANGIECTASIA SYNDROME (disorder) 0.361085767 6 21 BeFree_CLINVAR_CTD_human_UNIPROT
Colorectal Neoplasms 0.14052735 15 0 BeFree_CTD_human_GAD_LHGDN
Pancreatic carcinoma 0.139543815 72 4 BeFree_CLINVAR
Stomach Neoplasms 0.125091382 2 0 CTD_human_GAD_LHGDN
Hereditary hemorrhagic telangiectasia 0.124267125 8 0 BeFree_GAD_ORPHANET
Neoplastic Syndromes, Hereditary 0.122367032 1 17 CLINVAR_GAD
Adenocarcinoma Of Esophagus 0.121357209 5 2 BeFree_CTD_human
Invasive Ductal Breast Carcinoma 0.120542884 3 0 BeFree_CTD_human

基因相关服务

基因相关服务

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