SGMS2 (sphingomyelin synthase 2)

symbol:
SGMS2
locus group:
protein-coding gene
location:
4q25
gene_family:
alias symbol:
MGC26963|SMS2
alias name:
None
entrez id:
166929
ensembl gene id:
ENSG00000164023
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uc003hyl.6
refseq accession:
NM_152621
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HGNC:28395
approved reserved:
2007-03-15
4q25
基因染色体位置图

SGMS2(sphingomyelin synthase 2)是一种编码鞘磷脂合成酶2的基因,属于鞘磷脂合成酶(SGMS)基因家族,该家族还包括SGMS1。SGMS家族的主要功能是催化鞘磷脂的合成,鞘磷脂是细胞膜的重要成分,参与细胞信号传导、膜稳定性和脂质代谢等过程。SGMS2主要在细胞的高尔基体和质膜中发挥作用,通过将神经酰胺和磷脂酰胆碱转化为鞘磷脂和二酰基甘油,从而调节细胞膜的脂质组成和信号分子的平衡。SGMS2的生物学功能与细胞增殖、凋亡、炎症反应以及胆固醇代谢密切相关。SGMS2的突变可能影响鞘磷脂的合成,进而导致细胞膜功能异常或信号传导紊乱,与多种疾病相关,如动脉粥样硬化、神经退行性疾病和癌症。研究表明,SGMS2的过表达可能增加鞘磷脂水平,促进细胞增殖和肿瘤发展,尤其在肝癌和结肠癌中表现明显;而SGMS2表达降低可能导致鞘磷脂合成不足,影响细胞膜完整性,增加细胞凋亡风险,并与某些神经系统疾病如阿尔茨海默病相关。此外,SGMS2的表达水平变化还可能影响其他脂质代谢相关基因,如ACAT1和SOAT1,从而进一步改变胆固醇代谢途径。SGMS2与SGMS1在功能上有部分重叠,但SGMS2在某些组织如肝脏和大脑中表达更高,可能具有更特异的生理作用。总体而言,SGMS2在脂质代谢和细胞稳态中扮演关键角色,其表达异常可能通过影响鞘磷脂平衡而参与多种疾病的发病机制。

Sphingomyelin, a major component of cell and Golgi membranes, is made by the transfer of phosphocholine from phosphatidylcholine onto ceramide, with diacylglycerol as a side product. The protein encoded by this gene is an enzyme that catalyzes this reaction primarily at the cell membrane. The synthesis is reversible, and this enzyme can catalyze the reaction in either direction. The encoded protein is required for cell growth. Three transcript variants encoding the same protein have been found for this gene. There is evidence for more variants, but the full-length nature of their transcripts has not been determined.[provided by RefSeq, Oct 2008]

鞘磷脂,细胞和高尔基体膜的主要成分,是由磷酸胆碱的从磷脂转移到神经酰胺,具有二酰基甘油作为副产物制成。由该基因编码的蛋白质是催化主要在细胞膜该反应的酶。合成是可逆的,并且这种酶能催化在任一方向进行反应。所编码的蛋白质是必需的细胞生长。已发现了该基因编码的蛋白质相同的三个抄本变形。有更多的变体的证据,但其转录物的全长性质尚未确定。[通过的RefSeq,2008年10月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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SGMS2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs975219       rs1120864       rs1160677       rs1389168       rs1493123       rs1873859       rs2017411       rs2047026       rs2131462       rs2341339       rs3079264       rs3996297       rs4088960       rs4619972       rs4956139       rs5860883       rs5860884      

SGMS2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGATAGGGTGAAATGGGCA
59
CCCACTATTGACTTGTATCTCAG
59
TGATAGGGTGAAATGGGCA
59
CCCACTATTGACTTGTATCTCAG
59
CTCCAAAGCTCAATGGAGAC
59
CCAGTTATGGACAATCCACC
58
CTCCAAAGCTCAATGGAGAC
59
CCAGTTATGGACAATCCACC
58
CCATTTGGGACCAACAGAG
59
CTTATGGACTCAGCCTCCC
59
CCATCTGGAAACAGTGGGA
59
CTATATGCTGTACCTTCACCAC
59
TTCATGGTGTTGAAGGTGG
58
CTATATGCTGTACCTTCACCA
57
GGCCCTATAACACTCTTCTC
57
GTTACTATCCCACCTTGGTC
57
TGATAGGGTGAAATGGGCA
59
CCCACTATTGACTTGTATCTCAG
59
CCTAAATTGAGAACAGCTGGG
59
GTTACTATCCCACCTTTGGC
58
      尚未收录相关数据

SGMS2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SGMS2基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
E5RJU3 (UniProtKB)
IEA
GO:0005794
Q8NHU3 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
Q8NHU3 (UniProtKB)
TAS
GO:0005887
Q8NHU3 (UniProtKB)
IDA
GO:0006686
Q8NHU3 (UniProtKB)
IDA
GO:0016301
Q8NHU3 (UniProtKB)
IEA
GO:0016310
Q8NHU3 (UniProtKB)
IEA
GO:0030148
Q8NHU3 (UniProtKB)
TAS
GO:0030173
Q8NHU3 (UniProtKB)
IDA
GO:0033188
Q8NHU3 (UniProtKB)
TAS
GO:0047493
Q8NHU3 (UniProtKB)
IDA

可能调控 SGMS2基因的相关microRNA:     

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Alcoholic Intoxication, Chronic 0.002367032 1 0 GAD
Atherosclerosis 0.000814326 3 0 BeFree
Arteriosclerosis 0.000814326 3 0 BeFree
Obesity 0.000542884 2 0 BeFree
Diabetes Mellitus, Non-Insulin-Dependent 0.000271442 1 0 BeFree
Steatohepatitis 0.000271442 1 0 BeFree
Fatty Liver 0.000271442 1 0 BeFree
Hyperinsulinism 0.000271442 1 0 BeFree

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

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