SC5D (sterol-C5-desaturase)

symbol:
SC5D
locus group:
protein-coding gene
location:
11q23.3-q24.1
gene_family:
Fatty acid hydroxylase domain containing
alias symbol:
None
alias name:
lathosterol oxidase|delta(7)-stero…
entrez id:
6309
ensembl gene id:
ENSG00000109929
ucsc gene id:
uc001pxu.4
refseq accession:
NM_001024956
hgnc_id:
HGNC:10547
approved reserved:
1996-08-12
11q23.3-q24.1
基因染色体位置图

SC5D基因编码固醇C5-去饱和酶(sterol-C5-desaturase),属于固醇去饱和酶基因家族(sterol desaturase family),该家族成员主要参与胆固醇和类固醇生物合成途径中的氧化还原反应,通过催化特定碳位点的去饱和作用形成双键。SC5D的生物学功能是将羊毛固醇(lanosterol)转化为7-脱氢胆固醇(7-dehydrocholesterol),这是胆固醇合成和维生素D3前体生成的关键步骤。其表达产物为内质网定位的膜结合蛋白,作用位点集中于肝脏、皮肤和性腺等固醇代谢活跃的组织。SC5D基因突变可导致先天性胆固醇合成障碍,如常染色体隐性遗传病——lathosterolosis(拉托固醇沉积症),表现为发育迟缓、小头畸形、肝脾肿大及多系统异常,这是由于突变使酶活性丧失,造成羊毛固醇和拉托固醇(lathosterol)堆积,同时7-脱氢胆固醇减少,影响细胞膜结构和类固醇激素合成。SC5D过表达可能通过加速胆固醇合成途径导致高胆固醇血症,或增加维生素D3前体水平影响钙磷代谢;而表达降低则可能引发胆固醇缺乏,干扰细胞膜完整性及信号转导。该基因家族(如SC4MOL、SC5DL等)的共性为依赖细胞色素b5和NADH作为辅因子,催化固醇类底物的特定位置去饱和。SC5D与SC4MOL协同调控胆固醇合成中间产物的流向,其表达异常可能间接影响其他固醇代谢酶(如DHCR7)的功能,导致代谢网络失衡。目前"lathosterolosis"在中文文献中尚无统一译名,建议保留英文术语或译为"拉托固醇沉积症"(原英文:lathosterolosis)。

This gene encodes an enzyme of cholesterol biosynthesis. The encoded protein catalyzes the conversion of lathosterol into 7-dehydrocholesterol. Mutations in this gene have been associated with lathosterolosis. Alternatively spliced transcript variants encoding the same protein have been described. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基??因编码胆固醇生物合成的酶。所编码的蛋白质催化的lathosterol成7-脱氢的转换。在这种基因突变与lathosterolosis相关联。编码相同蛋白质可变剪接转录物变体已有描述。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

SC5D基因的碱基序列:[NCBI]
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SC5D基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs727422       rs751417       rs891435       rs891441       rs1061332       rs2060007       rs2060008       rs2115925       rs3741013       rs5795265       rs7112214       rs7119076       rs7119172       rs7125671       rs7928868       rs7929848       rs7929905      

SC5D基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTGGAGATAAGAGGTTACAGCA
59
ACAATCCATATGGAAACTCTCC
58
TGAAAGTCTGCTGTAGATGAG
58
GACCCATCTCTGATCACTCC
59
AAGCGCCTACATAAACCTC
58
AAGCATGACTTGCAAATGGA
59
TTTCCATTACACAAGGTGGT
57
TTCTTACAGCCATTTCCGTC
58
AAGCGCCTACATAAACCTC
58
AAGCATGACTTGCAAATGG
57
TTTCCATTACACAAGGTGGT
57
TTCTTACAGCCATTTCCGT
57
CTGGAGATAAGAGGTTACAGC
58
ACAATCCATATGGAAACTCTCC
58
CTGAAAGTCTGCTGTAGATGAG
59
ACCCATCTCTGATCACTCC
58
TTAAAGAATCAAGTCCGTCGAG
59
TACTTATCCATGGCAATGCCT
60
TTTCCATTACACAAGGTGGT
57
TCTTACAGCCATTTCCGTC
58
      尚未收录相关数据

SC5D基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SC5D基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005506
E9PPW5 (UniProtKB)
IEA
GO:0006633
E9PPW5 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
E9PPW5 (UniProtKB)
IEA
GO:0016491
E9PPW5 (UniProtKB)
IEA
GO:0055114
E9PPW5 (UniProtKB)
IEA
GO:0005506
E9PQ91 (UniProtKB)
IEA
GO:0006633
E9PQ91 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
E9PQ91 (UniProtKB)
IEA
GO:0016491
E9PQ91 (UniProtKB)
IEA
GO:0055114
E9PQ91 (UniProtKB)
IEA
GO:0000248
O75845 (UniProtKB)
EXP
GO:0000248
O75845 (UniProtKB)
EXP
GO:0005506
O75845 (UniProtKB)
IEA
GO:0005789
O75845 (UniProtKB)
TAS
GO:0005789
O75845 (UniProtKB)
TAS
GO:0005789
O75845 (UniProtKB)
TAS
GO:0006629
O75845 (UniProtKB)
TAS
GO:0006633
O75845 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
O75845 (UniProtKB)
IEA
GO:0033489
O75845 (UniProtKB)
TAS
GO:0033490
O75845 (UniProtKB)
TAS
GO:0055114
O75845 (UniProtKB)
IEA

可能调控 SC5D基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Lathosterolosis 0.560542884 4 3 BeFree_CLINVAR_CTD_human_MGD_ORPHANET_UNIPROT
Liver diseases 0.12 1 0 CTD_human
Intellectual Disability 0.12 1 0 CTD_human
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Rheumatoid Arthritis 0.002367032 1 1 GAD
Malignant neoplasm of prostate 0.000271442 1 0 BeFree
Congenital Abnormality 0.000271442 1 0 BeFree
Cleft Palate 0.000271442 1 0 BeFree
Prostate carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Micrognathism 0.000271442 1 0 BeFree

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