SENP3-EIF4A1 (SENP3-EIF4A1 readthrough (NMD candidate))

symbol:
SENP3-EIF4A1
locus group:
other
location:
17p13.1
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
100533955
ensembl gene id:
ENSG00000277957
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_037926
hgnc_id:
HGNC:49182
approved reserved:
2013-09-25
17p13.1
基因染色体位置图

SENP3-EIF4A1是一个融合基因,由SENP3(SUMO1/sentrin/SMT3特定肽酶3)和EIF4A1(真核翻译起始因子4A1)基因的部分序列融合而成。SENP3属于SUMO特异性蛋白酶家族,主要功能是去除SUMO(小泛素样修饰蛋白)修饰,调控蛋白质的稳定性、定位和功能。EIF4A1是eIF4F复合物的组成部分,负责在翻译起始阶段解开mRNA的二级结构。这个融合基因常见于某些癌症如急性髓系白血病(AML)和骨髓增生异常综合征(MDS),其表达产物保留了EIF4A1的解旋酶活性,同时可能受到SENP3的调控影响。融合基因导致EIF4A1的异常表达和功能增强,促进癌细胞的增殖和存活。SENP3-EIF4A1的突变或异常表达可能干扰正常的SUMO化修饰和翻译起始过程,进而影响细胞周期、DNA修复和凋亡等关键通路。过表达SENP3-EIF4A1会增强蛋白质合成,促进肿瘤发生,而降低其表达可能抑制肿瘤生长。SENP3属于SUMO蛋白酶家族,该家族成员通过调控SUMO化修饰参与多种细胞过程,如转录调控、信号转导和基因组稳定性。EIF4A1属于DEAD-box RNA解旋酶家族,该家族成员具有ATP依赖的RNA解旋酶活性,参与RNA代谢的多个步骤。SENP3-EIF4A1融合基因的发现为相关癌症的诊断和治疗提供了潜在靶点。

This locus represents naturally occurring read-through transcription between the neighboring SUMO1/sentrin/SMT3 specific peptidase 3 (SENP3) and eukaryotic translation initiation factor 4A1 (EIF4A1) genes on chromosome 17. The read-through transcript is a candidate for nonsense-mediated mRNA decay (NMD), and is thus unlikely to produce a protein product. [provided by RefSeq, Mar 2011]

此轨迹表示天然产生的通读转录相邻SUMO1 / sentrin / SMT3特异性肽酶3(SENP3)和真核翻译起始因子之间17号染色??体上4A1(EIF4A1)基因的通读转录为候选无义介导的mRNA降解(NMD),并且因此不太可能产生的蛋白质产物。 [由RefSeq的,2011年3月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
SENP3-EIF4A1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs3199620       rs3209632       rs3809719       rs8066907       rs12942088       rs61730294       rs77884230       rs111406511       rs111780760       rs112659619       rs113626456       rs113933507       rs114185215       rs115950468       rs117966698       rs138174210       rs139789270      

SENP3-EIF4A1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTCTGTTGATGTGAGGCGA
59
TGGCAATATGCTTAGGGCA
59
GCGTACAGAGCATCTTGGA
59
CAGCTTCTCTACTACCTCATCAG
59
CGTACAGAGCATCTTGGAC
58
AGCTTCTCTACTACCTCATCAG
58
      尚未收录相关数据

SENP3-EIF4A1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SENP3-EIF4A1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0006508
A0A087X0R7 (UniProtKB)
IEA
GO:0008234
A0A087X0R7 (UniProtKB)
IEA

可能调控 SENP3-EIF4A1基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。