SDK1 (sidekick cell adhesion molecule 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SDK1
locus group:
protein-coding gene
location:
7p22.2
gene_family:
Fibronectin type III domain containing|I-set domain containing|Immunoglobulin-like domain containing
alias symbol:
FLJ31425
alias name:
None
entrez id:
221935
ensembl gene id:
ENSG00000146555
ucsc gene id:
uc003smx.4
refseq accession:
NM_152744
hgnc_id:
HGNC:19307
approved reserved:
2002-11-08

基因染色体位置

基因染色体位置

7p22.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

SDK1（Sidekick Cell Adhesion Molecule 1）是一种细胞粘附分子，属于免疫球蛋白超家族（IgSF）中的Sidekick基因家族。该家族包括SDK1和SDK2两个成员，它们通过同源或异源相互作用介导细胞间的粘附，并在神经系统的发育和突触形成中发挥关键作用。SDK1主要表达于视网膜、大脑和脊髓等神经组织中，其蛋白产物是一种跨膜蛋白，包含多个免疫球蛋白样结构域和纤维连接蛋白III型重复序列，通过这些结构域与其他分子或细胞表面受体结合，参与神经回路的精确连接和突触特异性调控。SDK1的功能异常或突变可能导致神经发育障碍，如自闭症谱系障碍和精神分裂症等疾病。研究表明，SDK1的突变可能破坏其粘附功能，影响神经元迁移和突触可塑性，进而干扰神经网络的正常形成。SDK1的过表达可能增强细胞间的粘附，导致神经突起的异常生长或错误连接，而表达降低则可能削弱突触稳定性，影响学习记忆等认知功能。此外，SDK1还参与血管生成和肿瘤微环境的调控，其异常表达可能与某些癌症的进展和转移相关。Sidekick基因家族的共性在于它们都编码细胞表面粘附分子，具有高度保守的免疫球蛋白样结构域，并在神经系统发育中调控细胞识别和突触特异性。SDK1及其家族成员通过精细调控细胞间相互作用，对神经系统的发育和功能维持至关重要。

None

无

OMIM数据库中对SDK1基因的介绍     Wikipedia数据库中对SDK1基因的介绍

基因序列

基因序列

SDK1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SDK1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs582046       rs595545       rs597831       rs598632       rs612476       rs622731       rs622817       rs626138       rs632896       rs636392       rs638530       rs640406       rs651245       rs651659       rs653104       rs654384       rs665060      

基因表达

基因表达

SDK1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAGTGACTTACGAGTTCCG
58
CTTCCACTTGAGCTGACAC
59
TTTCATCATAGGTCCCACCT
58
GGAACTGTCTTCCAGAGCT
59
ACCACGTGGTGATTAAGGG
60
CTTCTTCCAAACGTAGCGG
59
GAATGTATAGCCAGTGCCAG
59
CTCCATTCCTCTTCCAGGT
58
TGAACCACTACATGAGCGA
59
AGGATAGCTACACTGTGCG
59
GGATGTAACCAATATCGCTCC
59
CTTAGAATGGCTGTCATCCC
58
GGATGTAACCAATATCGCTCC
59
CTTAGAATGGCTGTCATCCC
58
GAGTGACTTACGAGTTCCG
58
CTTCCACTTGAGCTGACAC
59
CGCCTATAACATCATCGGC
59
AGGGACAGGATCTGATCAG
58
ATGTATAGCCAGTGCCAGG
59
TCACTCCATTCCTCTTCCA
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SDK1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SDK1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
A0A087WTQ6 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
F8W6X9 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q7Z5N4 (UniProtKB)
IEA
GO:0007156
Q7Z5N4 (UniProtKB)
ISS
GO:0007416
Q7Z5N4 (UniProtKB)
ISS
GO:0010842
Q7Z5N4 (UniProtKB)
ISS
GO:0016021
Q7Z5N4 (UniProtKB)
IEA
GO:0030054
Q7Z5N4 (UniProtKB)
IEA
GO:0042802
Q7Z5N4 (UniProtKB)
ISS
GO:0045202
Q7Z5N4 (UniProtKB)
ISS
GO:0048148
Q7Z5N4 (UniProtKB)
IEA
GO:0060998
Q7Z5N4 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
Q7Z5N4 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SDK1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Motion Sickness 0.12 1 2 GWASCAT
AIDS-Associated Nephropathy 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Hypertensive disease 0.002638474 1 1 BeFree_GAD
Cerebral Hemorrhage 0.002367032 1 0 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Cerebrovascular accident 0.002367032 1 0 GAD
Mental disorders 0.002367032 1 0 GAD
Subarachnoid Hemorrhage 0.002367032 1 0 GAD
Intracranial Hemorrhages 0.002367032 1 0 GAD
Malignant mesothelioma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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