SCAMP3 (secretory carrier membrane protein 3)

symbol:
SCAMP3
locus group:
protein-coding gene
location:
1q22
gene_family:
Secretory carrier membrane proteins
alias symbol:
None
alias name:
Propin 1
entrez id:
10067
ensembl gene id:
ENSG00000116521
ucsc gene id:
uc001fjs.4
refseq accession:
NM_005698
hgnc_id:
HGNC:10565
approved reserved:
1999-05-21
1q22
基因染色体位置图

SCAMP3(分泌载体膜蛋白3,Secretory Carrier Membrane Protein 3)属于SCAMP基因家族,该家族包含四个成员(SCAMP1-4),主要参与细胞内膜运输和分泌过程。SCAMPs是一类跨膜蛋白,定位于高尔基体、内体和质膜等膜性细胞器,负责调控囊泡运输、胞吐作用(exocytosis,即细胞释放物质的过程)以及受体循环。SCAMP3在多种组织中表达,尤其在分泌活跃的细胞(如神经元、内分泌细胞)中丰度较高。其功能包括介导蛋白质和脂质的定向运输,参与突触小泡(synaptic vesicles)的再生以及细胞表面受体的内吞(endocytosis,即细胞将膜表面物质摄入内部的过程)。SCAMP3的突变可能破坏膜运输平衡,导致分泌异常或信号转导紊乱。例如,SCAMP3缺失会损害胰岛素颗粒的释放,与2型糖尿病相关;而过表达可能加速囊泡循环,影响神经递质释放,与神经系统疾病(如癫痫)存在潜在关联。SCAMP基因家族的共性为含有保守的SCAMP结构域(SCAMP homology domain),该结构域参与蛋白质相互作用和膜融合调控。SCAMP3表达异常还可能影响其他运输相关基因(如Rab GTPases、SNAREs)的功能,导致细胞内运输网络失调。目前研究还发现SCAMP3与某些癌症(如乳腺癌)的转移相关,可能通过调控表皮生长因子受体(EGFR)的内吞来影响肿瘤细胞的侵袭性。

This gene encodes an integral membrane protein that belongs to the secretory carrier membrane protein family. The encoded protein functions as a carrier to the cell surface in post-golgi recycling pathways. This protein is also involved in protein trafficking in endosomal pathways. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene.[provided by RefSeq, May 2011]

None

SCAMP3基因的碱基序列:[NCBI]
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SCAMP3基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs3887       rs3887       rs1049090       rs1049090       rs2990237       rs2990237       rs41264935       rs41264935       rs78504589       rs78504589       rs111367678       rs111367678       rs114539447       rs114539447       rs138254335       rs138254335       rs139015683      

SCAMP3基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AACATGGCTCAGAGCAGAG
60
AGGGTTGTAGACGTCAAGC
60
TTCCAGGACATCTCCATGG
59
ATCCAGCCAACATCCAGAG
60
CTATCCTCTGGGTCCTCCT
59
AGATCCAGCCACTGAATCC
59
TGAAGAAACAGGAGGAGCTC
60
TTCTGTCGAGTAGCTGTGC
60
CTATCCTCTGGGTCCTCCT
59
AGATCCAGCCACTGAATCC
59
GTATAAGGCTTTCCGGAGTG
58
GACAAAGAGCACATCCTGG
59
CATGCTGAAACGGATCCAC
59
TTGGAGAAGACACCAGCAG
60
TGGAGGAAGTTACAGGCAG
59
GGATAGAAAGCCCAAAGCC
59
CTATCCTCTGGGTCCTCCT
59
AGATCCAGCCACTGAATCC
59
ATTGGTATCCCAGTGGCTG
60
CAGCAATGCCAGTGAAGAG
59
      尚未收录相关数据

SCAMP3基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SCAMP3基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000139
O14828 (UniProtKB)
IEA
GO:0006892
O14828 (UniProtKB)
TAS
GO:0015031
O14828 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
O14828 (UniProtKB)
IEA
GO:0031625
O14828 (UniProtKB)
IPI
GO:0032526
O14828 (UniProtKB)
IEA
GO:0043231
O14828 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
O14828 (UniProtKB)
IDA

可能调控 SCAMP3基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Crohn Disease 0.122367032 1 2 GAD_GWASCAT

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