SH3PXD2A-AS1 (SH3PXD2A antisense RNA 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SH3PXD2A-AS1
locus group:
non-coding RNA
location:
10q24.33
gene_family:
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None
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100505839
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NR_038940
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HGNC:45242
approved reserved:
2013-03-11

基因染色体位置

基因染色体位置

10q24.33
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

SH3PXD2A-AS1是一个长链非编码RNA（lncRNA）基因，位于人类染色体10q24.33区域，与SH3PXD2A基因的反义链重叠。它属于长链非编码RNA家族，这类RNA通常不编码蛋白质，但能通过调控其他基因的表达或参与染色质修饰等方式影响细胞功能。SH3PXD2A-AS1的具体生物学功能尚未完全明确，但研究表明它可能在肿瘤发生发展中发挥作用，例如通过调控细胞增殖、迁移或侵袭等过程影响癌症进展。在某些癌症中，如胃癌和乳腺癌，SH3PXD2A-AS1的表达水平异常升高或降低，提示其可能作为致癌或抑癌因子发挥作用。过表达SH3PXD2A-AS1可能促进肿瘤细胞的恶性行为，而降低其表达则可能抑制肿瘤生长或转移。此外，SH3PXD2A-AS1可能通过ceRNA机制（竞争性内源RNA）吸附微小RNA（miRNA），从而间接调控下游靶基因的表达。目前关于SH3PXD2A-AS1突变的研究较少，但lncRNA的突变或表达异常通常会影响其调控网络，可能导致疾病发生。SH3PXD2A-AS1所在的lncRNA基因家族成员普遍具有组织特异性表达模式，并在表观遗传调控、信号转导和细胞分化等过程中发挥重要作用。未来研究需要进一步揭示SH3PXD2A-AS1的精确分子机制及其在疾病诊断或治疗中的潜在应用价值。

None

无

OMIM数据库中对SH3PXD2A-AS1基因的介绍     Wikipedia数据库中对SH3PXD2A-AS1基因的介绍

基因序列

基因序列

SH3PXD2A-AS1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SH3PXD2A-AS1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1998294       rs2067560       rs4918046       rs6144057       rs6584569       rs7087563       rs7090045       rs7098365       rs7098795       rs7899942       rs7920154       rs10883904       rs10883905       rs11191791       rs11191792       rs11191793       rs11273508      

基因表达

基因表达

SH3PXD2A-AS1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTTGCTGAAAGATACTCATGC
58
CACATGGATCTCCACAGTG
58
CTTGCTGAAAGATACTCATGC
58
CACATGGATCTCCACAGTG
58
ACTTGCTGAAAGATACTCATGC
59
ACATGGATCTCCACAGTGC
60
ACTTGCTGAAAGATACTCATGC
59
ACATGGATCTCCACAGTGC
60
TCTTGCAGCCAATTCAACG
60
TGAAAGACAGAGGGTGGAG
59
TCTTGCAGCCAATTCAACG
60
TGAAAGACAGAGGGTGGAG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SH3PXD2A-AS1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SH3PXD2A-AS1基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SH3PXD2A-AS1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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