SLC38A6 (solute carrier family 38 member 6)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SLC38A6
locus group:
protein-coding gene
location:
14q23.1
gene_family:
Solute carriers
alias symbol:
NAT-1
alias name:
None
entrez id:
145389
ensembl gene id:
ENSG00000139974
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uc001xfg.3
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NM_001172702
hgnc_id:
HGNC:19863
approved reserved:
2002-12-10

基因染色体位置

基因染色体位置

14q23.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

SLC38A6（溶质载体家族38成员6）属于SLC38基因家族，该家族主要编码钠依赖性中性氨基酸转运蛋白（SNAT），负责调控氨基酸的跨膜转运。SLC38家族成员通常在中性氨基酸（如谷氨酰胺、丙氨酸、天冬酰胺等）的吸收和代谢中发挥关键作用，并广泛表达于大脑、肝脏、肾脏等组织，参与细胞营养供应、神经递质合成及能量代谢。SLC38A6定位于14号染色体（14q32.2），其编码的蛋白主要分布于溶酶体膜，通过依赖质子梯度的方式转运氨基酸，与其他家族成员依赖钠离子的机制不同。该基因在维持溶酶体氨基酸稳态和自噬过程中起重要作用，影响细胞清除受损蛋白和细胞器的能力。突变可能导致溶酶体功能紊乱，与神经退行性疾病（如帕金森病）和溶酶体贮积症相关。过表达SLC38A6可能增强溶酶体氨基酸外排，干扰自噬平衡，导致异常蛋白积累；而表达降低则可能抑制溶酶体功能，引发代谢压力或细胞凋亡。此外，SLC38A6与mTOR信号通路存在潜在关联，可能通过调节氨基酸感应影响细胞生长和增殖。研究还发现其在肿瘤微环境中可能参与癌细胞代谢重编程，但具体机制仍需进一步探索。该基因家族的功能冗余性使得单一成员突变可能被部分补偿，但长期功能缺陷仍可能导致代谢或神经系统疾病。

None

无

OMIM数据库中对SLC38A6基因的介绍     Wikipedia数据库中对SLC38A6基因的介绍

基因序列

基因序列

SLC38A6基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SLC38A6基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs719511       rs719512       rs768239       rs1958267       rs1958268       rs1958269       rs2039081       rs2039082       rs2296921       rs3215858       rs4447342       rs4902023       rs5809078       rs7149101       rs7152054       rs7154137       rs7156470      

基因表达

基因表达

SLC38A6基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GGCAGGCACCATAATAATTCAG
60
CAATAGCAGCAGGAAGCTC
59
CATTCTCATGGATTCGCCA
58
AGAGGATATTGCAACTACACC
58
GGCTGGTATGTCTCTGTCC
60
TGTCTGTGAAGTTCGTTGC
59
TCAAGGGTACATGTGAAAGC
58
CAGAATGAGACCCTGGGAG
59
TGAGACTACAGGAAGAGATACC
58
AAACAGTTGCCTTCTTGCT
58
AATGCCATCATGGGAAGTG
58
AGCAGCAAGAAGCTAAATCC
59
TATTCAGACAGGTTGAAGCCA
60
CAGTATACTACTTAGCTCTTCAGTG
59
GAAGAGATGCAGCGTTGAG
59
CTGTGAAGTTCTAACAGCAGTG
60
TAATCCACTTCCCTGCCAG
59
AACATGTTGATGTACTGGCAC
59
TGTGTATTCAGACAGCTATGTC
58
AGTGTTTGTCCATCAAGATACC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SLC38A6基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SLC38A6基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
A0A0C4DG39 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
E9PMA3 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
G3V3H5 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
H0YDY0 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
H0YF42 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
H0YJG2 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
H0YJU1 (UniProtKB)
IEA
GO:0003333
Q8IZM9 (UniProtKB)
IBA
GO:0005886
Q8IZM9 (UniProtKB)
ISS
GO:0005887
Q8IZM9 (UniProtKB)
IBA
GO:0006814
Q8IZM9 (UniProtKB)
IEA
GO:0015171
Q8IZM9 (UniProtKB)
IBA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SLC38A6基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant neoplasm of urinary bladder 0.004071628 15 0 BeFree
Carcinoma of bladder 0.004071628 15 0 BeFree
Colorectal Carcinoma 0.002985861 11 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.002714419 10 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.002714419 10 0 BeFree
Colorectal Cancer 0.002714419 10 0 BeFree
Carcinoma of lung 0.001900093 7 3 BeFree
Malignant neoplasm of lung 0.001900093 7 3 BeFree
Carcinogenesis 0.001900093 7 0 BeFree
Malignant neoplasm of prostate 0.001628651 6 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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