SCHLAP1 (SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SCHLAP1
locus group:
non-coding RNA
location:
2q31.3
gene_family:
Long non-coding RNAs (published)
alias symbol:
PCAT11
alias name:
Second Chromosome Locus Associated…
entrez id:
101669767
ensembl gene id:
ENSG00000281131
ucsc gene id:
None
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NR_104323
hgnc_id:
HGNC:48603
approved reserved:
2013-05-21

基因染色体位置

基因染色体位置

2q31.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

SCHLAP1（Second Chromosome Locus Associated with Prostate-1）是一种长链非编码RNA（lncRNA）基因，位于人类第2号染色体上。它在多种癌症中表现出异常表达，尤其在侵袭性前列腺癌中显著过表达，被认为是癌症进展和转移的潜在驱动因子。SCHLAP1的生物学功能主要涉及调控基因表达和染色质重塑，它通过干扰SWI/SNF染色质重塑复合物的功能来影响下游基因的转录，从而促进肿瘤细胞的增殖、迁移和侵袭。SCHLAP1还通过竞争性结合某些miRNA或蛋白质来干扰正常的细胞信号通路，例如它可能抑制肿瘤抑制基因如p53或PTEN的功能。突变或异常表达SCHLAP1与多种癌症的不良预后相关，特别是在前列腺癌中，其高表达与更高的Gleason评分、转移风险和患者生存率降低密切相关。SCHLAP1属于长链非编码RNA基因家族，这类RNA通常不编码蛋白质，但通过调控表观遗传修饰、转录和转录后过程来影响细胞功能。当SCHLAP1过表达时，它会促进肿瘤的恶性表型，如增强细胞迁移和侵袭能力，同时可能抑制凋亡途径；而降低其表达则可能抑制肿瘤生长和转移。研究还表明，SCHLAP1可能与其他致癌基因（如MYC或AR）协同作用，进一步加剧癌症进展。由于其在前列腺癌和其他癌症中的关键作用，SCHLAP1已成为潜在的诊断标志物和治疗靶点。

None

无

OMIM数据库中对SCHLAP1基因的介绍     Wikipedia数据库中对SCHLAP1基因的介绍

基因序列

基因序列

SCHLAP1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SCHLAP1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1002498       rs1025126       rs1025127       rs1030310       rs1406262       rs1528444       rs1528445       rs1950028       rs2049710       rs7556967       rs7571457       rs7571765       rs12693254       rs13013206       rs13029379       rs13400001       rs13411336      

基因表达

基因表达

SCHLAP1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCATTCTTGAAGTGAGTGAGAC
58
TTCAGAATATTGATGGCACCTG
59
GCTTCATTCTTGAAGTGAGTG
58
AGAATATTGATGGCACCTGAG
58
CTTCATTCTTGAAGTGAGTGAGAC
60
CAGAATATTGATGGCACCTGAG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SCHLAP1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SCHLAP1基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SCHLAP1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Neoplasm Metastasis 0.120814326 3 0 BeFree_CTD_human
Prostatic Neoplasms 0.120271442 2 0 BeFree_CTD_human
Malignant neoplasm of prostate 0.000814326 3 0 BeFree
Prostate carcinoma 0.000814326 3 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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