SLC38A4 (solute carrier family 38 member 4)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SLC38A4
locus group:
protein-coding gene
location:
12q13.11
gene_family:
Solute carriers
alias symbol:
PAAT|NAT3|ATA3
alias name:
None
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55089
ensembl gene id:
ENSG00000139209
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uc001rpj.2
refseq accession:
NM_001143824
hgnc_id:
HGNC:14679
approved reserved:
2002-01-25

基因染色体位置

基因染色体位置

12q13.11
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

SLC38A4（溶质载体家族38成员4，Solute Carrier Family 38 Member 4）属于SLC38基因家族，该家族编码钠离子依赖性中性氨基酸转运蛋白（SNATs），主要负责转运中性氨基酸如谷氨酰胺、丙氨酸和天冬酰胺等。SLC38A4主要在肾脏、小肠和胎盘中表达，其功能是通过依赖钠离子的方式将氨基酸从细胞外转运至细胞内，参与维持氨基酸稳态和细胞代谢。SLC38A4的突变可能导致氨基酸转运功能障碍，影响蛋白质合成和能量代谢，与某些代谢性疾病如高氨血症或氨基酸尿症相关。过表达SLC38A4可能增强细胞对谷氨酰胺等氨基酸的摄取，促进细胞增殖，尤其在肿瘤微环境中可能支持癌细胞的生长和存活；而降低表达则可能导致氨基酸供应不足，影响细胞正常功能，尤其在快速增殖的组织如肠道或胎盘可能引发发育或代谢异常。SLC38基因家族的共性是其成员均编码依赖钠离子的氨基酸转运蛋白，参与多种生理过程如营养吸收、神经递质合成和酸碱平衡调节。SLC38A4的功能异常还与某些神经系统疾病和癌症相关，例如在某些肿瘤中其表达上调可能通过提供代谢底物支持肿瘤生长。

SLC38A4 is found predominantly in liver and transports both cationic and neutral amino acids. The transport of cationic amino acids by SLC38A4 is Na(+) and pH independent, while the transport of neutral amino acids is Na(+) and pH dependent (Hatanaka et al., 2001 [PubMed 11342143]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

SLC38A4在肝脏主要存在和运输阳离子和中性氨基酸。阳离子氨基酸由SLC38A4传输是Na（+）和不依赖于pH，而中性氨基酸的运输是Na（+）和pH依赖性（灿等人，2001年[搜索PubMed 11342143]）。[由OMIM供给2008年3月]

OMIM数据库中对SLC38A4基因的介绍     Wikipedia数据库中对SLC38A4基因的介绍

基因序列

基因序列

SLC38A4基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SLC38A4基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs180403       rs180404       rs180405       rs180406       rs180407       rs180408       rs180409       rs180410       rs180411       rs180412       rs180413       rs180414       rs180415       rs180416       rs180417       rs180418       rs180419      

基因表达

基因表达

SLC38A4基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCTTCCCAATTCGTACATCAG
58
CTGCAATCAGGAAATGTCG
57
ATACATCTTCGGATTCATAGGG
57
AACGTCTTTGGAATCTTCCTG
58
TCTTCCCAATTCGTACATCAG
58
CTGCAATCAGGAAATGTCG
57
CAGAACATTGGAGCAATGTC
58
AAGTCCCATGAATGCTCTG
58
ACATTGGAGCAATGTCAAGC
59
CTTCAAGTCCCATGAATGCTC
59
ACATTGGAGCAATGTCAAGC
60
CTTCAAGTCCCATGAATGCTC
59
CTTCTTCTGCCACTATGCTG
59
ACGTCTTTGGAATCTTCCTG
58
TTGTCCTCTTCCCAATTCG
58
TCAGGAAATGTCGTATCCAG
57
ATACATCTTCGGATTCATAGGG
57
AACGTCTTTGGAATCTTCCT
57
CATTGGAGCAATGTCAAGC
57
TCTTCAAGTCCCATGAATGC
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SLC38A4基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SLC38A4基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
F8VQY9 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
F8VRD9 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
H0YHZ8 (UniProtKB)
IEA
GO:0003333
Q969I6 (UniProtKB)
IBA
GO:0005886
Q969I6 (UniProtKB)
TAS
GO:0005887
Q969I6 (UniProtKB)
IBA
GO:0006814
Q969I6 (UniProtKB)
IEA
GO:0006865
Q969I6 (UniProtKB)
TAS
GO:0015171
Q969I6 (UniProtKB)
IBA
GO:0015171
Q969I6 (UniProtKB)
TAS
GO:0015293
Q969I6 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SLC38A4基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Prostatic Neoplasms 0.002367032 1 1 GAD
Hyperglycemia 0.000271442 1 0 BeFree
Liver carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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