SKP2 (S-phase kinase associated protein 2)

symbol:
SKP2
locus group:
protein-coding gene
location:
5p13.2
gene_family:
F-box and leucine-rich repeat proteins
alias symbol:
FBXL1|FBL1|p45
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None
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6502
ensembl gene id:
ENSG00000145604
ucsc gene id:
uc003jkc.3
refseq accession:
NM_005983
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HGNC:10901
approved reserved:
1995-12-18
5p13.2
基因染色体位置图

SKP2(S期激酶相关蛋白2,S-phase kinase-associated protein 2)属于F-box蛋白家族,是SCF(Skp1-Cul1-F-box蛋白)泛素连接酶复合体的关键组分,负责通过泛素-蛋白酶体途径调控靶蛋白的降解。其表达产物主要功能是识别并结合磷酸化的底物蛋白(如细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂p27、p21等),促进它们的泛素化标记并降解,从而调控细胞周期进程(尤其是G1/S期转换)和细胞增殖。SKP2的作用位点集中在细胞核内,其活性依赖于与其他SCF复合体成员(如Skp1、Cul1)的相互作用。突变或功能丧失可能导致p27等蛋白异常积累,引发细胞周期阻滞或增殖抑制;而过表达则常见于多种癌症(如乳腺癌、前列腺癌、肺癌),与肿瘤细胞无限增殖、侵袭转移及不良预后相关。SKP2的异常表达还影响其他通路,如通过降解FOXO1(一种抑癌转录因子)促进肿瘤存活,或通过调控E2F1(细胞周期转录因子)影响DNA修复。若SKP2表达降低,细胞可能停滞在G1期,抑制肿瘤生长,但正常组织中过度抑制可能导致再生障碍。F-box蛋白家族的共性是通过保守的F-box结构域与Skp1结合,并利用可变底物识别域选择性靶向特定蛋白进行泛素化降解,从而广泛参与细胞周期、信号转导和代谢调控。目前针对SKP2的抗癌策略包括小分子抑制剂或基因沉默,但其全身性抑制可能带来毒性,需进一步研究组织特异性调控。

This gene encodes a member of the F-box protein family which is characterized by an approximately 40 amino acid motif, the F-box. The F-box proteins constitute one of the four subunits of ubiquitin protein ligase complex called SCFs (SKP1-cullin-F-box), which function in phosphorylation-dependent ubiquitination. The F-box proteins are divided into 3 classes: Fbws containing WD-40 domains, Fbls containing leucine-rich repeats, and Fbxs containing either different protein-protein interaction modules or no recognizable motifs. The protein encoded by this gene belongs to the Fbls class; in addition to an F-box, this protein contains 10 tandem leucine-rich repeats. This protein is an essential element of the cyclin A-CDK2 S-phase kinase. It specifically recognizes phosphorylated cyclin-dependent kinase inhibitor 1B (CDKN1B, also referred to as p27 or KIP1) predominantly in S phase and interacts with S-phase kinase-associated protein 1 (SKP1 or p19). In addition, this gene is established as a protooncogene causally involved in the pathogenesis of lymphomas. Alternative splicing of this gene generates three transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2011]

该基因编码在F-box蛋白家族,其特征是一个约40个氨基酸基序,在F-盒的成员。在F-box蛋白组成四个亚基蛋白泛素连接酶复合体称为SCFS(SKP1-滞-F-箱)中的其中一个功能的磷酸化依赖泛素化。在F-box蛋白被分为3类:Fbws含WD-40结构域,含有Fbls富含亮氨酸的重复序列,以及含有任一不同的蛋白质 - 蛋白质相互作用的模块或没有可识别的图案Fbxs。由该基因编码的蛋白质属于Fbls类;除了一架F-中,这种蛋白质包含10个串联富含亮氨酸重复。这种蛋白质是细胞周期蛋白A-CDK2 S期激酶的一个重要因素。它特异性识别磷酸化细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂1B(CDKN1B,也被称为p27蛋白或KIP1)主要在S期,并与S相激酶相关蛋白1(SKP1或P19)相互作用。另外,作为原癌因果涉及淋巴瘤的发病该基因被建立。该基因的可变剪接产生编码不同亚型3转录变异体。 [由RefSeq的,2011年7月提供]

SKP2基因的碱基序列:[NCBI]
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SKP2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs33671       rs33672       rs33673       rs33674       rs3804449       rs3899432       rs3913487       rs28362652       rs28362653       rs35748359       rs36232788       rs75356410       rs75603609       rs76300697       rs78529515       rs78936728       rs79182991      

SKP2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTTTCCAGGTGTTTCATGGG
59
CTTTAGCAGCTCAGGGAGG
60
TATGCACAGGAAGCACCTC
60
AAGTCTTGCTGGAATCCCA
59
CTATGCACAGGAAGCACCT
60
TCTTGCTGGAATCCCATCC
60
CTGAAGAGCAAAGGGAGTG
58
ATGAAACACCTGGAAAGTTCTC
59
TATGCACAGGAAGCACCTC
60
TCTTGCTGGAATCCCATCC
60
GCAAAGGGAGTGACAAAGAC
60
AGTCCCATGAAACACCTGG
60
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
E2F1
SKP2
Activation
E2F1
SKP2
Unknown
ELK1
SKP2
Unknown
ING4
SKP2
Repression
LEF1
SKP2
Unknown
MYCN
SKP2
Repression
SP1
SKP2
Activation
SP1
SKP2
Unknown
TCF4
SKP2
Unknown
VDR
SKP2
Repression

SKP2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SKP2基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
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D6RAG5 (UniProtKB)
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GO:1902916
Q13309 (UniProtKB)
IEA

可能调控 SKP2基因的相关microRNA:     

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Liver carcinoma 0.206524536 15 0 BeFree_CTD_human_LHGDN_RGD
ovarian neoplasm 0.122995792 3 0 BeFree_CTD_human_LHGDN
Diffuse Large B-Cell Lymphoma 0.120542884 2 0 BeFree_CTD_human
Medulloblastoma 0.12 1 0 CTD_human
Mammary Neoplasms 0.019341894 8 0 BeFree_LHGDN
Squamous cell carcinoma 0.018789078 13 0 BeFree_LHGDN
melanoma 0.01225461 7 1 BeFree_LHGDN
Neoplasm Metastasis 0.011973237 16 0 BeFree_LHGDN
Lung Neoplasms 0.011168843 5 0 BeFree_LHGDN
Malignant neoplasm of breast 0.010434343 23 0 BeFree_GAD

联系方式

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