SCART1 (scavenger receptor family member expressed on T cells 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SCART1
locus group:
protein-coding gene
location:
10q26.3
gene_family:
None
alias symbol:
CD163c-alpha
alias name:
None
entrez id:
619207
ensembl gene id:
ENSG00000214279
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None
refseq accession:
NM_001396050
hgnc_id:
HGNC:32411
approved reserved:
2017-02-28

基因染色体位置

基因染色体位置

10q26.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

SCART1（Secreted and Transmembrane 1）属于SCART基因家族，该家族编码的蛋白质通常具有分泌型和跨膜型的结构特征，参与细胞间通讯和信号传导。SCART1基因主要在中枢神经系统和免疫系统中表达，其编码的蛋白质可能参与神经发育和免疫调节过程。SCART1蛋白通过与细胞表面受体或其他信号分子相互作用，调控细胞增殖、分化和迁移。该基因家族的共性包括编码的蛋白质多含有信号肽序列，能够分泌到细胞外或锚定在细胞膜上，并在多种生理过程中发挥作用。SCART1的突变可能导致其功能异常，与某些神经系统疾病或免疫相关疾病的发生有关。例如，SCART1的表达异常可能影响神经元的正常发育或免疫细胞的活性，进而导致疾病表型。SCART1过表达可能增强其参与的信号通路活性，导致细胞过度增殖或迁移，可能与肿瘤发生或自身免疫疾病相关。相反，SCART1表达降低可能削弱相关信号传导，影响神经或免疫系统的正常功能。目前关于SCART1的研究仍在深入，其在疾病中的具体作用机制和潜在治疗靶点的价值有待进一步探索。

None

None

OMIM数据库中对SCART1基因的介绍     Wikipedia数据库中对SCART1基因的介绍

基因序列

基因序列

SCART1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SCART1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs880282       rs880283       rs880284       rs2094640       rs2243812       rs2243909       rs2255518       rs2492654       rs2492655       rs7894325       rs11101764       rs11817058       rs12415486       rs34222160       rs73395365       rs74162023       rs78567575      

基因表达

基因表达

SCART1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AAGTGTGGTGAAGGTGGAC
60
CCTCCAGGAGGTTAGACAC
59
CGTCGTCAGGAAGTACCTG
60
GTTGTTGTCCAGTCTGCAG
59
TCAGGTGCTCAGAGTTCAG
59
CATCTGCTATGTCCCAGTG
58
GTCTTCTGCTCAGAGTCGG
60
AGGTCCCATTGTAGAACACG
60
TCTGATTCTGCCTCGAGTC
59
AGATACCTCGGATCTTCCC
58
TTCTGATTCTGCCTCGAGTC
60
GATACCTCGGATCTTCCCAG
59
GTCTTCTGCTCAGAGTCGG
60
TCCCATTGTAGAACACGTCC
60
GAAGTGTGGTGAAGGTGGA
60
TCCAGGAGGTTAGACACCT
59
TCAGGTGCTCAGAGTTCAG
59
ATCTGCTATGTCCCAGTGG
59
GTCGTCAGGAAGTACCTGG
60
AGTTGTTGTCCAGTCTGCA
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SCART1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SCART1基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SCART1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Mycoses 0.000271442 1 0 BeFree
Dermatitis 0.000271442 1 0 BeFree
Inflammatory Bowel Diseases 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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