SDF2L1 (stromal cell derived factor 2 like 1)

symbol:
SDF2L1
locus group:
protein-coding gene
location:
22q11.21
gene_family:
alias symbol:
AP000553.C22.4|OTTHUMT00000075032
alias name:
dihydropyrimidinase-like 2|PWP1-in…
entrez id:
23753
ensembl gene id:
ENSG00000128228
ucsc gene id:
uc002zvf.4
refseq accession:
NM_022044
hgnc_id:
HGNC:10676
approved reserved:
1999-10-29
22q11.21
基因染色体位置图

SDF2L1(Stromal cell-derived factor 2-like 1)属于SDF2基因家族,该家族成员编码内质网(ER,细胞内负责蛋白质合成和折叠的细胞器)相关蛋白,参与蛋白质质量控制(确保蛋白质正确折叠和组装的过程)。SDF2L1在内质网中表达,其功能与伴侣蛋白(帮助其他蛋白质正确折叠的辅助蛋白)类似,可能参与未折叠蛋白反应(UPR,细胞应对错误折叠蛋白质的应激机制)。该基因的生物学功能尚未完全明确,但研究表明它可能在细胞应激反应、免疫调节及肿瘤发生中发挥作用。SDF2L1的主要作用位点是内质网,通过与未折叠或错误折叠的蛋白质相互作用,协助其正确折叠或靶向降解(通过蛋白酶体等途径分解异常蛋白质)。若SDF2L1发生功能丧失性突变(突变导致蛋白质功能减弱或消失),可能导致内质网应激加剧,引发细胞凋亡(程序性细胞死亡)或与神经退行性疾病(如阿尔茨海默病)相关;而某些突变可能影响其与客户蛋白的结合能力,导致蛋白质稳态(细胞内蛋白质平衡状态)紊乱。SDF2L1的异常表达与多种疾病相关,例如在乳腺癌中可能过表达,促进肿瘤细胞存活;在神经系统中表达异常可能与神经发育障碍有关。若SDF2L1过表达,可能增强细胞对内质网应激的耐受性,但长期可能促进肿瘤进展;若表达降低,则可能导致错误折叠蛋白积累,触发细胞凋亡或炎症反应。SDF2L1基因家族(SDF2 family)的共性包括编码内质网定位蛋白、参与蛋白质折叠调控及应激反应,成员间具有保守的序列和功能结构域(蛋白质中具有特定功能的区域)。目前针对SDF2L1的研究较少,其具体机制和临床关联仍需进一步探索。

None

SDF2L1基因的碱基序列:[NCBI]
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SDF2L1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1947       rs440367       rs861848       rs861849       rs5998835       rs8137888       rs9284515       rs9609947       rs11306247       rs11555535       rs12484001       rs13054355       rs28436610       rs56729650       rs61739341       rs73166641       rs75329949      

SDF2L1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GACATCAAATACGGATCCGG
58
AGTAGCTATTGGCGTCGTC
59
AACAACCAGGAGGTGAGTG
59
ACTGACAGGAACACAGAGG
59
AACAACCAGGAGGTGAGTG
59
CTGACAGGAACACAGAGGT
59
CATCAAATACGGATCCGGC
58
AGTAGCTATTGGCGTCGTC
59
ATCAAATACGGATCCGGCA
59
AGTAGCTATTGGCGTCGTC
59
AACAACCAGGAGGTGAGTG
59
TGACAGGAACACAGAGGTG
59
      尚未收录相关数据

SDF2L1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SDF2L1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000032
Q9HCN8 (UniProtKB)
IBA
GO:0005788
Q9HCN8 (UniProtKB)
IEA
GO:0007275
Q9HCN8 (UniProtKB)
IBA
GO:0031502
Q9HCN8 (UniProtKB)
IBA
GO:0034663
Q9HCN8 (UniProtKB)
IEA
GO:0035269
Q9HCN8 (UniProtKB)
IEA
GO:0042981
Q9HCN8 (UniProtKB)
IEA
GO:0044845
Q9HCN8 (UniProtKB)
IBA
GO:0051087
Q9HCN8 (UniProtKB)
IEA
GO:0051117
Q9HCN8 (UniProtKB)
IEA
GO:0051787
Q9HCN8 (UniProtKB)
IEA
GO:0071712
Q9HCN8 (UniProtKB)
IEA
GO:1900101
Q9HCN8 (UniProtKB)
IBA
GO:0004169
Q9HCN8 (UniProtKB)
IBA

可能调控 SDF2L1基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Spontaneous abortion 0.12 1 0 CTD_human
Prostatic Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human
Schizophrenia 0.000542884 2 0 BeFree

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