SLCO4A1-AS1 (SLCO4A1 antisense RNA 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SLCO4A1-AS1
locus group:
non-coding RNA
location:
20q13.33
gene_family:
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100127888
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HGNC:40537
approved reserved:
2014-06-13

基因染色体位置

基因染色体位置

20q13.33
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

SLCO4A1-AS1是一个长链非编码RNA（lncRNA）基因，位于人类染色体20q13.33区域，与SLCO4A1基因相邻并反向转录。作为非编码RNA，它不编码蛋白质，但可能通过调控邻近基因或其他基因的表达来发挥生物学功能。研究表明，SLCO4A1-AS1可能参与细胞增殖、迁移和凋亡等过程，并在某些癌症中表现出异常表达。例如，在结直肠癌中，SLCO4A1-AS1的表达水平可能升高，并与肿瘤的进展和不良预后相关。其作用机制可能涉及与microRNA或其他RNA分子的相互作用，从而影响下游信号通路。目前关于SLCO4A1-AS1的具体功能研究较少，但它在SLCO家族中的位置提示其可能与溶质载体有机阴离子转运蛋白（SLCO）家族的功能有关。SLCO家族主要负责转运内源性物质如激素和药物，但SLCO4A1-AS1作为非编码RNA，可能通过调控SLCO4A1或其他家族成员的表达间接影响转运功能。如果SLCO4A1-AS1过表达，可能促进肿瘤细胞的生长和转移，而降低表达则可能抑制这些过程。突变对该基因的影响尚不明确，但lncRNA的突变可能导致其调控功能丧失或异常，进而影响相关疾病的发展。SLCO4A1-AS1属于SLCO基因家族，该家族成员通常编码跨膜转运蛋白，但SLCO4A1-AS1是其中少数非编码RNA成员之一。未来研究需要进一步揭示其具体机制和临床意义。

None

无

OMIM数据库中对SLCO4A1-AS1基因的介绍     Wikipedia数据库中对SLCO4A1-AS1基因的介绍

基因序列

基因序列

SLCO4A1-AS1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SLCO4A1-AS1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs2258022       rs2275326       rs2275328       rs2277774       rs2282314       rs2427370       rs6011491       rs6011498       rs6011499       rs6011517       rs6011521       rs6090176       rs6090189       rs6122335       rs7263918       rs7270278       rs11421246      

基因表达

基因表达

SLCO4A1-AS1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTCTCACCAAACAAGGTGG
58
GTTCAAGTCAGCGACACTC
59
TTGTTCACAAAGAAGCCGC
60
GACAGTCTGCTCTGGTGAG
60
GAACAGGCAGAACTTGATGAC
60
GTTCAAGTCAGCGACACTG
59
AACAGGCAGAACTTGATGAC
59
GTTCAAGTCAGCGACACTG
59
CTTGTTCACAAAGAAGCCG
58
CAGTCTGCTCTGGTGAGAG
60
TGGGACTCCAAGAACTTGG
59
GTTCAAGTCAGCGACACTC
59
CAGGCAGAACTTGATGACC
59
GTTCAAGTCAGCGACACTG
59
TGGGACTCCAAGAACTTGG
59
TCAAGTCAGCGACACTCTG
60
TTGTTCACAAAGAAGCCGC
60
CAGTCTGCTCTGGTGAGAG
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SLCO4A1-AS1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SLCO4A1-AS1基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SLCO4A1-AS1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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