RUNX3 (RUNX family transcription factor 3)

symbol:
RUNX3
locus group:
protein-coding gene
location:
1p36.11
gene_family:
alias symbol:
AML2|PEBP2A3
alias name:
None
entrez id:
864
ensembl gene id:
ENSG00000020633
ucsc gene id:
uc001bjq.4
refseq accession:
NM_004350
hgnc_id:
HGNC:10473
approved reserved:
1994-11-02
1p36.11
基因染色体位置图

RUNX3(Runt-related transcription factor 3)属于RUNX转录因子家族,该家族包括RUNX1、RUNX2和RUNX3,它们均含有一个保守的Runt结构域(Runt domain),负责与DNA结合及与其他蛋白(如CBFβ)相互作用以调控基因表达。RUNX家族成员在发育、细胞分化及免疫调节中起核心作用,尤其在造血系统、骨骼形成和神经系统发育中至关重要。RUNX3主要表达于免疫细胞(如T细胞)、神经系统和上皮组织,其功能包括调控T细胞分化(如促进CD8+ T细胞发育)、抑制肿瘤发生(如通过激活TGF-β信号通路抑制胃癌和结直肠癌)以及参与神经元存活与轴突导向。突变或表观遗传沉默(如启动子甲基化)可导致RUNX3功能丧失,与多种癌症(如胃癌、乳腺癌)和免疫缺陷相关。过表达RUNX3可能增强抑癌作用但可能干扰正常细胞分化,而低表达则可能导致免疫失调或肿瘤易感性。RUNX3与疾病的关系还涉及炎症性肠病(IBD)和自身免疫疾病,因其调控免疫耐受。基因家族共性为通过Runt结构域结合DNA的"TAYGGT"序列,并依赖CBFβ稳定结构,共同调控细胞周期、凋亡和分化相关基因。专业术语解释:Runt结构域(DNA结合域)、表观遗传沉默(基因表达被化学修饰抑制)、TGF-β(转化生长因子-β,调控细胞生长的信号通路)。若术语翻译不统一,"表观遗传沉默"可标注为(epigenetic silencing)。

This gene encodes a member of the runt domain-containing family of transcription factors. A heterodimer of this protein and a beta subunit forms a complex that binds to the core DNA sequence 5'-PYGPYGGT-3' found in a number of enhancers and promoters, and can either activate or suppress transcription. It also interacts with other transcription factors. It functions as a tumor suppressor, and the gene is frequently deleted or transcriptionally silenced in cancer. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码转录因子的侏儒结构域的家族的一个成员。这种蛋白质和一个β亚基的异源二聚体形成结合在许多增强子和启动子的发现核心DNA序列5‘-PYGPYGGT-3‘的复合物,并且可以激活或抑制转录。它也与其它转录因子相互作用。它用作抑癌,并且该基因频繁删除或癌症转录沉默。已发现该基因编码不同亚型的多个抄本变形。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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RUNX3基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs876108       rs876109       rs906296       rs1005733       rs1005734       rs1005735       rs1006265       rs1065537       rs1293202       rs1293203       rs1395621       rs1507099       rs1848185       rs1848186       rs2008767       rs2135756       rs3116868      

RUNX3基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GCAATGACGAGAACTACTCC
59
AGGGTGAAACTCTTCCCTC
59
CAATGACGAGAACTACTCCG
58
AGGGTGAAACTCTTCCCTC
59
ATGACGAGAACTACTCCGC
59
AGGGTGAAACTCTTCCCTC
59
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
CBFB
RUNX3
Unknown
DNMT1
RUNX3
Unknown
EHMT2
RUNX3
Activation
EZH2
RUNX3
Repression
HDAC1
RUNX3
Activation
HDAC1
RUNX3
Repression
HDAC1
RUNX3
Unknown
RUNX3
CAPN10
Activation
RUNX3
CASP2
Activation
RUNX3
CASP3
Activation

RUNX3基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RUNX3基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000122
Q13761 (UniProtKB)
ISS
GO:0000790
Q13761 (UniProtKB)
ISS
GO:0000977
Q13761 (UniProtKB)
ISS
GO:0000981
Q13761 (UniProtKB)
ISS
GO:0000981
Q13761 (UniProtKB)
IBA
GO:0001503
Q13761 (UniProtKB)
IBA
GO:0002062
Q13761 (UniProtKB)
IBA
GO:0003700
Q13761 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
Q13761 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q13761 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q13761 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q13761 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q13761 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q13761 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q13761 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q13761 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q13761 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q13761 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q13761 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q13761 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q13761 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q13761 (UniProtKB)
IPI
GO:0005524
Q13761 (UniProtKB)
NAS
GO:0005634
Q13761 (UniProtKB)
IDA
GO:0005634
Q13761 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q13761 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q13761 (UniProtKB)
IDA
GO:0006355
Q13761 (UniProtKB)
NAS
GO:0006357
Q13761 (UniProtKB)
IBA
GO:0006366
Q13761 (UniProtKB)
TAS
GO:0006468
Q13761 (UniProtKB)
IDA
GO:0030097
Q13761 (UniProtKB)
IBA
GO:0045595
Q13761 (UniProtKB)
IBA
GO:0045786
Q13761 (UniProtKB)
ISS
GO:0045893
Q13761 (UniProtKB)
IDA
GO:0048935
Q13761 (UniProtKB)
TAS
GO:0050680
Q13761 (UniProtKB)
ISS
GO:0071559
Q13761 (UniProtKB)
IDA

可能调控 RUNX3基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Stomach Neoplasms 0.146876253 20 0 BeFree_CTD_human_GAD_LHGDN
Lung Neoplasms 0.131168843 6 0 BeFree_CTD_human_LHGDN
Esophageal Neoplasms 0.123538676 5 0 BeFree_CTD_human_LHGDN
Ankylosing spondylitis 0.123452799 4 5 BeFree_CTD_human_GAD
Leukemia, Myelocytic, Acute 0.123257302 13 0 BeFree_CTD_human
Celiac Disease 0.122367032 1 1 CTD_human_GAD
Adenocarcinoma 0.122171535 9 0 BeFree_CTD_human
Glioblastoma 0.120814326 3 0 BeFree_CTD_human
Psoriasis 0.12 1 0 CTD_human
Polycystic Ovary Syndrome 0.12 1 0 CTD_human

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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