SLA (Src like adaptor)

symbol:
SLA
locus group:
protein-coding gene
location:
8q24.22
gene_family:
SH2 domain containing
alias symbol:
SLA1|SLAP-1|hSLAP|SLAP
alias name:
None
entrez id:
6503
ensembl gene id:
ENSG00000155926
ucsc gene id:
uc003ytz.4
refseq accession:
NM_001045556
hgnc_id:
HGNC:10902
approved reserved:
1995-08-11
8q24.22
基因染色体位置图

SLA(Swine Leukocyte Antigen,猪白细胞抗原)是猪的主要组织相容性复合体(MHC),类似于人类的HLA(人类白细胞抗原)系统。SLA基因家族位于猪的第7号染色体上,包含三类主要基因:SLA-I类(如SLA-1、SLA-2、SLA-3)、SLA-II类(如SLA-DR、SLA-DQ、SLA-DP)和SLA-III类(如补体基因和炎症因子基因)。SLA-I类分子在所有有核细胞表面表达,负责将内源性抗原(如病毒蛋白)呈递给细胞毒性T细胞,触发免疫应答;SLA-II类分子主要在抗原呈递细胞(如树突状细胞、巨噬细胞)上表达,处理外源性抗原并激活辅助T细胞;SLA-III类基因则编码补体蛋白和炎症相关分子,参与非特异性免疫反应。SLA基因具有高度多态性(即存在大量变异形式),这种多样性帮助猪群识别更广泛的病原体。若SLA基因发生突变,可能导致抗原呈递功能异常,引发免疫缺陷、自身免疫病(如类风湿性关节炎)或对传染病的易感性增加(如猪繁殖与呼吸综合征PRRS)。SLA过表达可能增强免疫反应但可能引发过度炎症或自身免疫攻击;表达降低则可能导致免疫抑制或感染风险上升。SLA与猪的移植排斥反应密切相关,器官移植时需匹配供受体SLA类型以降低排斥。此外,某些SLA等位基因(如SLA-1*0401)与疾病抗性相关,而另一些(如SLA-DRB1*02)可能增加疾病易感性。SLA基因家族的核心共性是参与免疫识别和调控,通过抗原呈递桥梁连接先天与适应性免疫。研究SLA有助于优化猪疫苗设计、抗病育种及异种器官移植(如猪器官用于人体)。专业术语解释:多态性(Polymorphism)指同一基因存在多种变异形式;抗原呈递(Antigen presentation)是免疫细胞展示抗原片段以激活其他免疫细胞的过程;异种移植(Xenotransplantation)指跨物种的器官或组织移植。

None

SLA基因的碱基序列:[NCBI]
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SLA基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs2703000       rs2739153       rs2739172       rs2739173       rs3779962       rs4736618       rs7817183       rs10093650       rs11993576       rs16904810       rs62516002       rs72729508       rs72729509       rs75115079       rs75317236       rs75793403       rs76262793      

SLA基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTCTCATCTCATGACCCTGG
59
GGATTTCATGCTGTTTCCC
57
ATTCTTTCTTGTCCTTGCAGAG
59
CTGCTAGGAACGAGGAAGG
60
GACCAAGAAAGAGGTGGCT
60
TCCAGTCCACAGTCTTCTG
59
AACAGCATGAAATCCACCC
58
AAGGAAGTCGCTATCCAGTC
59
TACCATGGTCGTTCCAGTG
59
GAAGCCAAGATTTGTGCCC
60
GTGTGAAGGACTGGATAGC
58
GAAATCACACGCAGTTTCTC
58
TTGATGGATCCTGTACCCAC
59
CACTCTGAGCAAGCTTCTC
58
CGTGTGATTTCTGATGAAGGG
59
CATGGTAAACTCTGGCCAC
59
CTCATCTCATGACCCTGGG
59
GTGGATTTCATGCTGTTTCC
58
AACAGCATGAAATCCACCC
58
AAGGAAGTCGCTATCCAGTC
59
      尚未收录相关数据

SLA基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SLA基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005070
Q13239 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
Q13239 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q13239 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q13239 (UniProtKB)
IPI
GO:0005768
Q13239 (UniProtKB)
IEA
GO:0009967
Q13239 (UniProtKB)
IEA

可能调控 SLA基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Vitiligo 0.12 1 0 CTD_human
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Precursor Cell Lymphoblastic Leukemia Lymphoma 0.000271442 1 0 BeFree
Acute lymphocytic leukemia 0.000271442 1 0 BeFree
Duodenal Ulcer 0.000271442 1 0 BeFree

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