SEM1 (SEM1 26S proteasome subunit)

symbol:
SEM1
locus group:
protein-coding gene
location:
7q21.3
gene_family:
alias symbol:
DSS1|Shfdg1|ECD|SHSF1|FLJ42280|PSMD15
alias name:
deleted in split-hand/foot 1
entrez id:
7979
ensembl gene id:
ENSG00000127922
ucsc gene id:
uc003uoi.4
refseq accession:
NM_006304
hgnc_id:
HGNC:10845
approved reserved:
1991-08-20
7q21.3
基因染色体位置图

SEM1基因(也称为DSS1或SHFM1)属于26S蛋白酶体调控亚基家族,其编码的蛋白是26S蛋白酶体的重要组成部分。26S蛋白酶体是一种大型蛋白复合物,负责降解细胞内错误折叠或受损的蛋白质,这一过程称为泛素-蛋白酶体系统(Ubiquitin-Proteasome System, UPS),对维持细胞稳态至关重要。SEM1蛋白通过与蛋白酶体19S调控颗粒的Rpn7亚基结合,帮助稳定蛋白酶体结构并参与识别泛素化标记的靶蛋白。SEM1基因突变可能导致蛋白酶体功能受损,影响蛋白质降解效率,进而引发蛋白质毒性应激(proteotoxic stress),这与多种疾病相关。例如,SEM1的杂合缺失与人类分裂手/足畸形(Split-Hand/Foot Malformation, SHFM)相关,这是一种先天性肢体发育异常疾病;此外,SEM1的异常表达还与乳腺癌、前列腺癌等肿瘤的发生发展有关,可能通过影响细胞周期调控蛋白的降解来促进肿瘤增殖。SEM1基因过表达可能干扰蛋白酶体正常组装,导致错误蛋白积累;而表达降低则可能削弱蛋白酶体活性,引发神经退行性疾病(如帕金森病)中常见的蛋白聚集现象。该基因家族(蛋白酶体调控亚基家族)的共性是通过形成多亚基复合物参与泛素依赖性蛋白降解,调控细胞周期、DNA修复和应激反应等关键过程。术语解释:泛素化(ubiquitination)是指给靶蛋白添加泛素分子标记的过程,作为降解信号;蛋白酶体(proteasome)是执行蛋白降解的机器;杂合缺失(haploinsufficiency)指一个等位基因缺失导致蛋白量不足引发表型。目前中文对SEM1的翻译存在差异,需注意其别名DSS1(Deleted in Split-hand/Split-foot syndrome 1)或SHFM1。

The product of this gene has been localized within the split hand/split foot malformation locus SHFM1 at chromosome 7. It has been proposed to be a candidate gene for the autosomal dominant form of the heterogeneous limb developmental disorder split hand/split foot malformation type 1. In addition, it has been shown to directly interact with BRCA2. It also may play a role in the completion of the cell cycle. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因的产品已拆分手/拆分脚畸形座位SHFM1内的7号染色体的本地化已建议成为异构肢体发育障碍拆分手/拆分的常染色体显性遗传形式的候选基因足畸形类型1。此外,它已被证明直接与BRCA2交互。它也可以在细胞周期的完成发挥作用。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

SEM1基因的碱基序列:[NCBI]
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SEM1基因的碱基突变:           仅显示部分snp

SEM1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
      尚未收录相关数据

SEM1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SEM1基因的本体(GO)信息:

可能调控 SEM1基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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