SLC18A3 (solute carrier family 18 member A3)

symbol:
SLC18A3
locus group:
protein-coding gene
location:
10q11.23
gene_family:
Solute carriers
alias symbol:
VACHT
alias name:
None
entrez id:
6572
ensembl gene id:
ENSG00000187714
ucsc gene id:
uc001jhw.3
refseq accession:
NM_003055
hgnc_id:
HGNC:10936
approved reserved:
1995-06-01
10q11.23
基因染色体位置图

SLC18A3基因(溶质载体家族18成员A3,英文全称Solute Carrier Family 18 Member A3)属于SLC18基因家族,该家族主要编码囊泡单胺转运体(VMATs),负责将神经递质如乙酰胆碱、单胺类物质(如多巴胺、血清素)从细胞质转运至突触小泡内储存,以便在神经信号传递时释放。SLC18A3特异性编码囊泡乙酰胆碱转运体(VAChT),其表达产物VAChT蛋白定位于胆碱能神经元的突触前膜囊泡上,通过依赖质子梯度的主动运输将乙酰胆碱装入囊泡,对维持胆碱能神经系统的功能至关重要。若SLC18A3发生功能丧失性突变(如错义突变或缺失),会导致乙酰胆碱囊泡装载障碍,引发先天性肌无力综合征(CMS),表现为肌肉疲劳、呼吸困难和运动障碍;而某些突变可能增加VAChT活性,与精神分裂症或自主神经功能障碍相关。该基因过表达可能增强胆碱能信号传递,但可能引发过度兴奋性神经毒性;表达降低则导致乙酰胆碱释放不足,与阿尔茨海默病、帕金森病等神经退行性疾病相关。SLC18基因家族共性为均编码依赖质子梯度的神经递质转运体,具有12个跨膜结构域,通过消耗能量(H+梯度)逆浓度转运底物。目前“囊泡乙酰胆碱转运体”的中文译名存在争议,部分文献直译为“囊泡乙酰胆碱转运蛋白”(VAChT)。

This gene is a member of the vesicular amine transporter family. The encoded transmembrane protein transports acetylcholine into secretory vesicles for release into the extracellular space. Acetylcholine transport utilizes a proton gradient established by a vacuolar ATPase. This gene is located within the first intron of the choline acetyltransferase gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

此基因是泡状胺转运蛋白家族的一个成员。所编码的跨膜蛋白运乙酰胆碱到释放到细胞外空间的分泌囊泡。乙酰胆碱转运利用由液泡ATP建立了一个质子梯度。该基因位于胆碱乙酰转移酶基因的第一个内含子内。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

SLC18A3基因的碱基序列:[NCBI]
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SLC18A3基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs733722       rs874273       rs874274       rs885835       rs1880675       rs2269338       rs2377879       rs3729496       rs3750752       rs3810947       rs8175353       rs8178981       rs8178982       rs8178983       rs8187726       rs8187727       rs8187728      

SLC18A3基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGGTGCTTGTTATCGTGTG
59
ACGATGACCATGTACAGCA
59
GGTGCTTGTTATCGTGTGC
60
CACGATGACCATGTACAGC
59
CCATGTCTCAGTCTATGGC
57
GTAGGCCACCGAATAGGAG
59
      尚未收录相关数据

SLC18A3基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SLC18A3基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005277
Q16572 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q16572 (UniProtKB)
TAS
GO:0005887
Q16572 (UniProtKB)
TAS
GO:0007269
Q16572 (UniProtKB)
TAS
GO:0015870
Q16572 (UniProtKB)
TAS
GO:0016020
Q16572 (UniProtKB)
TAS
GO:0060201
Q16572 (UniProtKB)
TAS
GO:0060201
Q16572 (UniProtKB)
TAS
GO:0060201
Q16572 (UniProtKB)
TAS
GO:0072488
Q16572 (UniProtKB)
IEA
GO:0098793
Q16572 (UniProtKB)
IEA

可能调控 SLC18A3基因的相关microRNA:     

Reactome

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Urinary Bladder Diseases 0.08 1 0 RGD
Asthma 0.08 1 0 RGD
Endotoxemia 0.08 1 0 RGD
Alzheimer's Disease 0.007101096 3 0 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Tendinosis 0.000271442 1 0 BeFree
Impaired cognition 0.000271442 1 0 BeFree
Sleep Apnea, Obstructive 0.000271442 1 0 BeFree
Pain 0.000271442 1 0 BeFree
Varicosity 0.000271442 1 0 BeFree

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