SLC12A2 (solute carrier family 12 member 2)

symbol:
SLC12A2
locus group:
protein-coding gene
location:
5q23.3
gene_family:
Protein phosphatase 1 regulatory subunits|Solute carriers
alias symbol:
NKCC1|BSC2|BSC-2|PPP1R141|CCC1
alias name:
basolateral Na-K-Cl symporter|prot…
entrez id:
6558
ensembl gene id:
ENSG00000064651
ucsc gene id:
uc003kus.4
refseq accession:
NM_001046
hgnc_id:
HGNC:10911
approved reserved:
1994-02-16
5q23.3
基因染色体位置图

SLC12A2(溶质载体家族12成员2,英文全称Solute Carrier Family 12 Member 2)属于SLC12基因家族,该家族编码的蛋白质均为电中性阳离子-氯离子共转运体(electroneutral cation-chloride cotransporters),主要负责跨膜运输钠、钾和氯离子,参与调节细胞体积、离子稳态和神经兴奋性等关键生理过程。SLC12A2基因编码的蛋白质通常称为NKCC1(Na-K-2Cl协同转运蛋白1),广泛分布于多种组织,包括肾脏、肠道、唾液腺、内耳和中枢神经系统等,其主要功能是通过消耗ATP能量,将1个钠离子、1个钾离子和2个氯离子共同转运至细胞内,维持细胞内外的渗透压平衡和电解质浓度。 在生物学功能上,NKCC1对体液分泌、神经信号传导和听觉功能至关重要。例如,在内耳中,NKCC1参与内淋巴液的产生,维持耳蜗内高钾环境,这对听觉传导不可或缺;在唾液腺和汗腺中,它促进分泌物的形成;在中枢神经系统,它调节γ-氨基丁酸(GABA)能神经元的氯离子浓度,影响抑制性神经递质的作用。若SLC12A2发生功能丧失性突变(loss-of-function mutations),可能导致耳聋、唾液分泌减少、肠道液体吸收障碍或神经系统异常(如癫痫)。相反,某些突变可能增强其转运活性,与高血压或某些肿瘤的进展相关。 SLC12A2的过表达可能导致细胞过度吸水、体积增大,或促进某些肿瘤细胞的迁移和侵袭(如胶质瘤),因其参与调节细胞迁移所需的离子流动。而表达降低则可能引起分泌功能障碍(如口干症)、听力损失或神经兴奋性异常(如癫痫易感性增加)。该基因与多种疾病相关,如遗传性耳聋(如DFNB4型)、巴特综合征(Bartter syndrome,一种肾小管功能障碍疾病)和某些神经系统疾病。 SLC12基因家族(SLC12 family)的共性在于均编码离子转运蛋白,依赖钠或钾的电化学梯度协同运输氯离子,成员包括NKCC1、NKCC2(由SLC12A1编码,主要在肾脏表达)及KCCs(钾-氯共转运体,如KCC2由SLC12A5编码)等。这些蛋白在维持细胞渗透压、神经信号传递和器官功能中发挥核心作用,其活性常受磷酸化调节,并与多种生理和病理过程密切相关。

The protein encoded by this gene mediates sodium and chloride transport and reabsorption. The encoded protein is a membrane protein and is important in maintaining proper ionic balance and cell volume. This protein is phosphorylated in response to DNA damage. Three transcript variants encoding two different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jan 2012]

由该基因编码的蛋白质介导钠和氯的运输和再吸收。所编码的蛋白质是一种膜蛋白,是在保持适当的离子平衡和细胞体积重要。该蛋白是响应DNA损伤磷酸化。已发现该基因编码的两种不同亚型三个抄本变形。 [由RefSeq的,2012年1月提供]

SLC12A2基因的碱基序列:[NCBI]
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SLC12A2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1864922       rs3812049       rs113121246       rs114437564       rs114976399       rs115987674       rs116305063       rs138234695       rs138962699       rs139047347       rs139757915       rs140255104       rs140428806       rs144623574       rs146145321       rs149585221       rs149696176      

SLC12A2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGTACATATGGGTCCTCGA
57
GTTCTTAATAAGCCATCGCTG
58
CTTGAAGCTAGTACACAGTTTCAG
60
GGTATCAATAAGGTCAAACCTCC
59
TACATATGGGTCCTCGAAGAC
59
TGTTCTTAATAAGCCATCGCTG
59
TGATGATGGAGGTTTGACC
57
CTTTCCACCAATGAATACTCTG
57
TGAAGCTAGTACACAGTTTCAG
58
GGTATCAATAAGGTCAAACCTCC
59
TGGCCATGTACATATGGGTC
60
ATAAGCCATCGCTGATATTTGG
59
      尚未收录相关数据

SLC12A2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SLC12A2基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0015377
G3XAL9 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
G3XAL9 (UniProtKB)
IEA
GO:1902476
G3XAL9 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
P55011 (UniProtKB)
IPI
GO:0005886
P55011 (UniProtKB)
TAS
GO:0005887
P55011 (UniProtKB)
TAS
GO:0006810
P55011 (UniProtKB)
TAS
GO:0006811
P55011 (UniProtKB)
TAS
GO:0006813
P55011 (UniProtKB)
IEA
GO:0006814
P55011 (UniProtKB)
IEA
GO:0008511
P55011 (UniProtKB)
TAS
GO:0008519
P55011 (UniProtKB)
IDA
GO:0008519
P55011 (UniProtKB)
IDA
GO:0015696
P55011 (UniProtKB)
IDA
GO:0015696
P55011 (UniProtKB)
IDA
GO:0016020
P55011 (UniProtKB)
TAS
GO:0016324
P55011 (UniProtKB)
IBA
GO:0030321
P55011 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
P55011 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
P55011 (UniProtKB)
IDA
GO:0070634
P55011 (UniProtKB)
IDA
GO:0072488
P55011 (UniProtKB)
IEA
GO:1902476
P55011 (UniProtKB)
IEA
GO:1902476
P55011 (UniProtKB)
IEA
GO:1903561
P55011 (UniProtKB)
IDA

可能调控 SLC12A2基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Hypertensive disease 0.200542884 5 0 BeFree_CTD_human_RGD
Epilepsy 0.120542884 3 0 BeFree_CTD_human
Epilepsy, Temporal Lobe 0.120271442 2 0 BeFree_CTD_human
Impaired glucose tolerance 0.12 1 0 CTD_human
Cardiovascular Diseases 0.12 1 0 CTD_human
Mammary Neoplasms, Experimental 0.12 1 0 CTD_human
Animal Mammary Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human
Prostatic Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human
Movement Disorders 0.12 1 0 CTD_human
Seizures 0.080542884 2 0 BeFree_RGD

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