SAGE1 (sarcoma antigen 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SAGE1
locus group:
protein-coding gene
location:
Xq26.3
gene_family:
alias symbol:
SAGE|CT14
alias name:
cancer/testis antigen 14
entrez id:
55511
ensembl gene id:
ENSG00000181433
ucsc gene id:
uc065bgl.1
refseq accession:
NM_018666
hgnc_id:
HGNC:30369
approved reserved:
2004-05-24

基因染色体位置

基因染色体位置

Xq26.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

This gene belongs to a class of genes that are activated in tumors. These genes are expressed in tumors of different histologic types but not in normal tissues, except for spermatogenic cells and, for some, placenta. The proteins encoded by these genes appear to be strictly tumor specific, and hence may be excellent sources of antigens for cancer immunotherapy. This gene is expressed in sarcomas. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因属于一类被在肿瘤中活化的基因。这些基因在不同组织学类型的肿瘤，但在正常组织中表达，除了精细胞，对于某些，胎盘。由这些基因编码的蛋白质似乎是严格肿瘤特异性，并且因此可以是抗原的癌症免疫治疗的最佳来源。该基因在肉瘤表示。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SAGE1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs782819557       rs782817789       rs782814819       rs782812888       rs782813018       rs782813478       rs782808769       rs782807114       rs782804430       rs782804440       rs782803561       rs782804177       rs782796308       rs782803509       rs782795238       rs782795703       rs782789530      

基因表达

基因表达

SAGE1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAAATGTTCTATCCGGGCT
58
TAATGGTAGCATACAGATCCCT
58
AGTACCAGGGATCAGTATGC
59
ATTATCGGATGCTGCTTGG
58
AGTACCAGGGATCAGTATGC
58
ATTATCGGATGCTGCTTGG
58
CAAATGTTCTATCCGGGCT
58
TAATGGTAGCATACAGATCCCT
58
GTCAACTGTTCTACCAGGAC
58
ACGGTAGCATACTGATCCC
59
GTCAACTGTTCTACCAGGAC
58
ACGGTAGCATACTGATCCC
58
TCAAATGTTCTATCCGGGCT
59
AATGGTAGCATACAGATCCCT
59
TCAAATGTTCTATCCGGGCT
59
AATGGTAGCATACAGATCCCT
59
TGTCAGCTGTTACACCAGAG
60
CGGTAGCATACTGATCCCTG
60
AGTCAACCAACTCCACCTG
59
TTCATCACTCCTCATTTGCTG
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SAGE1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SAGE1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005634
F5H2Z8 (UniProtKB)
IDA
GO:0005634
Q9NXZ1 (UniProtKB)
IDA
GO:0005654
Q9NXZ1 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SAGE1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Breast Carcinoma 0.001357209 5 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.001085767 4 0 BeFree
Glioblastoma 0.000814326 3 0 BeFree
Lung Neoplasms 0.000542884 2 0 BeFree
melanoma 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of stomach 0.000542884 2 0 BeFree
Tumor Progression 0.000542884 2 0 BeFree
Glioma 0.000542884 2 0 BeFree
Noninfiltrating Intraductal Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Squamous cell carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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