SCG3 (secretogranin III)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SCG3
locus group:
protein-coding gene
location:
15q21.2
gene_family:
Granins
alias symbol:
SgIII|FLJ90833
alias name:
None
entrez id:
29106
ensembl gene id:
ENSG00000104112
ucsc gene id:
uc002abh.4
refseq accession:
NM_013243
hgnc_id:
HGNC:13707
approved reserved:
2000-10-18

基因染色体位置

基因染色体位置

15q21.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

SCG3（Secretogranin III，分泌颗粒蛋白III）属于分泌颗粒蛋白（granin）家族，该家族成员（如嗜铬粒蛋白、分泌粒蛋白等）共同特点是富含酸性氨基酸，存在于神经内分泌细胞的分泌颗粒中，参与调节激素和神经肽的合成、储存与释放。SCG3主要在神经内分泌系统（如下丘脑、垂体、胰腺）高表达，其编码的蛋白质作为分子伴侣协助前激素（如胰岛素原、脑啡肽原）的正确折叠和分选，并影响分泌颗粒的形成。SCG3的突变可能导致激素加工异常，例如小鼠模型中SCG3缺失会引发血糖调节紊乱，暗示其与糖尿病潜在关联。过表达SCG3可能干扰其他granin家族成员（如嗜铬粒蛋白A）的功能，导致分泌颗粒过度积累或激素释放失调；而表达降低则可能减少激素分泌效率，影响代谢平衡。研究发现SCG3在阿尔茨海默病患者的脑脊液中水平升高，可能与β-淀粉样蛋白沉积相关，但具体机制尚不明确。此外，SCG3在部分神经内分泌肿瘤（如胰岛素瘤）中异常高表达，可能作为生物标志物。该基因家族（granin family）的共性包括：调控分泌途径、钙离子结合能力以及通过蛋白水解产生具有生物活性的小肽。专业术语解释：分子伴侣（chaperone）——帮助其他蛋白质正确折叠的辅助蛋白；分泌颗粒（secretory granule）——细胞内储存激素待释放的囊泡结构。

The protein encoded by this gene is a member of the chromogranin/secretogranin family of neuroendocrine secretory proteins. Granins may serve as precursors for biologically active peptides. Some granins have been shown to function as helper proteins in sorting and proteolytic processing of prohormones; however, the function of this protein is unknown. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2009]

由该基因编码的蛋白质是神经内分泌分泌蛋白的嗜铬/ secretogranin家族的一个成员。 Granins可作为生物活性肽的前体。一些granins已被证明在分选和激素原的蛋白水解加工为辅助蛋白的功能;然而，该蛋白质的功能是未知的。已发现该基因编码不同亚型的两个转录变异体。 [由RefSeq的，2009年09月提供]

OMIM数据库中对SCG3基因的介绍     Wikipedia数据库中对SCG3基因的介绍

基因序列

基因序列

SCG3基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SCG3基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs544023       rs1531156       rs1531157       rs2168474       rs2305720       rs2305721       rs2414115       rs2445783       rs2606146       rs2607117       rs2607118       rs2607119       rs2607120       rs2607121       rs2607122       rs2622773       rs2622774      

基因表达

基因表达

SCG3基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATGAACAGATTGCTGAAGCAG
59
AGAATAGTTGCTCTGACCTGG
60
TGAAATGATTGCTCTTCAGACC
59
TCTTCTCTGATGGTGCTGG
59
CAGAGAAAGTGACTCCAATGG
59
GCCATTTGTCAAGGTTAATGTG
59
GAAATGATTGCTCTTCAGACCA
59
TCTTCTCTGATGGTGCTGG
59
GAGAAAGTGACTCCAATGGC
59
GCCATTTGTCAAGGTTAATGTG
59
AATGAACAGATTGCTGAAGC
57
GAATAGTTGCTCTGACCTGG
58
AGAAAGTGACTCCAATGGCA
60
GCCATTTGTCAAGGTTAATGTG
59
AATGATTGCTCTTCAGACCA
57
CTCTTCTCTGATGGTGCTG
58
ATGAACAGATTGCTGAAGCA
58
GAATAGTTGCTCTGACCTGG
58

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
REST
SCG3
Unknown
19118055

基因本体信息

SCG3基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SCG3基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0002576
Q8WXD2 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
Q8WXD2 (UniProtKB)
TAS
GO:0030658
Q8WXD2 (UniProtKB)
IEA
GO:0031410
Q8WXD2 (UniProtKB)
IBA
GO:0034774
Q8WXD2 (UniProtKB)
TAS
GO:0044822
Q8WXD2 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SCG3基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Obesity 0.002909916 2 0 BeFree_GAD
Asthma 0.002367032 1 1 GAD
Neuroblastoma 0.000271442 1 0 BeFree
Oxyphilic Adenoma 0.000271442 1 0 BeFree
Adenoma 0.000271442 1 0 BeFree
Hurthle Cell Tumor 0.000271442 1 0 BeFree
Oncocytic Neoplasm 0.000271442 1 0 BeFree
Liver carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Alzheimer's Disease 0.000271442 1 0 BeFree
Central neuroblastoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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