SART3 (spliceosome associated factor 3, U4/U6 recycling protein)

symbol:
SART3
locus group:
protein-coding gene
location:
12q23.3
gene_family:
RNA binding motif containing
alias symbol:
KIAA0156|RP11-13G14|TIP110|p110
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HIV-1 Tat-interacting protein of 1…
entrez id:
9733
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ENSG00000075856
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uc001tmz.2
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NM_014706
hgnc_id:
HGNC:16860
approved reserved:
2001-12-17
12q23.3
基因染色体位置图

SART3(Squamous Cell Carcinoma Antigen Recognized by T Cells 3)是一种位于人类12号染色体上的基因,属于SART基因家族。该家族成员主要参与RNA剪接(RNA splicing,即从初始RNA中去除内含子并连接外显子的过程)和肿瘤抗原的呈现。SART3基因编码的蛋白质是一种RNA结合蛋白,在细胞核中发挥作用,参与剪接体的组装(剪接体是执行RNA剪接的复合物),并可能在细胞周期调控中起作用。SART3蛋白在多种组织中表达,但在某些肿瘤细胞中表达水平较高,因此被研究作为潜在的肿瘤标志物或免疫治疗靶点。SART3的突变可能影响其RNA剪接功能,导致异常的基因表达模式,进而可能促进肿瘤发生或发展。研究表明,SART3在某些癌症如头颈部鳞状细胞癌、肺癌和食管癌中过表达,可能与肿瘤的恶性进展相关。过表达SART3可能通过干扰正常的RNA剪接过程或影响细胞周期调控,促进细胞增殖和肿瘤生长。相反,降低SART3表达可能抑制肿瘤细胞的生长和存活,但也可能影响正常细胞的RNA剪接功能,导致细胞功能障碍。SART3基因家族的其他成员如SART1也参与RNA代谢和肿瘤免疫应答,显示出在RNA处理和免疫调控中的共性作用。目前对SART3的研究仍在深入,其在癌症诊断和治疗中的潜在应用价值有待进一步探索。

The protein encoded by this gene is an RNA-binding nuclear protein that is a tumor-rejection antigen. This antigen possesses tumor epitopes capable of inducing HLA-A24-restricted and tumor-specific cytotoxic T lymphocytes in cancer patients and may be useful for specific immunotherapy. This gene product is found to be an important cellular factor for HIV-1 gene expression and viral replication. It also associates transiently with U6 and U4/U6 snRNPs during the recycling phase of the spliceosome cycle. This encoded protein is thought to be involved in the regulation of mRNA splicing. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白质是RNA结合核蛋白质是肿瘤排斥抗原。该抗原具有能够在癌症患者中诱导的HLA-A24限制性和肿瘤特异性细胞毒性T淋巴细胞的肿瘤抗原表位和可能对特异性免疫治疗是有用的。该基因产物被发现是HIV-1的基因表达和病毒复制的重要细胞因子。它还在剪接循环回收利用相U6和U4 / U6的snRNPs暂时关联。这个编码的蛋白质被认为是参与mRNA剪接的调节。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

SART3基因的碱基序列:[NCBI]
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SART3基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1054548       rs1063936       rs1160331       rs1160332       rs2072579       rs2072580       rs2111947       rs2111948       rs2287554       rs2287555       rs2287556       rs4964724       rs4964725       rs4964726       rs7302611       rs7967523       rs10778646      

SART3基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAGAGAATGAAGGCTGCAG
58
TAACGCTTTCTTCTCAGCC
57
TGGGAATATGACGAAGAGGAG
59
GTCATAGACGTTGATAGACAACTG
59
GACAGAAGGTTCTTTAGAAGATTGG
59
TTCATTCTCTGCTCATTGACAC
59
GTTACAGTCAGTACCTAGATCGA
59
GGGCAGTTTCTAATAGCGC
59
GTTACAGTCAGTACCTAGATCGA
59
GGGCAGTTTCTAATAGCGC
59
TTGACTGAAGAGCTCTGGC
60
AAGAGGTCATACACGTGCT
59
CATTCAGTTGATCTTTGAGCG
58
TCAGTTGTCGATCTGTAACG
58
AACCTTTGATTCACAGCTTGAG
60
TGTGGCCTCCATATCATAGAG
59
CGTGAAGGATTACATTTGTCCT
58
AACTTTCTCAAGGCCACCT
59
GTTTACATATGACCAAAGGACTCG
60
TGGACTTTCTCAAGCCGAG
60
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
MYC
SART3
Unknown

SART3基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SART3基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
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F8VV04 (UniProtKB)
IEA
GO:0003676
F8VV04 (UniProtKB)
IEA
GO:0006396
F8VV04 (UniProtKB)
IEA
GO:0006396
F8VVK9 (UniProtKB)
IEA
GO:0006396
F8VZM2 (UniProtKB)
IEA
GO:0006396
F8W667 (UniProtKB)
IEA
GO:0000166
H0YHU8 (UniProtKB)
IEA
GO:0003676
H0YHU8 (UniProtKB)
IEA
GO:0000166
Q15020 (UniProtKB)
IEA
GO:0000244
Q15020 (UniProtKB)
IDA
GO:0000244
Q15020 (UniProtKB)
IDA
GO:0000245
Q15020 (UniProtKB)
IBA
GO:0000387
Q15020 (UniProtKB)
IDA
GO:0000387
Q15020 (UniProtKB)
IDA
GO:0000398
Q15020 (UniProtKB)
IDA
GO:0000902
Q15020 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q15020 (UniProtKB)
IPI
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Q15020 (UniProtKB)
IPI
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Q15020 (UniProtKB)
IPI
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Q15020 (UniProtKB)
IPI
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IPI
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Q15020 (UniProtKB)
IDA
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GO:0006334
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Q15020 (UniProtKB)
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IDA
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Q15020 (UniProtKB)
IDA
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Q15020 (UniProtKB)
IDA
GO:0030621
Q15020 (UniProtKB)
IDA
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Q15020 (UniProtKB)
IDA
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Q15020 (UniProtKB)
IDA
GO:0042393
Q15020 (UniProtKB)
IDA
GO:0044822
Q15020 (UniProtKB)
IDA
GO:0044822
Q15020 (UniProtKB)
IDA
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IEA
GO:0071425
Q15020 (UniProtKB)
IEA
GO:1903586
Q15020 (UniProtKB)
IDA
GO:1990381
Q15020 (UniProtKB)
IPI
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Q15020 (UniProtKB)
IPI
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Q15020 (UniProtKB)
IDA
GO:0017070
Q15020 (UniProtKB)
IDA
GO:0030621
Q15020 (UniProtKB)
IDA
GO:0046540
Q15020 (UniProtKB)
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Q15020 (UniProtKB)
IDA
GO:0071001
Q15020 (UniProtKB)
IDA

可能调控 SART3基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
POROKERATOSIS, DISSEMINATED SUPERFICIAL ACTINIC, 1 0.240542884 2 0 BeFree_CTD_human_UNIPROT
Colorectal Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Multiple Myeloma 0.000814326 3 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000814326 3 0 BeFree
Malignant neoplasm of prostate 0.000542884 2 0 BeFree
Prostate carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Cervix carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Lymphoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of ovary 0.000271442 1 0 BeFree
Idiopathic Pulmonary Fibrosis 0.000271442 1 0 BeFree

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山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

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