RRBP1 (ribosome binding protein 1)

symbol:
RRBP1
locus group:
protein-coding gene
location:
20p12.1
gene_family:
alias symbol:
ES/130|hES|p180
alias name:
ribosomal receptor-binding protein…
entrez id:
6238
ensembl gene id:
ENSG00000125844
ucsc gene id:
uc002wpw.2
refseq accession:
NM_001042576
hgnc_id:
HGNC:10448
approved reserved:
1998-03-20
20p12.1
基因染色体位置图

RRBP1(核糖体结合蛋白1,英文全称Ribosome Binding Protein 1)是一种编码核糖体结合蛋白的基因,属于核糖体相关蛋白家族。该基因的主要功能是参与内质网(ER)与核糖体的结合,帮助新合成的蛋白质正确折叠和转运,对维持细胞蛋白质稳态至关重要。RRBP1的表达产物是一种跨膜蛋白,定位于内质网膜上,通过与核糖体和信号识别颗粒(SRP)相互作用,协调分泌蛋白和膜蛋白的翻译与转运过程。RRBP1的突变可能导致蛋白质折叠异常或转运障碍,进而引发内质网应激(ER stress),与多种疾病相关,如神经退行性疾病(如阿尔茨海默病)、癌症(如乳腺癌和结直肠癌)以及某些遗传性代谢紊乱。RRBP1过表达常见于某些恶性肿瘤中,可能通过促进癌细胞增殖、侵袭和转移来驱动肿瘤进展;而降低表达则可能影响正常细胞的蛋白质分泌功能,导致细胞功能障碍或凋亡。RRBP1属于核糖体结合蛋白家族,该家族成员普遍参与蛋白质合成和转运,具有保守的核糖体结合域和内质网定位信号。目前关于RRBP1的研究仍在深入,其具体调控机制和疾病关联需进一步探索。专业术语解释:内质网(ER)是细胞内的膜结构,负责蛋白质合成与修饰;核糖体是蛋白质合成的机器;信号识别颗粒(SRP)是一种指导蛋白质转运至内质网的复合物;内质网应激指内质网功能紊乱导致的细胞应激反应。

This gene encodes a ribosome-binding protein of the endoplasmic reticulum (ER) membrane. Studies suggest that this gene plays a role in ER proliferation, secretory pathways and secretory cell differentiation, and mediation of ER-microtubule interactions. Alternative splicing has been observed and protein isoforms are characterized by regions of N-terminal decapeptide and C-terminal heptad repeats. Splicing of the tandem repeats results in variations in ribosome-binding affinity and secretory function. The full-length nature of variants which differ in repeat length has not been determined. Pseudogenes of this gene have been identified on chromosomes 3 and 7, and RRBP1 has been excluded as a candidate gene in the cause of Alagille syndrome, the result of a mutation in a nearby gene on chromosome 20p12. [provided by RefSeq, Apr 2012]

该基因编码内质网(ER)膜的一个核糖体结合蛋白。研究表明,这种基因在ER增殖,分泌途径和分泌细胞的分化和ER - 微管相互作用的中介的作用。选择性剪接已经观察和蛋白同种型的N-末端十肽和C-末端七肽重复区域表征。串联的剪接重复在核糖体结合亲和力和分泌功能的变化的结果。这在重复长度不同变体的全长性质尚未确定。这个基因的假基因已被确定在染色体3和7,和RRBP1已被排除在Alagille综合征,上20p12染色体附近的基因的突变的结果的原因的候选基因。 [由RefSeq的,2012年4月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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RRBP1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs6599       rs8803       rs9768       rs11960       rs12230       rs13734       rs15977       rs745694       rs911345       rs911346       rs911347       rs911348       rs911349       rs911351       rs1051954       rs1052815       rs1052847      

RRBP1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTCTGTAGTGAATTCCATCCA
57
TCTGTATTTCTGCCCTCCT
58
AAAGTTCGGACCAGGTGAG
60
AGATTCTAGGAGAAGTTGCCTC
59
CCTCACAGCTGAAGGAGAG
59
GTCTTCAGAAGCTCCTGCA
59
CTGGTGGAGAAGTCAGAGG
59
GTAACTTGCTGTGCAGCTC
59
AAGAACAATGACCTCCGGG
60
ATCAGACAGAGCTGCTTCTC
60
CATCATTCAGGACACCTGG
58
GTTTCAGAATCGCCACAGG
59
AAGAACAATGACCTCCGGG
60
ATCAGACAGAGCTGCTTCTC
60
CCTCACAGCTGAAGGAGAG
60
GTCTTCAGAAGCTCCTGCA
60
AGCTCTGAGGCAGAAAGTG
60
TTGCTTTCCTTTCACCTGC
59
AAATACAGATGTGGCCCAG
58
CTTTGCTGACCTTGCTGAG
59
      尚未收录相关数据

RRBP1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RRBP1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0015031
A0A0A0MRV0 (UniProtKB)
IEA
GO:0030176
A0A0A0MRV0 (UniProtKB)
IEA
GO:0015031
A2A2S5 (UniProtKB)
IEA
GO:0030176
A2A2S5 (UniProtKB)
IEA
GO:0005783
F8W7S5 (UniProtKB)
IDA
GO:0001649
Q9P2E9 (UniProtKB)
IDA
GO:0004872
Q9P2E9 (UniProtKB)
TAS
GO:0005783
Q9P2E9 (UniProtKB)
IDA
GO:0005840
Q9P2E9 (UniProtKB)
TAS
GO:0006412
Q9P2E9 (UniProtKB)
TAS
GO:0015031
Q9P2E9 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
Q9P2E9 (UniProtKB)
IDA
GO:0030176
Q9P2E9 (UniProtKB)
IBA
GO:0044822
Q9P2E9 (UniProtKB)
IDA

可能调控 RRBP1基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Disseminated eosinophilic collagen disease 0.000271442 1 0 BeFree
Idiopathic Hypereosinophilic Syndrome 0.000271442 1 0 BeFree
Precancerous Conditions 0.000271442 1 0 BeFree
Hypereosinophilic syndrome 0.000271442 1 0 BeFree
Chronic eosinophilic leukemia 0.000271442 1 0 BeFree
Lymphoma 0.000271442 1 0 BeFree

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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