SEMA4F (ssemaphorin 4F)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SEMA4F
locus group:
protein-coding gene
location:
2p13.1
gene_family:
Semaphorins
alias symbol:
SEMAW
alias name:
m-Sema M
entrez id:
10505
ensembl gene id:
ENSG00000135622
ucsc gene id:
uc002sna.3
refseq accession:
NM_004263
hgnc_id:
HGNC:10734
approved reserved:
1999-06-25

基因染色体位置

基因染色体位置

2p13.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

This gene encodes a transmembrane class IV semaphorin family protein, which plays a role in neural development. This gene may be involved in neurogenesis in prostate cancer, the development of neurofibromas, and breast cancer tumorigenesis. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Nov 2012]

这个基因编码的跨膜IV类脑信号蛋白家族蛋白，它在神经发育的作用。该基因可能参与神经发生的前列腺癌，神经纤维瘤的发展，和乳腺癌肿瘤发生。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [通过的RefSeq，2012十一月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SEMA4F基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs150139       rs205646       rs205647       rs205648       rs205649       rs205650       rs363607       rs363608       rs363609       rs363610       rs363611       rs363612       rs363613       rs363614       rs363615       rs363617       rs363618      

基因表达

基因表达

SEMA4F基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GCTTCCAATCTCTGTCTTCAG
59
ACGTCTCCTAGCTTCTTCC
59
TCTTCGCTTTATCCCTGCC
60
GGACACATCCTCTTTCTTGC
59
CGCTTCCAATCTCTGATTGAC
60
TGGTGATAATTGGCTCCGT
59
ACATGACTGCAACAGAGGA
59
ATGTTGTTGGTGATGCACTC
59
TCTTCGCTTTATCCCTGCC
60
GGACACATCCTCTTTCTTGC
59
TTCCAATCTCTGAGGCTGAC
60
AGGATCCACAAGGAGAACAG
59
TTTATCCCTGCCCTTCTCAG
59
ACATTCGTCCTCTTTCTTGC
59
GTTCTCCTTGTGGATCCTG
58
AACCATCCAGTCAATCCTG
57
TTTGTCCAGATTCTCGCCA
59
GAACCTGGACACATCAATAACC
59
TAAAGAGCCTGGAGAACGT
58
CTTGGAGAACATGGCAAGAC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SEMA4F基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SEMA4F基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0007411
A0A087WYZ7 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
A0A087WYZ7 (UniProtKB)
IEA
GO:0007411
B7Z931 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
B7Z931 (UniProtKB)
IEA
GO:0007411
C9JKW7 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
C9JKW7 (UniProtKB)
IEA
GO:0007411
C9K0A1 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
C9K0A1 (UniProtKB)
IEA
GO:0007411
F8WCP8 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
F8WCP8 (UniProtKB)
IEA
GO:0001755
O95754 (UniProtKB)
IBA
GO:0005615
O95754 (UniProtKB)
IBA
GO:0005783
O95754 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
O95754 (UniProtKB)
TAS
GO:0005887
O95754 (UniProtKB)
TAS
GO:0007267
O95754 (UniProtKB)
TAS
GO:0007399
O95754 (UniProtKB)
TAS
GO:0007411
O95754 (UniProtKB)
TAS
GO:0016020
O95754 (UniProtKB)
TAS
GO:0030215
O95754 (UniProtKB)
IBA
GO:0030335
O95754 (UniProtKB)
IBA
GO:0031290
O95754 (UniProtKB)
IEA
GO:0045211
O95754 (UniProtKB)
IEA
GO:0045499
O95754 (UniProtKB)
IBA
GO:0048843
O95754 (UniProtKB)
IBA
GO:0050919
O95754 (UniProtKB)
IBA
GO:0071526
O95754 (UniProtKB)
IBA
GO:0038191
O95754 (UniProtKB)
IBA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SEMA4F基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Prostate carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of prostate 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话： 0531-88819269

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