SLX1A-SULT1A3 (SLX1A-SULT1A3 readthrough (NMD candidate))

symbol:
SLX1A-SULT1A3
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other
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16p11.2
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HGNC:44437
approved reserved:
2012-10-08
16p11.2
基因染色体位置图

SLX1A-SULT1A3是一个融合基因,由SLX1A(也称为SLX1A或SLX1)和SULT1A3(磺基转移酶家族1A成员3)两个基因的部分序列融合而成。SLX1A属于SLX1核酸酶家族,该家族成员具有核酸内切酶活性,参与DNA修复和重组过程,特别是在解决霍利迪连接体(Holliday junction)等DNA结构时发挥作用。SULT1A3则属于磺基转移酶(SULT)家族,该家族成员通过催化硫酸基团从3'-磷酸腺苷-5'-磷酸硫酸(PAPS)转移到多种底物(如激素、神经递质和药物),从而调节这些分子的活性和代谢。SULT1A3主要作用于儿茶酚胺类物质(如多巴胺和肾上腺素),影响它们的生物活性和清除。 SLX1A-SULT1A3融合可能导致基因功能的异常调控,例如SULT1A3的过表达可能改变儿茶酚胺代谢,影响神经递质水平,进而与神经系统疾病或肿瘤发生相关。SLX1A的异常表达可能干扰DNA修复机制,增加基因组不稳定性,促进癌症发展。如果该融合基因表达降低,可能影响正常的DNA修复或代谢过程,导致细胞对损伤的敏感性增加。 SLX1A属于SLX1核酸酶家族,该家族成员在维持基因组稳定性中起关键作用,特别是在DNA交联修复和减数分裂重组中。SULT1A3属于SULT家族,该家族成员广泛参与内源性和外源性物质的代谢,影响药物反应和激素平衡。SLX1A-SULT1A3融合基因的发现提示其在某些疾病(如癌症或代谢紊乱)中可能具有潜在作用,但具体机制仍需进一步研究。

This locus represents naturally occurring read-through transcription between the neighboring SLX1A (SLX1 structure-specific endonuclease subunit homolog A) and SULT1A3 (sulfotransferase family, cytosolic, 1A, phenol-preferring, member 3) genes on the short arm of chromosome 16. A duplicate read-through locus also exists between the SLX1B and SULT1A4 genes located ~730 kb upstream on the same chromosome. The read-through transcript is a candidate for nonsense-mediated mRNA decay (NMD), and is thus unlikely to produce a protein product. [provided by RefSeq, Nov 2010]

此轨迹表示天然存在的相邻SLX1A之间和短臂通读转录(SLX1结构特异性内切酶亚基同源物A)的SULT1A3(磺家族,细胞内,1A,苯酚 - 宁愿,部件3)的基因染色体16.重复读通过基因也位于?730 kb的上游同一染色体上的SLX1B和SULT1A4基因之间存在。的通读转录为无义介导的mRNA降解(NMD)的候选,并且因此不太可能产生的蛋白质产物。 [由RefSeq的,2010年11月提供]

SLX1A-SULT1A3基因的碱基序列:[NCBI]
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SLX1A-SULT1A3基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs528438250       rs549421742       rs567675067       rs745808970       rs746668760       rs747480166       rs748397072       rs749147267       rs749271547       rs750743291       rs750945513       rs751586325       rs752026521       rs752365029       rs752873817       rs755059793       rs755079132      

SLX1A-SULT1A3基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTGGAGAAGTGTCCTACGG
59
AAGAGGTAGAGAACAGGGTG
59
TAGAAGAGGAACATGGAGCTG
59
AAGTACTTGATGAGCGGGAC
60
CTGGAGAAGTGTCCTACGG
59
AAGAGGTAGAGAACAGGGTG
59
CTGGAGAAGTGTCCTACGG
59
AAGAGGTAGAGAACAGGGTG
59
CCTAGAGAAGTGTAACCGGG
59
ACATAGACCACCTGAGGGT
60
CTGGAGAAGTGTCCTACGG
59
AAGAGGTAGAGAACAGGGTG
59
CTGGAGAAGTGTCCTACGG
59
AAGAGGTAGAGAACAGGGTG
59
ACCATCCAGGATGAAGAGG
59
GAAGAAACTCCTCTGCCAG
58
CTGGAGAAGTGTCCTACGG
59
GAGGTAGAGAACAGGGTGG
59
CTGGAGAAGTGTCCTACGG
59
GAGGTAGAGAACAGGGTGG
59
      尚未收录相关数据

SLX1A-SULT1A3基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SLX1A-SULT1A3基因的本体(GO)信息:

可能调控 SLX1A-SULT1A3基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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