SLCO1A2 (solute carrier organic anion transporter family member 1A2)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SLCO1A2
locus group:
protein-coding gene
location:
12p12.1
gene_family:
Solute carriers
alias symbol:
OATP|OATP1A2|OATP-A
alias name:
None
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6579
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uc001res.3
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NM_021094
hgnc_id:
HGNC:10956
approved reserved:
1997-12-05

基因染色体位置

基因染色体位置

12p12.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

SLCO1A2（溶质载体有机阴离子转运蛋白家族成员1A2，英文全称Solute Carrier Organic Anion Transporter Family Member 1A2）属于SLCO基因家族（原称OATP家族），该家族编码的蛋白质主要负责跨膜转运内源性物质（如胆汁酸、激素）和外源性物质（如药物）。SLCO1A2主要在血脑屏障的内皮细胞中表达，其功能是介导有机阴离子、中性或阳离子化合物的双向转运，影响药物（如抗生素、抗抑郁药）和毒素进入中枢神经系统的效率。该基因的突变可能导致转运功能异常，影响药物代谢或增加神经毒性风险，与神经系统疾病（如癫痫、阿尔茨海默病）或药物不良反应相关。若SLCO1A2过表达，可能增强血脑屏障通透性，导致药物或毒素在脑内积累；表达降低则可能减少药物脑部递送效率，影响疗效。SLCO家族共性包括12个跨膜结构域、依赖pH或离子梯度的转运机制，以及广泛的底物重叠性（即不同成员可转运相似化合物）。目前该基因的中文译名存在差异，部分文献仍沿用旧称OATP1A2（有机阴离子转运多肽1A2）。

This gene encodes a sodium-independent transporter which mediates cellular uptake of organic ions in the liver. Its substrates include bile acids, bromosulphophthalein, and some steroidal compounds. The protein is a member of the SLC21A family of solute carriers. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Dec 2008]

这个基因编码的钠独立转运介导在肝脏中的有机离子的细胞摄取。其底物包括胆汁酸，bromosulphophthalein，和一些类固醇化合物。该蛋白质是SLC21A家族溶质载体的成员。这个基因的选择性剪接的结果在多个转录变体。 [由RefSeq的，2008年12月提供]

OMIM数据库中对SLCO1A2基因的介绍     Wikipedia数据库中对SLCO1A2基因的介绍

基因序列

基因序列

SLCO1A2基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SLCO1A2基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs5482       rs5483       rs5484       rs5485       rs5486       rs5487       rs5488       rs5489       rs1056007       rs1134407       rs1800203       rs2417977       rs3213208       rs4762821       rs7137767       rs7304919       rs11046005      

基因表达

基因表达

SLCO1A2基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTCGGCCAAGATGTTTCTG
59
ATCCAACTAGAGATGTTGGGA
58
AGTTGAAGATGTTTCTGTTGGC
60
TGTTGGGATGTTGAATTGTCTC
59
ATTCCACATGTTTACACTGGG
59
TAGATGTATCTGAAGGTGGTGG
59
TGGAAACCATGTTTCTGTTGG
59
GAATCCAACTAGAGATGTTGGG
59
AGTTGAAGATGTTTCTGTTGGC
60
TGTTGGGATGTTGAATTGTCTC
59
TTTCACAGCACACTTACGG
58
CTTACTTCTACCCATCTTGTCAG
58
AGTTGAAGATGTTTCTGTTGGC
60
TGTTGGGATGTTGAATTGTCTC
59
ATTCCACATGTTTACACTGGG
59
TAGATGTATCTGAAGGTGGTGG
59
GTCGGCCAAGATGTTTCTG
59
ATCCAACTAGAGATGTTGGGA
58
GTCCTCAAACAGTTTCTTGTG
58
TCCTTTGTACACTCTGATGGA
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SLCO1A2基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SLCO1A2基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005215
B4DJE6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
B4DJE6 (UniProtKB)
IEA
GO:0006811
B4DJE6 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
B4DJE6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005215
C9JCA7 (UniProtKB)
IEA
GO:0006810
C9JCA7 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
C9JCA7 (UniProtKB)
IEA
GO:0005215
C9JG34 (UniProtKB)
IEA
GO:0006810
C9JG34 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
C9JG34 (UniProtKB)
IEA
GO:0005215
C9JGK7 (UniProtKB)
IEA
GO:0006810
C9JGK7 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
C9JGK7 (UniProtKB)
IEA
GO:0005215
C9JHU9 (UniProtKB)
IEA
GO:0006810
C9JHU9 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
C9JHU9 (UniProtKB)
IEA
GO:0005215
C9JSB7 (UniProtKB)
IEA
GO:0006810
C9JSB7 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
C9JSB7 (UniProtKB)
IEA
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C9JTF6 (UniProtKB)
IEA
GO:0006810
C9JTF6 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
C9JTF6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005215
C9JUW6 (UniProtKB)
IEA
GO:0006810
C9JUW6 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
C9JUW6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005215
C9K059 (UniProtKB)
IEA
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C9K059 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
C9K059 (UniProtKB)
IEA
GO:0005215
F5GXY6 (UniProtKB)
IEA
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F5GXY6 (UniProtKB)
IEA
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F5H060 (UniProtKB)
IEA
GO:0006810
F5H060 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
F5H060 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
P46721 (UniProtKB)
TAS
GO:0005887
P46721 (UniProtKB)
IBA
GO:0008206
P46721 (UniProtKB)
IBA
GO:0008514
P46721 (UniProtKB)
TAS
GO:0015125
P46721 (UniProtKB)
IBA
GO:0015125
P46721 (UniProtKB)
TAS
GO:0015347
P46721 (UniProtKB)
IBA
GO:0015711
P46721 (UniProtKB)
TAS
GO:0015721
P46721 (UniProtKB)
TAS
GO:0043252
P46721 (UniProtKB)
IBA
GO:0043252
P46721 (UniProtKB)
TAS
GO:0098779
P46721 (UniProtKB)
IGI

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SLCO1A2基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Progressive supranuclear palsy 0.122638474 2 6 BeFree_GAD_GWASCAT
Epilepsy 0.08 1 0 CTD_mouse
Jaundice, Chronic Idiopathic 0.08 1 0 RGD
Mammary Neoplasms 0.002995792 2 0 BeFree_LHGDN
Cholelithiasis 0.002638474 1 3 BeFree_GAD
Cholecystolithiasis 0.002638474 1 3 BeFree_GAD
Diabetes Mellitus, Non-Insulin-Dependent 0.002638474 2 0 BeFree_GAD
Hypertensive disease 0.002367032 1 0 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Gilbert Disease (disorder) 0.002367032 1 0 GAD

基因相关服务

基因相关服务

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山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

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