SLC47A1 (solute carrier family 47 member 1)

symbol:
SLC47A1
locus group:
protein-coding gene
location:
17p11.2
gene_family:
Solute carriers
alias symbol:
FLJ10847|MATE1
alias name:
multidrug and toxin extrusion 1
entrez id:
55244
ensembl gene id:
ENSG00000142494
ucsc gene id:
uc002gvy.2
refseq accession:
NM_018242
hgnc_id:
HGNC:25588
approved reserved:
2007-05-03
17p11.2

SLC47A1(溶质载体家族47成员1)是一种多药及毒素外排转运蛋白(MATE1),属于SLC47基因家族。该基因家族包括SLC47A1和SLC47A2两个成员,它们共同负责介导有机阳离子(如药物、代谢废物和毒素)的跨膜转运,主要依赖质子梯度驱动外排。SLC47A1主要在肝脏、肾脏和小肠中表达,尤其在肾小管上皮细胞的顶膜和肝细胞的胆小管膜上富集,参与药物(如二甲双胍、西咪替丁)和内源性物质(如肌酐)的排泄。其功能对维持体内药物浓度和代谢平衡至关重要。若SLC47A1发生功能丧失突变(如G64D、V480M),可能导致药物清除率下降,增加血药浓度及毒性风险(如二甲双胍诱发的乳酸酸中毒)。该基因多态性(如rs2289669)与二甲双胍疗效差异相关。过表达SLC47A1会加速药物外排,可能降低疗效(如化疗耐药),而表达降低则可能增强药物作用但增加不良反应。SLC47A1与慢性肾病、糖尿病和某些癌症的耐药性有关,其调控机制涉及HNF4α等转录因子。该基因家族成员均具有12个跨膜结构域,依赖H⁺反向转运机制,但组织分布和底物偏好略有差异。

This gene is located within the Smith-Magenis syndrome region on chromosome 17. It encodes a protein of unknown function. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因位于17号染色??体上的史密斯马盖尼斯综合征区域内它编码未知功能的蛋白质。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

SLC47A1基因的碱基序列:[NCBI]
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SLC47A1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs10735       rs1129696       rs2249885       rs2453598       rs2453599       rs3187903       rs3210336       rs7212622       rs7223097       rs7225817       rs9916406       rs35395280       rs56700256       rs59607900       rs62065936       rs73981550       rs75628837      

SLC47A1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTTCATAAGCTCCGTGTTCTG
59
ACATTGATAACCGCGATTGC
59
TTGAAGCTCTTGCTTGCAC
59
CCAATGGTATTCACAATGGCT
59
TTCTTAATCTTGCTGCTGGT
57
GTTATGGACAAAGCTGGTCC
59
ACTTGGAGTGATGGAGCAG
59
GATGAGGGTGATGAGAAGGG
59
GGATCACTTGAGGTCAGGA
58
TAGAGACGGAGTTTCACCA
57
CTTCTTAATCTTGCTGCTGGT
58
TTATGGACAAAGCTGGTCC
57
CATAAGCTCCGTGTTCTGTG
59
GTGACATTGATAACCGCGA
58
ACTTGGAGTGATGGAGCAG
59
ATGAGGGTGATGAGAAGGG
58
TTTGAAGCTCTTGCTTGCA
58
AATGGTATTCACAATGGCTCC
58
TTCACGCCTGTAATCCCAG
59
TCCTGACCTCAAGTGATCC
58
      尚未收录相关数据

SLC47A1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SLC47A1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0006855
E7EX57 (UniProtKB)
IEA
GO:0006855
I3L345 (UniProtKB)
IEA
GO:0006855
J3KSS8 (UniProtKB)
IEA
GO:0006855
Q96FL8 (UniProtKB)
IBA
GO:0015695
Q96FL8 (UniProtKB)
IBA
GO:0046618
Q96FL8 (UniProtKB)
IEA
GO:0055085
Q96FL8 (UniProtKB)
TAS
GO:1902600
Q96FL8 (UniProtKB)
IEA

可能调控 SLC47A1基因的相关microRNA:     

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Kidney Diseases 0.12 1 0 CTD_human
Diabetes Mellitus 0.00554839 4 0 BeFree_GAD
Diabetes Mellitus, Non-Insulin-Dependent 0.002909916 3 1 BeFree_GAD
Diabetes 0.000814326 3 0 BeFree
Acidosis, Lactic 0.000271442 1 0 BeFree

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