SLAMF6 (SLAM family member 6)

symbol:
SLAMF6
locus group:
protein-coding gene
location:
1q23.2-q23.3
gene_family:
CD molecules|V-set domain containing|Immunoglobulin-like domain containing
alias symbol:
KALI|NTBA|KALIb|Ly108|SF2000|NTB-A|CD352
alias name:
None
entrez id:
114836
ensembl gene id:
ENSG00000162739
ucsc gene id:
uc001fwd.2
refseq accession:
NM_052931
hgnc_id:
HGNC:21392
approved reserved:
2003-10-29
1q23.2-q23.3
基因染色体位置图

SLAMF6(Signaling Lymphocytic Activation Molecule Family Member 6)属于SLAM(信号淋巴细胞激活分子)家族,该家族是一组主要在免疫细胞表面表达的受体蛋白,参与调节免疫细胞的激活和相互作用。SLAM家族成员的共性是它们具有免疫球蛋白样结构域,并通过同型或异型相互作用传递信号,通常与免疫调节、细胞间通讯和炎症反应相关。SLAMF6主要在T细胞、B细胞和自然杀伤(NK)细胞中表达,其配体是自身或其他免疫细胞上的SLAMF6或其他SLAM家族成员。SLAMF6通过其胞内段与SAP(SLAM-associated protein)等适配蛋白结合,激活下游信号通路,调节免疫细胞的增殖、分化和功能。在T细胞中,SLAMF6参与调节T细胞受体(TCR)信号,影响T细胞的激活和效应功能。在NK细胞中,它可能调节细胞毒性和细胞因子分泌。SLAMF6的突变或表达异常可能与自身免疫性疾病、慢性病毒感染和癌症有关。例如,SLAMF6的缺失或功能丧失可能导致免疫调节失衡,增加自身免疫疾病的风险,而某些病毒感染可能利用SLAMF6逃避免疫监视。SLAMF6过表达可能增强免疫细胞的激活,导致过度炎症反应或自身免疫损伤,而降低表达可能削弱免疫应答,增加感染或肿瘤发生的风险。SLAMF6在免疫检查点调控中也具有一定作用,可能影响免疫治疗的疗效。因此,SLAMF6是免疫调节网络中的重要分子,其功能异常与多种疾病相关,是潜在的免疫治疗靶点。

The protein encoded by this gene is a type I transmembrane protein, belonging to the CD2 subfamily of the immunoglobulin superfamily. This encoded protein is expressed on Natural killer (NK), T, and B lymphocytes. It undergoes tyrosine phosphorylation and associates with the Src homology 2 domain-containing protein (SH2D1A) as well as with SH2 domain-containing phosphatases (SHPs). It functions as a coreceptor in the process of NK cell activation. It can also mediate inhibitory signals in NK cells from X-linked lymphoproliferative patients. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding distinct isoforms.[provided by RefSeq, May 2010]

由该基因编码的蛋白质是I型跨膜蛋白,属于免疫球蛋白超家族的CD2亚科。该编码蛋白是在自然杀伤(NK),T和B淋巴细胞中表达。它经历酪氨酸磷酸化和相关联的Src同源2结构域的蛋白(SH2D1A)以及与含SH2结构域的磷酸酶(的SHP)。它用作在NK细胞活化的过程的辅助受体。它也可以从X连锁淋巴组织增生患者调解中NK细胞的抑制信号。在多个转录剪接变异体导致不同的编码亚型。[由RefSeq的,2010年5月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
SLAMF6基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs480348       rs614136       rs634791       rs678456       rs723155       rs1041067       rs1041068       rs1249548       rs1249550       rs1249551       rs1249552       rs1262039       rs1265883       rs1268524       rs1324735       rs1324736       rs1658415      

SLAMF6基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CACTCTGAGGATATTAAGACAACTG
59
GAGCTCACAGGTCATATTCTG
58
AGAGTATGTTTCAGTGTCTCCA
59
GTCCAGATTTCTGTTTCCCTG
59
AGAGTATGTTTCAGTGTCTCCA
59
GTCCAGATTTCTGTTTCCCTG
59
CACTCTGAGGATATTAAGACAACTG
59
GAGCTCACAGGTCATATTCTG
58
TAGAGTATGTTTCAGTGTCTCC
57
TCCAGATTTCTGTTTCCCTG
58
CTCTTACAGAGCCCAGATATCC
60
GTTCCTCAGTTGTCTTAATATCCTC
59
TAGAGTATGTTTCAGTGTCTCC
57
TCCAGATTTCTGTTTCCCTG
58
CTCTTACAGAGCCCAGATATCC
60
GTTCCTCAGTTGTCTTAATATCCTC
59
TCTTACAGAGCCCAGATATCC
59
GTTCCTCAGTTGTCTTAATATCCTC
59
AGAGTATGTTTCAGTGTCTCC
57
GTCCAGATTTCTGTTTCCCT
58
      尚未收录相关数据

SLAMF6基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SLAMF6基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0001779
Q96DU3 (UniProtKB)
IEA
GO:0001787
Q96DU3 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q96DU3 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q96DU3 (UniProtKB)
IPI
GO:0005886
Q96DU3 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
Q96DU3 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q96DU3 (UniProtKB)
TAS
GO:0016021
Q96DU3 (UniProtKB)
IEA
GO:0032729
Q96DU3 (UniProtKB)
IMP
GO:0032740
Q96DU3 (UniProtKB)
IDA
GO:0045087
Q96DU3 (UniProtKB)
IEA
GO:0045954
Q96DU3 (UniProtKB)
IDA
GO:0050776
Q96DU3 (UniProtKB)
TAS
GO:0070062
Q96DU3 (UniProtKB)
IDA
GO:0072540
Q96DU3 (UniProtKB)
IDA

可能调控 SLAMF6基因的相关microRNA:     

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Graves Disease 0.120271442 1 1 BeFree_GWASCAT
Encephalomyelitis 0.00272435 1 0 LHGDN
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Lupus Erythematosus, Systemic 0.001357209 5 0 BeFree
Lupus Erythematosus 0.000542884 2 0 BeFree
Lupus Vulgaris 0.000542884 2 0 BeFree
Lupus Erythematosus, Discoid 0.000542884 2 0 BeFree
Multiple Myeloma 0.000271442 1 0 BeFree
X-Linked Lymphoproliferative Disorder 0.000271442 1 0 BeFree
HIV Infections 0.000271442 1 0 BeFree

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。