SLC35C2 (solute carrier family 35 member C2)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SLC35C2
locus group:
protein-coding gene
location:
20q13.12
gene_family:
Solute carriers
alias symbol:
CGI-15|bA394O2.1
alias name:
None
entrez id:
51006
ensembl gene id:
ENSG00000080189
ucsc gene id:
uc002xrr.5
refseq accession:
NM_015945
hgnc_id:
HGNC:17117
approved reserved:
2001-11-23

基因染色体位置

基因染色体位置

20q13.12
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

This gene encodes a member of the triose-phosphate transporter protein family. This gene is regulated by oxygen tension, is induced in hypoxic trophoblast cells, and is overexpressed in ovarian cancer. Alternative splicing results in multiple transcript variants. A pseudogene of this gene has been defined on the X chromosome. [provided by RefSeq, Jul 2013]

该基??因编码的磷酸丙糖转运蛋白家族的一个成员。该基因是由氧张力调节，在缺氧滋养细胞被诱导，并在卵巢癌中过表达。选择性剪接结果在多个抄本变形。该基因的假基因已在X染色体上被定义。 [由RefSeq的，2013年7月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SLC35C2基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs2274677       rs2664572       rs75678277       rs111743887       rs185336541       rs191553576       rs375871258       rs534305909       rs536045192       rs538509383       rs540340593       rs548406210       rs550538695       rs570840451       rs572802643       rs575244707       rs911435      

基因表达

基因表达

SLC35C2基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGACAAAGAGCTTCCATTTCC
59
CCACTCTTCTGAGGTAGTCG
59
CATTCCAGAGGTGATGGTG
58
CTCATTGTCACCTTCCTCC
58
GGTATTTCCTGAGCACCTG
58
CCAAAGTGACGTGTTTACTG
57
TCTCTGAGTTCCTCCTGGT
59
CAGGAGGCTGATCTGATCG
60
TGACAAAGAGCTTCCATTTCC
59
CCACTCTTCTGAGGTAGTCG
59
TTAAGGAAGTCTGCACTTTGC
59
CAGGAGGCTGATCTGATCG
60
AACAAGTGGCTGACAAAGG
59
GGTCATTGTGTACAGCGAG
59
CATTCCAGAGGTGATGGTG
58
CTCATTGTCACCTTCCTCC
58
TCCAGAATCCCATCGACAC
59
AATGGAGACCTTCAAATACAGC
59
CTACCTCAGAAGAGTGGCTC
59
CATTGTGTACAGCGAGACG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SLC35C2基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SLC35C2基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
Q5JW03 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q5JW04 (UniProtKB)
IEA
GO:0005793
Q9NQQ7 (UniProtKB)
IDA
GO:0005794
Q9NQQ7 (UniProtKB)
IEA
GO:0005801
Q9NQQ7 (UniProtKB)
IDA
GO:0010629
Q9NQQ7 (UniProtKB)
IEA
GO:0015786
Q9NQQ7 (UniProtKB)
IBA
GO:0016021
Q9NQQ7 (UniProtKB)
IEA
GO:0033116
Q9NQQ7 (UniProtKB)
IEA
GO:0036066
Q9NQQ7 (UniProtKB)
IEA
GO:0045747
Q9NQQ7 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SLC35C2基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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