SLCO6A1 (solute carrier organic anion transporter family member 6A1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SLCO6A1
locus group:
protein-coding gene
location:
5q21.1
gene_family:
Solute carriers
alias symbol:
OATP6A1|OATPY|MGC26949|CT48
alias name:
cancer/testis antigen 48
entrez id:
133482
ensembl gene id:
ENSG00000205359
ucsc gene id:
uc003knp.4
refseq accession:
NM_173488
hgnc_id:
HGNC:23613
approved reserved:
2003-11-25

基因染色体位置

基因染色体位置

5q21.1
基因染色体位置图

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
Loading Gene Browser...

基因突变

基因突变

SLCO6A1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs896546       rs974132       rs974133       rs981988       rs1117130       rs1117556       rs1118008       rs1120953       rs1376894       rs1376895       rs1376896       rs1376897       rs1376898       rs1376899       rs1376905       rs1376906       rs1376907      

基因表达

基因表达

SLCO6A1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGAGAACACTGACTTCCCAG
59
GCAATCCTGACAATGATGATCC
60
TCATATGTCAAGGTGTGGTG
58
AATGCCAACTTCTCAATGGT
58
AGCTAGGAAACGTAAACAGCT
60
CATCAGAATCCAAAGAGCAGC
60
TTTACTTTCAGGGTTGTACCTG
58
CCAGGAATAGTCCCAAATATTCTC
59
GCTAGGAAACGTAAACAGCT
58
TCATCAGAATCCAAAGAGCAG
58
TACTTTCAGGGTTGTACCTGAC
60
CCAGGAATAGTCCCAAATATTCTC
59
ACTGACTTCCCAGATGTAACTG
60
GCAATCCTGACAATGATGATCC
60
CTCATATGTCAAGGTGTGGT
57
ATGCCAACTTCTCAATGGT
57
TGACAGCAGACTTAAAGATCTG
58
CTGGATTCTTCATCAGAATCCA
58
TCATATGTCAAGGTGTGGTG
58
ATGCCAACTTCTCAATGGT
57

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SLCO6A1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SLCO6A1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005215
C9J020 (UniProtKB)
IEA
GO:0006810
C9J020 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
C9J020 (UniProtKB)
IEA
GO:0005887
Q86UG4 (UniProtKB)
IBA
GO:0015347
Q86UG4 (UniProtKB)
IBA
GO:0043252
Q86UG4 (UniProtKB)
IBA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SLCO6A1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Schizophrenia 0.123452799 6 2 BeFree_GAD_GWASCAT
Mental deterioration 0.12 1 1 GWASCAT
Impaired cognition 0.12 1 1 GWASCAT
Breast Carcinoma 0.013843535 51 1 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.013572094 50 1 BeFree
Malignant neoplasm of lung 0.012214884 45 0 BeFree
Carcinoma of lung 0.011943442 44 0 BeFree
Colorectal Cancer 0.007600372 28 1 BeFree
Asthma 0.007328931 27 0 BeFree
Colorectal Carcinoma 0.007057489 26 1 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话： 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号，实时查看信息，关注医学生物学动态。

版权所有 © 2025.Genelibs 济南弘晖生物技术有限公司 鲁ICP备13024435号-2